MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1038/s41698-021-00164-5

Медицинская библиотека · NPJ precision oncology · 2021

Inflation of tumor mutation burden by tumor-only sequencing in under-represented groups.

Asmann Yan W, Parikh Kaushal, Bergsagel P Leif, Dong Haidong, Adjei Alex A, Borad Mitesh J, Mansfield Aaron S

СтатьяПеревод пока не подготовлен

Аннотация

With the recent FDA approval of tumor mutational burden-high (TMB-H) status as a biomarker for treatment with a PD-1 inhibitor regardless of tumor type, accurate assessment of patient-specific TMB is more critical now more than ever. Using paired tumor and germline exome sequencing data from 701 patients newly diagnosed with multiple myeloma, including 575 self-reported White patients and 126 self-reported Black patients, we observed that compared to the gold standard of filtering germline variants with patient-paired germline sequencing data, TMB estimates were significantly higher in both Black and White patients when using public databases for filtering non-somatic mutations; however, TMB was more significantly inflated in Black patients compared to White patients. TMB as a biomarker for patient selection to receive immune checkpoint inhibitors (ICIs) therapy without patient-paired germline sequencing may introduce racial bias due to the under-representation of minority groups in public databases.

Для цитирования: Asmann Yan W, Parikh Kaushal, Bergsagel P Leif, Dong Haidong, Adjei Alex A, Borad Mitesh J, Mansfield Aaron S. Inflation of tumor mutation burden by tumor-only sequencing in under-represented groups.. NPJ precision oncology. 2021. DOI: 10.1038/s41698-021-00164-5.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.