STAR protocols · 2023
An optimized protocol for isolation of hepatic leukocytes retrieved from murine and NASH liver biopsies.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bahrami Ehsan, Geiger Tobias, Steixner-Kumar Agnes A, Santacruz Diana, Viollet Coralie, Dick Alec, Roth Yvonne, Schlingeloff Patrycja, Schmidberger Julian, Haenle Mark, Kratzer Wolfgang, Kitt Kerstin, Neubauer Heike, Simon Eric, Krenkel Oliver, Werner Markus
Аннотация
Immune dysregulation and inflammation by hepatic-resident leukocytes is considered a key step in disease progression of non-alcoholic fatty liver disease and non-alcoholic steatohepatitis toward cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Here, we provide a protocol for isolation and characterization of liver-resident immune cells from fine-needle biopsies obtained from a rodent model and humans. We describe steps for isolating leukocytes, cell sorting, and RNA extraction and sequencing. We then detail procedures for low-input mRNA sequencing analyses.