Sugarcane (Saccharum spp.) is an economically important crop cultivated worldwide for sugar and bioenergy production. However, its productivity is significantly affected by various pests and diseases, which lead to substantial yield and quality losses. Traditional breeding approaches for developing resistant varieties are often time-consuming and complicated due to the complex polyploid genome of sugarcane. In recent years, molecular marker technologies have provided powerful tools for the rapid identification and selection of desirable traits in crop improvement programs. Among the available
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-gal syndrome (AGS) is an IgE-mediated allergy to galactose-α-1,3-galactose (α-Gal), typically triggered by tick bites. Genetic factors, including human leucocyte antigen (HLA) class II polymorphisms and selected single nucleotide polymorphisms (SNPs) in immune and glycan-related genes, are hypothesized to modulate susceptibility and clinical expression. Here we provide a step-by-step protocol to genotype risk markers from ethylenediaminetetetraacetic acid (EDTA) whole blood sample, combining (i) manual DNA extraction (Qiagen), (ii) SNP genotyping by a real-time/quantitative PCR (qPCR) me
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zebrafish (Danio rerio) has emerged as a robust vertebrate model for studying immune and allergic disorders, including food allergies. The alpha-Gal syndrome (AGS) is a tick-borne allergy characterized by an IgE-mediated delayed hypersensitivity to the oligosaccharide galactose-α-1,3-galactose (α-Gal), which is present in tick saliva and mammalian-derived foods and drugs. This chapter describes the experimental procedures used to establish and analyze the validated zebrafish model for AGS. Adult zebrafish were intramuscularly injected with Ixodes ricinus tick saliva and maintained on a mammali
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Humanized mouse models are indispensable in vivo experimental platforms for investigating human-specific biological processes in a controlled and reproducible environment, serving as a preclinical link between basic research and application in translational research. Alpha-Gal syndrome (AGS) is one of the emerging pathologies that highlight the need for a murine system capable of mimicking the reproduction of key aspects of human immune and allergic responses. Humanized α1,3GalT-knockout (KO) mice have expanded research on immunological basis of the syndrome and advanced in preclinical researc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The α-Gal syndrome (AGS) links tick bites with delayed anaphylaxis to mammalian meat consumption. Recent work in zebrafish shows that the Ixodes ricinus salivary metalloprotease (MET) and allergen-like p23 trigger AGS-like responses, whereas subsequent infection with the mycobacterial fish pathogen, Mycobacterium marinum, skews immunity towards a protective Th1 profile. Here we provide a step-by-step protocol to: (i) reproduce tick-induced allergy in adult zebrafish, (ii) superimpose water-borne mycobacterial infection, and (iii) quantify clinical, serological, and molecular outcomes. The meth
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Functional profiling of host-associated microbiota is essential for elucidating its role in immune dysregulation, such as in allergic diseases. Predictive bioinformatics tools like PICRUSt2 (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States, version 2) enable the inference of microbial metabolic potential from 16 S rRNA gene amplicon data. This chapter describes the computational workflow for using PICRUSt2 to analyze allergy-associated microbiota. The protocol begins with a standardized amplicon sequence variant (ASV) table and its corresponding taxonomy and seq
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter describes the experimental methodology used to establish a rat model of oral food allergy. The final protocol has been optimized for the Wistar strain. The model mimics chronic oral allergen re-exposure and allows the study of effector-phase allergic responses. It encompasses all experimental stages, including preliminary procedures, intramuscular sensitization, the use of pro-type 2 immune response adjuvants, allergen re-sensitization, and the final oral challenge, using ovalbumin (OVA). Key outcomes include clinical parameters such as sign scoring, diarrhea classification, and b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studying the gut microbiota in α-gal murine models can help uncover host-microbiota-immune interactions. In this protocol, we present a comprehensive workflow for the analysis of gut microbiota in α-gal murine models. We describe the procedures for fecal sample collection, 16S rRNA gene sequencing, and construction of microbial co-occurrence networks.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter describes a standardized experimental protocol to induce and analyze galactose-α-1,3-galactose (α-Gal)-specific IgE responses in α-Gal-deficient (α1,3-galactosyltransferase knockout) mice. The absence of endogenous α-Gal in this model enables controlled sensitization to exogenous α-Gal-containing antigens from microbial, arthropod, and mammalian sources. The protocol integrates sequential oral exposure to α-Gal-expressing Escherichia coli O86:B7, capsule-based infestation with Ixodes ricinus nymphs, oral administration of porcine tissue homogenate, and subcutaneous injection of ti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Allergenicity is a multifactorial and context-dependent property that emerges from the interaction between intrinsic protein features and host immune mechanisms. Although regulatory frameworks rely primarily on sequence homology to known allergens, increasing numbers of novel and engineered proteins require more comprehensive computational strategies for preclinical assessment. This chapter describes a modular bioinformatic pipeline for the prediction and characterization of potential protein allergens. The workflow integrates FAO/WHO sequence-based criteria for regulatory compliance, structur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tick saliva contains a complex mixture of biologically active compounds that enable prolonged blood feeding by modulating host hemostasis, inflammation, and immune responses. In addition, saliva serves as a key interface for the transmission of tick-borne pathogens, with specific salivary molecules facilitating pathogen survival and host infection. Tick saliva may also contain glycosylated proteins bearing galactose-α-1,3-galactose (α-Gal), which have been implicated in the development of α-Gal allergy in humans, as well as neurotoxic components responsible for tick paralysis. Given the centra
