Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) · 2025
Image Analysis Routines for Quantification of Synaptic Density and Connectivity.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Della Santina Luca, Hoon Mrinalini
Аннотация
Fixed tissue analyses of synaptic density and connectivity rely on analyses of image stacks containing fluorescence signals. This chapter details image analysis routines that can be implemented to determine connectivity between labeled cell types and procedures for quantification of synaptic density across a tissue volume or specifically within a labeled cell of interest. The chapter details open-source software and practices that can be implemented for these analyses as well as considerations for validation of detected signals, estimation of background noise in images, and determination of non-specific detections.