STAR protocols · 2026
Protocol optimization to process mouse colon samples for single-nuclei RNA sequencing using FLEX library preparation.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kim Jin-Hee, Long Annalyssa N, Xie Yumo, Carter Kelly T, Noehl-Tekorius Sophia R, Elz Anna E, Yu Ming
Аннотация
Single-nuclei RNA sequencing enables the interrogation of tissue microenvironments in clinical samples preserved by snap-freezing, where cell membrane damage precludes single-cell isolation, but nuclei remain intact for high-quality molecular profiling. Here, we present an optimized protocol to process mouse colon samples for single-nuclei RNA sequencing using FLEX library preparation. We describe steps for preparing and dissociating colon tissue, nuclei filtration, and fixation. We then detail procedures for Chromium Fixed RNA Profiling (Gene Expression Flex).