Nature methods · 2026
LoL-align: sensitive and fast probabilistic protein structure alignment.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reifenrath Lasse, van Kempen Michel, Kim Gyuri, Kim Soo Hyun, Radnezhad Mohammadreza, Gilchrist Cameron L M, Mirdita Milot, Steinegger Martin, Söding Johannes
Аннотация
The ubiquitous availability of protein structures permits replacing sequence alignment with more accurate and sensitive structure alignment algorithms. LoL-align maximizes a local log-odds score for proteins to be homologous, given their intra-protein Cα - Cα distances. Here we show that LoL-align is markedly more sensitive in detecting remote homologs than TM-align and Dali on single- and multidomain benchmarks and achieves better alignment quality at 5-20 × their speed. LoL-align is fully integrated into Foldseek.