One of the most useful techniques for studying genetic variations in plants is single-nucleotide polymorphisms (SNPs), which are useful in developing molecular markers for genetic research. In this chapter, the development and validation of SNP markers using targeted resequencing and in silico analysis of genomic resources for plant genomic research and breeding are included. Key steps include genomic DNA isolation, whole-genome resequencing, raw read processing, reference-based alignment, SNP detection, and stringent filtering to identify high-confidence variants. The importance of cross-plat
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers have played a significant role in accelerating cotton (Gossypium spp.) improvement by enabling rapid genome-wide assessment of genetic variation without the requirement for prior sequence information. RAPD has been widely applied in cotton germplasm characterization, cultivar identification, hybrid confirmation, and the early development of molecular linkage maps. Its simplicity, low cost, and the ability to amplify multiple polymorphic loci in a single reaction made RAPD particularly valuable during the early phases of cotton molecular breeding.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular marker-based diversity assessment is essential for crop improvement strategies in faba bean (Vicia faba L.), a diploid grain legume with limited genomic resources relative to model species such as Medicago truncatula or major crops like soybean (Glycine max). ISSR markers provide a PCR-based, multilocus fingerprinting approach requiring no prior sequence information, making them particularly suitable for orphan crops. This protocol provides comprehensive, step-by-step procedures covering the complete analytical pipeline from genomic DNA isolation to statistical interpretation. This c
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mungbean (Vigna radiata L.) is a major pulse crop cultivated extensively across Asia and is considered an important model species among legumes because of its diploid genome and relatively small genome size. The availability of reliable, economical, and highly polymorphic molecular markers is critical for assessing genetic diversity, constructing linkage maps, and implementing functional genomics-based breeding programs. Among the available marker systems, simple sequence repeat (SSR) markers are highly polymorphic, abundant, co-dominant, and extensively used for allelic characterization acros
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The translation of genetic variation into breeding gain relies on an integrated and sequential pipeline comprising high-quality DNA extraction, precise locus amplification and sequencing, accurate variant discovery, conversion of polymorphisms into diagnostic markers, high-throughput genotyping, and systematic integration into crossing and selection programs. This chapter presents a comprehensive framework for the development and application of molecular markers for aroma improvement in rice, with broader relevance to yield and stress-resilience traits in Oryza sativa. Rice aroma, a premium gr
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-nucleotide polymorphisms (SNPs) are among the most stable and widely used molecular markers in plant genomics and breeding. Especially in cotton (Gossypium hirsutum L.), SNP markers play a critical role in identifying genetic variations associated with different development traits such as fiber length, strength, micronaire, and elongation. This chapter describes the workflow of SNP marker development in a comprehensive manner targeting fiber development in cotton. The process is initiated by high-quality genomic DNA isolation followed by sequencing carried out through high-throughput se
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medicinal plants have been used to heal people with thousands of diseases. Phytochemicals are the main reason for a plant being a medicinal plant. Compared to field-grown plants, in vitro-derived plantlets have high phytochemical production. In vitro-derived plantlets are also the most reliable method for producing healthy, disease-free medicinal plants of superior quality, with enhanced phytochemical properties. Due to the presence of phytochemical compounds such as phenolic compounds, flavonoids, tannins, and terpenoids, medicinal plants possess therapeutic properties. These therapeutic prop
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Holmium laser enucleation of the prostate (HoLEP) is an established treatment for benign prostatic obstruction, and some patients subsequently prove to have prostate cancer (1-3). Enucleation leaves fibrosis that displaces the anatomical landmarks relevant to radical prostatectomy (4, 5). We present a robot-assisted radical prostatectomy (RARP) performed after HoLEP.
