FEMS microbiology letters · 2015
Genome sequence of a clinical isolate of dermatophyte, Trichophyton rubrum from India.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Latka Chitra, Dey Sanchita Sanchaya, Mahajan Siddharth, Prabu Ramachandira, Jangir Pramod Kumar, Gupta Chhavi, Das Shukla, Ramachandran Vishnampettai Ganapathysubramanian, Bhattacharya Sambit Nath, Pandey Rajesh, Sharma Rakesh, Ramachandran Srinivasan, Taneja Bhupesh
Аннотация
Trichophyton rubrum is one of the major causative agents of dermatophytosis in humans worldwide. We report the draft genome sequence of T. rubrum var. raubitschekii from Delhi, India, isolated from a patient presenting symptoms of onychomycosis. The total estimated genome size of the clinical isolate is 25.2 MB containing 8265 predicted protein-coding sequences, 91 tRNA and 15 rRNA genes. Sequence analysis of the secreted subtilases, one of the major virulence factors in dermatophytes, clusters them into three subfamilies with distinct sequence features. The genome sequence is a step in understanding diversity of dermatophytes worldwide and will aid in identification of virulence factors and dissecting mechanisms of pathogenesis among them.