Cancer research · 2009
Large-scale profiling of archival lymph nodes reveals pervasive remodeling of the follicular lymphoma methylome.
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Killian J Keith, Bilke Sven, Davis Sean, Walker Robert L, Killian M Scott, Jaeger Erich B, Chen Yidong, Hipp Jason, Pittaluga Stefania, Raffeld Mark, Cornelison Robert, Smith William I, Bibikova Marina, Fan Jian-Bing, Emmert-Buck Michael R, Jaffe Elaine S, Meltzer Paul S
Аннотация
Emerging technologies allow broad profiling of the cancer genome for differential DNA methylation relative to benign cells. Herein, bisulfite-modified DNA from lymph nodes with either reactive hyperplasia or follicular lymphoma (FL) were analyzed using a commercial C/UpG genotyping assay. Two hundred fifty-nine differentially methylated targets (DMT) distributed among 183 unique genes were identified in FL. Comparison of matched formalin-fixed, paraffin-embedded and frozen surgical pathology replicates showed the complete preservation of the cancer methylome among differently archived tissue specimens. Analysis of the DMT profile is consistent with a pervasive epigenomic remodeling process in FL that affects predominantly nonlymphoid genes.