Протеомическая и протеогеномическая идентификация целевых антигенов Т-клеток в множестве миеломы.

Множественная миелома (ММ) составляет примерно 12% всех гематологовых магнатов и остается неизлечимой, несмотря на терапевтические достижения. Нацеливание антигенов, связанных с опухолью (ТАА), и опухолейных неоантигенов, представленных на молекулах антигена лейкоцита человека (HLA) с помощью вакцинации или перенаправленных Т клеточного рецептора (TCR), предлагает многообещающую новую иммунотерапевтическую стратегию. Вместе с тем знания о целевых антигенах опухоли, особенно о неоантигенах, ограничены. Мы применили подход на основе масс-спектрометрии (MS) к первичным образцам MM (n = 8) и MM клеточным линиям (n = 3), объединив последовательность целых экспомов и RNA для всеобъемлющей характеристики MM иммунопептидома и систематического поиска ТАС и неонатигенов. Используя наш подход, мы обнаружили связанные с раком фосфоропептидные лиганды HLA, а также артериальные антигенные антигены (CTA) HLA peptides, некоторые из которых делятся между образцами опухоли. Протеогеномический анализ показал, что в основном персонифицированный иммуноглобулин (Ig), полученный в результате рекомбинации V(D)J и соматической гипермутации (SHM), который присутствовал во всех образцах. Трое пациентов показали, что в гипермутированном районе были сгруппированы родственные пептидные лиганды второго сорта. Кроме того, мы идентифицировали неорганизованные неоантигены как в первичных образцах MM, так и в линиях клеток. Примерно 30% созданных клеточной линией пестидов вызвали реакцию CD8+T-клеток в аллогенных здоровых донорских ПБДХВ. В отличие от этого, ни один из созданных пациентом неоантигенов не был иммуногенным в аутологовых ПБД или проникающих в опухоль лимфоцитов, что свидетельствует о серьезной иммунной дисфункции. В этом исследовании проводится первая протеогеномическая идентификация неоантигенов в ММ, расширяются наблюдения за представленными иг-неоантигенами от клеточной лимфомы до ММ и подчеркиваются как практически осуществимые антигены, так и барьеры для эффективной иммунной терапии на основе ТКР.