Cell systems · 2016
Systems Genetics Approach Identifies Gene Pathways and Adamts2 as Drivers of Isoproterenol-Induced Cardiac Hypertrophy and Cardiomyopathy in Mice.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rau Christoph D, Romay Milagros C, Tuteryan Mary, Wang Jessica J-C, Santolini Marc, Ren Shuxun, Karma Alain, Weiss James N, Wang Yibin, Lusis Aldons J
Аннотация
We previously reported a genetic analysis of heart failure traits in a population of inbred mouse strains treated with isoproterenol to mimic catecholamine-driven cardiac hypertrophy. Here, we apply a co-expression network algorithm, wMICA, to perform a systems-level analysis of left ventricular transcriptomes from these mice. We describe the features of the overall network but focus on a module identified in treated hearts that is strongly related to cardiac hypertrophy and pathological remodeling. Using the causal modeling algorithm NEO, we identified the gene Adamts2 as a putative regulator of this module and validated the predictive value of NEO using small interfering RNA-mediated knockdown in neonatal rat ventricular myocytes. Adamts2 silencing regulated the expression of the genes residing within the module and impaired isoproterenol-induced cellular hypertrophy. Our results provide a view of higher order interactions in heart failure with potential for diagnostic and therapeutic insights.