Nature metabolism · 2022
HypoMap-a unified single-cell gene expression atlas of the murine hypothalamus.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Steuernagel Lukas, Lam Brian Y H, Klemm Paul, Dowsett Georgina K C, Bauder Corinna A, Tadross John A, Hitschfeld Tamara Sotelo, Del Rio Martin Almudena, Chen Weiyi, de Solis Alain J, Fenselau Henning, Davidsen Peter, Cimino Irene, Kohnke Sara N, Rimmington Debra, Coll Anthony P, Beyer Andreas, Yeo Giles S H, Brüning Jens C
Аннотация
The hypothalamus plays a key role in coordinating fundamental body functions. Despite recent progress in single-cell technologies, a unified catalog and molecular characterization of the heterogeneous cell types and, specifically, neuronal subtypes in this brain region are still lacking. Here, we present an integrated reference atlas, 'HypoMap,' of the murine hypothalamus, consisting of 384,925 cells, with the ability to incorporate new additional experiments. We validate HypoMap by comparing data collected from Smart-Seq+Fluidigm C1 and bulk RNA sequencing of selected neuronal cell types with different degrees of cellular heterogeneity. Finally, via HypoMap, we identify classes of neurons expressing glucagon-like peptide-1 receptor (Glp1r) and prepronociceptin (Pnoc), and validate them using single-molecule in situ hybridization. Collectively, HypoMap provides a unified framework for the systematic functional annotation of murine hypothalamic cell types, and it can serve as an important platform to unravel the functional organization of hypothalamic neurocircuits and to identify druggable targets for treating metabolic disorders.