STAR protocols · 2026
Protocol for isolating high-quality nuclei from FFPE pancreatic cancer sections and constructing sequencing libraries.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ning Huiheng, Zhou Wei, Chen Kang, Gao Qinhang, Pan Jieying, Chen Min-Min
Аннотация
Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues are archived resources for biomedical research but challenging for single-cell transcriptomic analysis. Here, we present a protocol for isolating high-quality nuclei from FFPE pancreatic cancer sections. We describe steps for deparaffinization, enzymatic digestion, nuclei purification, and library construction using the 10× Genomics Fixed RNA Profiling platform. This protocol enables transcriptomic profiling of archived clinical specimens at single-nucleus resolution. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Chen et al.1.