Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) · 2027
Using BruUV-Seq to Identify Enhancer RNA Expression in Live Cells.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
McShane Ariel, Paulsen Michelle, Venkata Narayanan Ishwarya, Magnuson Brian, Bedi Karan, Ashaka Mario, Wilson Thomas E, Ljungman Mats
Аннотация
BruUV-seq is a nascent RNA sequencing technique that uses bromouridine to label RNA and UV light to suppress both transcription elongation and RNA degradation, enabling the enrichment and study of labile RNA species, such as enhancer RNAs (eRNAs), in live-cell culture models. Here, we describe both the BruUV-seq experimental method and the next-generation sequencing data analysis, which allow for the identification of eRNAs produced at active enhancer elements.