Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) · 2027
Improving Image Quality in 10× Visium Spatial Transcriptomics Using Vispro.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ma Huifang, Ji Zhicheng
Аннотация
10× Visium is a widely used spatial transcriptomics platform that enables joint profiling of gene expression and the spatial locations of cells. However, the histology images generated by the 10× Visium platform often contain technical artifacts, including fiducial markers and background noise, which degrade image quality. Here, we describe how a computational method, Vispro, can be applied to process and enhance these images. The resulting high-quality images lead to improved performance across a range of downstream analyses.