MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1016/j.ygeno.2020.09.061

Медицинская библиотека · Genomics · 2020

Genome analysis of 1-deoxynojirimycin (1-DNJ)-producing Bacillus velezensis K26 and distribution of Bacillus sp. harboring a 1-DNJ biosynthetic gene cluster.

Lee Hyunjin, Jung Dong-Hyun, Seo Dong-Ho, Chung Won-Hyong, Seo Myung-Ji

СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПеревод пока не подготовлен

Аннотация

1-Deoxynojirumycin (1-DNJ) is a representative iminosugar with α-glucosidase inhibition (AGI) activity. In this study, the full genome sequencing of 1-DNJ-producing Bacillus velezensis K26 was performed. The genome consists of a circular chromosome (4,047,350 bps) with two types of putative virulence factors, five antibiotic resistance genes, and seven secondary metabolite biosynthetic gene clusters. Genomic analysis of a wide range of Bacillus species revealed that a 1-DNJ biosynthetic gene cluster was commonly present in four Bacillus species (B. velezensis, B. pseudomycoides, B. amyloliquefaciens, and B. atrophaeus). In vitro experiments revealed that the increased mRNA expression levels of the three 1-DNJ biosynthetic genes were closely related to increased AGI activity. Genomic comparison and alignment of multiple gene sequences indicated the conservation of the 1-DNJ biosynthetic gene cluster in each Bacillus species. This genomic analysis of Bacillus species having a 1-DNJ biosynthetic gene cluster could provide a basis for further research on 1-DNJ-producing bacteria.

Для цитирования: Lee Hyunjin, Jung Dong-Hyun, Seo Dong-Ho, Chung Won-Hyong, Seo Myung-Ji. Genome analysis of 1-deoxynojirimycin (1-DNJ)-producing Bacillus velezensis K26 and distribution of Bacillus sp. harboring a 1-DNJ biosynthetic gene cluster.. Genomics. 2020. DOI: 10.1016/j.ygeno.2020.09.061.

Предметные рубрики MeSH

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.