STAR protocols · 2026
Protocol to quantify glioblastoma cell invasion and nuclear deformations in 3D hydrogels.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
van Bodegraven Emma J, Kesenci Yekta, Olivo-Marin Jean-Christophe, Boquet-Pujadas Aleix, Etienne-Manneville Sandrine
Аннотация
Here, we present a protocol to quantify 3D invasion and nuclear deformation from time-lapse imaging of U251 glioblastoma spheroids embedded in Matrigel. We describe steps for computing a time-resolved radial invasion index through epifluorescence imaging and extracting per-nucleus deformation from 3D+time data using spinning-disk confocal microscopy with an optical flow-based pipeline. This adaptable protocol links nuclear mechanics to invasion. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to van Bodegraven et al.1.