Преобразование мультиомики в малопрогнозные биомаркеры для множественных миелом

Множественная миелома (ММ) характеризуется глубокой молекулярной гетерогенностью, однако в настоящее время стратификация риска основывается на цитогенетиках или одновидовых сигнатурах, которые зачастую не позволяют охватить межслойную нормативно-правовую сложность. Мы повторно проанализировали многомерный набор данных, объединяющий число копировальных, транскриптомных, протеомных и фосфортротеомных данных, чтобы расчленить, насколько распространенные геномные изменения водителя распространяются через молекулярный каскад. Осуществляемая под наблюдением классификация показала, что нижние слои, в частности протеомы и фосфопротеомы, классифицируют геномные явления более точно, чем первичные геномные или транскриптомные данные. Заманчиво, что только трансакционные элементы были достаточны для классификации, что указывает на то, что, хотя непосредственные дозировочные эффекты проявляются на уровне РНК, ответная реакция сети вниз по течению доминирует в протеомическом состоянии. Многомерный факторный анализ (МОФА2) выявил непрерывную латентную ось, которая предсказывает отсутствие прогресса и общее выживание независимо от R-ISS. Этот фактор зафиксировал ось нарастания (1q)/del(13q), модернизированную иммунной инфильтрацией и выражением NSD2, объединив различия во всех четырех режимах. Чтобы обеспечить клинический перевод, мы вычислили небольшие, однообразные прокси с использованием эластичной регрессии сетки. Лицензион RNA верно пересказал мультиомный фактор и подтвердил его независимо в опубликованных микроаррариях и группах RNAseq, демонстрируя мощную вероятностную полезность во всех периодах лечения. Эти выводы свидетельствуют о том, что многомерная интеграция открывает скрытые прогностические осей, замаскированные в ходе одномерных анализов, и что ограниченные прокси могут сократить разрыв между сложными открытиями и клинической реализацией.