Journal of proteome research · 2020
Protein Biomarker Discovery for Methicillin-Sensitive, Heterogeneous Vancomycin-Intermediate and Vancomycin-Intermediate Staphylococcus aureus Strains Using Label-Free Data-Independent Acquisition Proteomics.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liu Yu-Ching, Lu Jang-Jih, Lin Lee-Chung, Lin Hsiao-Chuan, Chen Chao-Jung
Аннотация
Rapid identification of methicillin-sensitive Staphylococcus aureus (MSSA), heterogeneous vancomycin-intermediate S. aureus (hVISA), and vancomycin-intermediate S. aureus (VISA) is important for accurate treatment, timely intervention, and prevention of outbreaks. Here, 90 S. aureus isolates were analyzed for protein biomarker discovery, including MSSA, vancomycin-susceptible S. aureus (VSSA), hVISA, and VISA strains. Label-free data-independent acquisition proteomics was used to identify protein biomarkers that allow for discrimination among MSSA, hVISA, and VISA strains. There were 8786 nonredundant peptides identified, corresponding to 418 different annotated nonredundant proteins. Two VISA protein biomarkers, two hVISA protein biomarkers, and one MSSA protein biomarker with high sensitivities and specificities were discovered and verified. Data are available via MassIVE with identifier MSV000085776.