MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1016/j.isci.2026.115815

Медицинская библиотека · iScience · 2026

Density-adjusted analysis of cell interactions to decipher tissue landscape changes.

Siddiqui Misha, Hamidinekoo Azam, Tan Jennifer Y, Leke Renata, Zarrouki Bader, Trahearn Nick, Hagos Yeman Brhane, Sakr Chirine, Lampis Andrea, Bagnall Christopher, Pellegrini Giovanni, Castillo Simon P, Challis Benjamin, Yuan Yinyin, Bezzi Marco, Ling Stephanie

СтатьяПеревод пока не подготовлен

Аннотация

Cell-cell proximity influences tissue homeostasis and disease progression, yet robust quantification across varying cell abundances remains challenging. We introduce a Monte Carlo simulation framework using the G-function as a spatial randomness reference to detect proximity differences between case groups independent of cell count. Three metrics, G-area, G-difference, and G-ratio, were evaluated for summarizing G-function outputs, alongside established approaches such as the Morisita-Horn Index and likelihood ratio. G-area most accurately captured group-level proximity changes. To demonstrate generalizability, we validated G-area in two external multiplex imaging datasets from colorectal and prostate cancer. This framework provides a cell-count-robust method for spatial analysis, enabling more reliable detection of microenvironmental changes across diseases and imaging platforms.

Для цитирования: Siddiqui Misha, Hamidinekoo Azam, Tan Jennifer Y, Leke Renata, Zarrouki Bader, Trahearn Nick, Hagos Yeman Brhane, Sakr Chirine, Lampis Andrea, Bagnall Christopher, Pellegrini Giovanni, Castillo Simon P, Challis Benjamin, Yuan Yinyin, Bezzi Marco, Ling Stephanie. Density-adjusted analysis of cell interactions to decipher tissue landscape changes.. iScience. 2026. DOI: 10.1016/j.isci.2026.115815.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.