Nature communications · 2020
Multiplatform genomic profiling and magnetic resonance imaging identify mechanisms underlying intratumor heterogeneity in meningioma.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Magill Stephen T, Vasudevan Harish N, Seo Kyounghee, Villanueva-Meyer Javier E, Choudhury Abrar, John Liu S, Pekmezci Melike, Findakly Sarah, Hilz Stephanie, Lastella Sydney, Demaree Benjamin, Braunstein Steve E, Bush Nancy Ann Oberheim, Aghi Manish K, Theodosopoulos Philip V, Sneed Penny K, Abate Adam R, Berger Mitchel S, McDermott Michael W, Lim Daniel A, Ullian Erik M, Costello Joseph F, Raleigh David R
Аннотация
Meningiomas are the most common primary intracranial tumors, but the molecular drivers of meningioma tumorigenesis are poorly understood. We hypothesized that investigating intratumor heterogeneity in meningiomas would elucidate biologic drivers and reveal new targets for molecular therapy. To test this hypothesis, here we perform multiplatform molecular profiling of 86 spatially-distinct samples from 13 human meningiomas. Our data reveal that regional alterations in chromosome structure underlie clonal transcriptomic, epigenomic, and histopathologic signatures in meningioma. Stereotactic co-registration of sample coordinates to preoperative magnetic resonance images further suggest that high apparent diffusion coefficient (ADC) distinguishes meningioma regions with proliferating cells enriched for developmental gene expression programs. To understand the function of these genes in meningioma, we develop a human cerebral organoid model of meningioma and validate the high ADC marker genes CDH2 and PTPRZ1 as potential targets for meningioma therapy using live imaging, single cell RNA sequencing, CRISPR interference, and pharmacology.