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Subcutaneous murine xenograft models are one of the most commonly used in vivo experimental methods in the cancer research field. Due to the lack of syngenic animal models for Ewing sarcoma, subcutaneous murine xenograft models currently offer the simplest way to investigate antineoplastic effects of therapeutics or biological functions of target genes in vivo. In this chapter, we describe in detail a widely used procedure for subcutaneous injection in mice, focusing on the specific characteristics of Ewing sarcoma cell lines.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
By directly implanting patient tumor cells into mice in a relevant location, we can mimic both the biology and tumor microenvironment of the original tumor. Here, we describe the process of generating an orthotopic patient-derived xenograft model by injecting a single cell suspension of Ewing sarcoma cells into the femur of a recipient mouse.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orthotopic models are based on the implantation of tumor cells directly into the organ of origin, which allows interaction between the cells and the surrounding host tissues. Here, we describe a modified version of an orthotopic model that closely recapitulates the steps required for metastasis development in Ewing sarcoma: tumor cells are injected into the calf muscles of the mouse, and once the tumor reaches a certain volume, the muscles containing the tumor are surgically resected. This procedure involves a nonaggressive surgery of the muscle, which allows for the survival of the mouse duri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor models allowing for the in vivo investigation of molecular mechanisms driving tumor progression and metastasis are important to develop novel strategies for cancer treatment. Unfortunately, for Ewing sarcoma, no adequate genetic animal models are currently available, although there is progress in zebrafish. Nevertheless, mouse xenotransplantation models are the state-of-the-art to model Ewing sarcoma in vivo. Here, we describe an alternative Ewing sarcoma xenotransplantation model in embryonic and larval zebrafish. This zebrafish model offers live imaging and easy compound testing opport
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Regularly updated global estimates are needed to monitor progress in cervical cancer screening, a key pillar of WHO's strategy to eliminate cervical cancer. We aimed to update estimates of cervical cancer screening coverage in 194 WHO member states and eight associated countries and territories for 2022, including the first global assessment of human papillomavirus (HPV) test-based screening adoption and roll-out.
METHODS: In this review and synthetic analysis, we used an established method to estimate standardised cervical cancer screening coverage in 2022. We used programme and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella motility plays an essential role in environmental survival and virulence, enabling cells to access nutrients, colonize host tissues, evade host immune responses, and persist in diverse environments. These movements, driven by peritrichous flagella, allow bacteria to swim through liquids and swarm across surfaces, making motility a valuable phenotypic indicator in microbiological characterization. This chapter describes quantitative protocols for assessing swimming and swarming motility on semisolid agar media. Procedures include media preparation, culture standardization, bacterial
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella can form biofilms, which are structured microbial communities composed of cells that adhere irreversibly to surfaces or to other cells. The formation of Salmonella biofilms may enhance the bacterial resistance to drugs, environmental stress, and the host immune system. Crystal violet staining is one of the most classical and widely used methods for measuring biofilms in laboratories. Its principle is primarily based on the binding of crystal violet to various components within the biofilm. Here, we describe the crystal violet assay protocol to measure the formation of Salmonella bio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Outer membrane vesicles (OMVs) from different Gram-negative bacteria, including Salmonella spp., have appeared as potential acellular vaccine candidates for their role in host-pathogen interaction by delivering virulence factors and modulating immune response. Given this host-cell contact, it is crucial to assess their genotoxic effects to ensure safety as vaccine candidates. The Comet assay, a sensitive and effective method for detecting single-cell DNA strand breaks, offers an effective approach for evaluating such effects. This study explores the application of the Comet assay as a highly s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AA is a crucial fatty acid in pregnancy, especially for the growth and development of the fetus and its central nervous system (CNS). As already discussed in the previous chapters, AA regulates inflammation, immune response, and cell signaling. AA has a modulatory action on gene expression, serves as a mechanotransducer, and regulates cell membrane fluidity. By regulating cell membrane fluidity, AA modulates the expression and binding of several receptors located on the cell membrane. Eicosanoids derived from AA have both beneficial and harmful effects on pregnancy. For instance, (i) AA metabo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.