Nature biotechnology · 2023
High-plex protein and whole transcriptome co-mapping at cellular resolution with spatial CITE-seq.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liu Yang, DiStasio Marcello, Su Graham, Asashima Hiromitsu, Enninful Archibald, Qin Xiaoyu, Deng Yanxiang, Nam Jungmin, Gao Fu, Bordignon Pino, Cassano Marco, Tomayko Mary, Xu Mina, Halene Stephanie, Craft Joseph E, Hafler David, Fan Rong
Аннотация
In this study, we extended co-indexing of transcriptomes and epitopes (CITE) to the spatial dimension and demonstrated high-plex protein and whole transcriptome co-mapping. We profiled 189 proteins and whole transcriptome in multiple mouse tissue types with spatial CITE sequencing and then further applied the method to measure 273 proteins and transcriptome in human tissues, revealing spatially distinct germinal center reactions in tonsil and early immune activation in skin at the Coronavirus Disease 2019 mRNA vaccine injection site.