MATERIALS AND METHODS: A 64-year-old man underwent HoLEP; biopsy subsequently showed adenocarcinoma of the right lobe, ISUP grade 3. PSA was 0.51 ng/mL; MRI demonstrated a 0.4 cm PI-RADS 4 lesion at the right mid-base. R
СтатьяКлинический случайVideo-Audio MediaПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sugarcane (Saccharum spp.) is an economically important crop cultivated worldwide for sugar and bioenergy production. However, its productivity is significantly affected by various pests and diseases, which lead to substantial yield and quality losses. Traditional breeding approaches for developing resistant varieties are often time-consuming and complicated due to the complex polyploid genome of sugarcane. In recent years, molecular marker technologies have provided powerful tools for the rapid identification and selection of desirable traits in crop improvement programs. Among the available
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-gal syndrome (AGS) is an IgE-mediated allergy to galactose-α-1,3-galactose (α-Gal), typically triggered by tick bites. Genetic factors, including human leucocyte antigen (HLA) class II polymorphisms and selected single nucleotide polymorphisms (SNPs) in immune and glycan-related genes, are hypothesized to modulate susceptibility and clinical expression. Here we provide a step-by-step protocol to genotype risk markers from ethylenediaminetetetraacetic acid (EDTA) whole blood sample, combining (i) manual DNA extraction (Qiagen), (ii) SNP genotyping by a real-time/quantitative PCR (qPCR) me
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zebrafish (Danio rerio) has emerged as a robust vertebrate model for studying immune and allergic disorders, including food allergies. The alpha-Gal syndrome (AGS) is a tick-borne allergy characterized by an IgE-mediated delayed hypersensitivity to the oligosaccharide galactose-α-1,3-galactose (α-Gal), which is present in tick saliva and mammalian-derived foods and drugs. This chapter describes the experimental procedures used to establish and analyze the validated zebrafish model for AGS. Adult zebrafish were intramuscularly injected with Ixodes ricinus tick saliva and maintained on a mammali
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Humanized mouse models are indispensable in vivo experimental platforms for investigating human-specific biological processes in a controlled and reproducible environment, serving as a preclinical link between basic research and application in translational research. Alpha-Gal syndrome (AGS) is one of the emerging pathologies that highlight the need for a murine system capable of mimicking the reproduction of key aspects of human immune and allergic responses. Humanized α1,3GalT-knockout (KO) mice have expanded research on immunological basis of the syndrome and advanced in preclinical researc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The alpha-Gal syndrome (AGS) is an allergic disease with IgE-mediated delayed hypersensitivity to the oligosaccharide galactose-α-1,3-galactose (α-Gal) present in tick saliva and mammalian-derived foods and drugs. The incidence of AGS is increasing worldwide and thus requires the identification of serum biomarkers and tick biomolecules for the development of preventive, treatment, and control interventions. In this chapter, we describe step-by-step methods for proteomics analysis of human serum samples for AGS-related biomarker identification and characterization, characterization of molecular
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The α-Gal syndrome (AGS) links tick bites with delayed anaphylaxis to mammalian meat consumption. Recent work in zebrafish shows that the Ixodes ricinus salivary metalloprotease (MET) and allergen-like p23 trigger AGS-like responses, whereas subsequent infection with the mycobacterial fish pathogen, Mycobacterium marinum, skews immunity towards a protective Th1 profile. Here we provide a step-by-step protocol to: (i) reproduce tick-induced allergy in adult zebrafish, (ii) superimpose water-borne mycobacterial infection, and (iii) quantify clinical, serological, and molecular outcomes. The meth
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Indirect basophil activation test (iBAT) is a flow cytometry-based assay in which basophils are first passively sensitized with patient-derived IgE and subsequently stimulated with the allergen of interest to assess activation markers on the cell surface. This method was implemented by using the human KU812 cell line to investigate basophil activation mechanisms triggered by tick-derived biomolecules. Unlike the traditional BAT, the iBAT approach avoids variability from non-responder patients and donor-dependent differences, providing a stable and reproducible in vitro model. KU812 cells w
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Functional profiling of host-associated microbiota is essential for elucidating its role in immune dysregulation, such as in allergic diseases. Predictive bioinformatics tools like PICRUSt2 (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States, version 2) enable the inference of microbial metabolic potential from 16 S rRNA gene amplicon data. This chapter describes the computational workflow for using PICRUSt2 to analyze allergy-associated microbiota. The protocol begins with a standardized amplicon sequence variant (ASV) table and its corresponding taxonomy and seq
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter describes the experimental methodology used to establish a rat model of oral food allergy. The final protocol has been optimized for the Wistar strain. The model mimics chronic oral allergen re-exposure and allows the study of effector-phase allergic responses. It encompasses all experimental stages, including preliminary procedures, intramuscular sensitization, the use of pro-type 2 immune response adjuvants, allergen re-sensitization, and the final oral challenge, using ovalbumin (OVA). Key outcomes include clinical parameters such as sign scoring, diarrhea classification, and b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studying the gut microbiota in α-gal murine models can help uncover host-microbiota-immune interactions. In this protocol, we present a comprehensive workflow for the analysis of gut microbiota in α-gal murine models. We describe the procedures for fecal sample collection, 16S rRNA gene sequencing, and construction of microbial co-occurrence networks.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter describes a standardized experimental protocol to induce and analyze galactose-α-1,3-galactose (α-Gal)-specific IgE responses in α-Gal-deficient (α1,3-galactosyltransferase knockout) mice. The absence of endogenous α-Gal in this model enables controlled sensitization to exogenous α-Gal-containing antigens from microbial, arthropod, and mammalian sources. The protocol integrates sequential oral exposure to α-Gal-expressing Escherichia coli O86:B7, capsule-based infestation with Ixodes ricinus nymphs, oral administration of porcine tissue homogenate, and subcutaneous injection of ti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Allergenicity is a multifactorial and context-dependent property that emerges from the interaction between intrinsic protein features and host immune mechanisms. Although regulatory frameworks rely primarily on sequence homology to known allergens, increasing numbers of novel and engineered proteins require more comprehensive computational strategies for preclinical assessment. This chapter describes a modular bioinformatic pipeline for the prediction and characterization of potential protein allergens. The workflow integrates FAO/WHO sequence-based criteria for regulatory compliance, structur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования