MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.5808/gi.21039

Медицинская библиотека · Genomics & informatics · 2021

Draft genome of Semisulcospira libertina, a species of freshwater snail.

Gim Jeong-An, Baek Kyung-Wan, Hah Young-Sool, Choo Ho Jin, Kim Ji-Seok, Yoo Jun-Il

СтатьяПеревод в очереди

Аннотация

Semisulcospira libertina, a species of freshwater snail, is widespread in East Asia. It is important as a food source. Additionally, it is a vector of clonorchiasis, paragonimiasis, metagonimiasis, and other parasites. Although S. libertina has ecological, commercial, and clinical importance, its whole-genome has not been reported yet. Here, we revealed the genome of S. libertina through de novo assembly. We assembled the whole-genome of S. libertina and determined its transcriptome for the first time using Illumina NovaSeq 6000 platform. According to the k-mer analysis, the genome size of S. libertina was estimated to be 3.04 Gb. Using RepeatMasker, a total of 53.68% of repeats were identified in the genome assembly. Genome data of S. libertina reported in this study will be useful for identification and conservation of S. libertina in East Asia.

Для цитирования: Gim Jeong-An, Baek Kyung-Wan, Hah Young-Sool, Choo Ho Jin, Kim Ji-Seok, Yoo Jun-Il. Draft genome of Semisulcospira libertina, a species of freshwater snail.. Genomics & informatics. 2021. DOI: 10.5808/gi.21039.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.