High-throughput sequencing of total RNA has permitted the detection of novel mycoviruses in fungi with different types of genomes, including mycoviruses with double-stranded RNA, single-stranded positive- or negative-stranded RNA, or single-stranded DNA genomes. However, in silico detection of mycoviruses is not always sufficient to guarantee their presence in sequenced samples, especially in the case of the discovery of unique mycoviruses, and additional analyses are required to validate in vivo the data obtained by bioinformatics analysis. This chapter provides comprehensive protocols for th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using Botrytis cinerea (ATCC 58025) as the material, genomic DNA was extracted using the SDS-CTAB method after liquid nitrogen freezing and extracted multiple times with organic reagents. Then the precipitate was washed with ethanol and dissolved in TE buffer. The cultured genomic DNA is high-yield, easy to extract, and has good purity, making it suitable for extracting from multiple samples at once. After experiments, the genomic DNA obtained by this method can be used for most basic molecular biology experiments such as PCR and DNA enzyme digestion.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV), an arthropod-borne alphavirus within the Togaviridae family, is transmitted primarily by Aedes aegypti and Aedes albopictus. The virus causes an acute febrile illness characterized by severe, often bilateral polyarthralgia, with potential progression to chronic musculoskeletal pain and rare systemic complications involving cardiovascular and neurological systems. CHIKV exhibits a spherical, enveloped virion (~70 nm) with T = 4 icosahedral symmetry, incorporating E1/E2 glycoprotein heterodimers that mediate receptor binding and membrane fusion. Its positive-sense RNA
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV) represents a significant global health threat due to its recent resurgence. This protocol highlights the use of capillary-modified visual loop-mediated isothermal amplification (LAMP) technology for the rapid detection of CHIKV. We employed Vero cells for virus propagation and utilized the MolPure Viral DNA/RNA Kit for nucleic acid extraction, successfully amplifying extracted viral RNA at 63°C for 25 min. The presence of CHIKV was indicated by a distinct yellowish-green color change, demonstrating the effectiveness and simplicity of this protocol. Our protocol unders
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV) is transmitted through the bite of Aedes mosquitoes, specifically A. aegypti and A. albopictus. CHIKV belongs to the alphavirus with a positive-sense ssRNA genome of 11-12 kb size. The virus has been reported from various geographical regions across the globe. Chikungunya fever is an acute febrile illness, which, if left untreated, may develop into chronic arthralgia that may persist for several months or acute encephalitis syndrome. Therefore, early diagnosis of CHIKV is crucial to initiate prompt supportive treatment. Laboratory diagnosis of CHIKV typically relies o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RT-qPCR is characterized by high sensitivity, strong specificity, excellent reproducibility, and operational simplicity, enabling rapid quantification of viral RNA within a short timeframe. The real-time PCR system relies upon the measurement of a fluorescent reporter during PCR, in which the amount of emitted fluorescence is directly proportional to the amount of the PCR product in a reaction. Here, we describe the use of TaqMan® probe-based one-tube Real-time reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) for the detection and quantification of the Chikungunya viru
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histopathological analysis of tissues infected with Chikungunya virus (CHIKV), including biopsy and autopsy specimens, can provide valuable insights into the pathogenesis of atypical and fatal cases. By examining tissue architecture and cellular alterations under the microscope, it is possible to identify patterns of injury, inflammation, and cellular degeneration. These morphological findings provide evidence of how the pathogen interacts with host cells and tissues. Moreover, immunohistochemistry may be performed in tissue sections for the detection of viral antigens. Importantly, this techn
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The processing of adult mosquitoes collected in the field for studies of natural infection with arboviruses of public health interest (genera: Flavivirus, Alphavirus, Orthobunyavirus) follows the assembly of homogenized mosquito pools and extraction of genetic material using commercial or manual techniques, and the detection of viral RNA by polymerase chain reaction (nested RT-PCR) [11]. This paper describes the procedures for capturing, taxonomic determination, obtaining genetic material, and molecular techniques for detecting alphaviruses.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arboviral diseases represent a major public health challenge, especially in tropical regions where environmental conditions may favor the proliferation and spread of mosquito vectors. Thus, early and accurate detection of chikungunya virus (CHIKV) in mosquito populations can be a valuable tool for effective surveillance of circulating variants and for identifying new viral introductions. Given the challenges of detecting arboviruses in field-captured mosquitoes, we describe an integrated workflow for CHIKV molecular detection and whole-genome sequencing. This protocol includes mosquito homogen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal stem cells (ISCs) are central to the maintenance and regeneration of the gut epithelium, supporting its rapid turnover and adaptive capacity. Recent advances, including the identification of LGR5+ stem cells, 3D in vitro organoid technology, and single-cell transcriptomics, have uncovered the remarkable heterogeneity and plasticity of ISCs and their niche. The ISC niche comprises dynamic interactions among epithelial, stromal, immune, and microbial components, enabling responses to injury and disease. Notably, both active and reserve stem cell pools, as well as progenitor and differ
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colonic inflammation induces profound alterations in the intestinal mucosa that are evident at both macroscopic and microscopic levels, including disruption of epithelial barrier integrity, crypt fission, and immune cell infiltration. Recent advances in single-cell and spatial RNA sequencing have greatly expanded our understanding of the cellular diversity of the colonic mucosa, enabling pathological features to be directly linked to underlying cellular and molecular mechanisms. This chapter demonstrates the application of single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analysis techniques to interroga
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Virus-like particles (VLPs) are self-assembling viral protein complexes that mimic native virions while lacking replicative and infectious capacity. By retaining efficient cellular entry and cargo protection, they overcome key limitations of viral vectors, including insertional mutagenesis and strong immunogenicity. Their ease of production, flexible cargo capacity, and tunable tropism make them highly versatile tools. Here, we describe a protocol for generating VSV-G-pseudotyped VLPs that deliver CRISPR/Cas9 RNPs and their functional validation in surrogate cell lines.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Electroporation-based delivery of CRISPR/Cas systems has emerged as a powerful and versatile approach for gene editing in primary human T cells, enabling efficient, transient, and nonviral modification while minimizing genomic integration risks. This chapter focuses on the principles and practical implementation of electroporation (nucleofection) for the delivery of Cas9 ribonucleoprotein (RNP) complexes into human T cells, highlighting critical parameters that influence editing efficiency, cell viability, and scalability for research and clinical applications. We provide a comprehensive proto
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arboviruses still represent a major challenge to public health in many parts of the world. Despite shared epidemiological characteristics, each arboviral disorder displays distinct cellular tropism and activation patterns, progressing to immunopathological outcomes that remain not fully elucidated. A deeper understanding of these processes requires methodologies capable of characterizing the often-complex cellular responses. In this context, flow cytometry emerges as a valuable tool, enabling the characterization of heterogeneous cell populations, the assessment of activation and proliferation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite a high level of conservation within its core genome, the Chlamydia genus comprises various species that exhibit diverse pathogenic profiles. Genetic engineering techniques employing shuttle vectors are crucial tools for elucidating the pathogenesis of these obligate intracellular bacteria. In recent years, the introduction of calcium chloride-mediated transformation methods has significantly advanced genetic manipulation techniques for Chlamydia trachomatis. However, the efficiency of transformation using shuttle vectors, as well as plasmid maintenance, varies not only between Chlamydi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia trachomatis (CT) causes genital tract infection in humans, but the clinical significance of C. trachomatis detection in the gastrointestinal (GI) tract is an area of active research. Chlamydia muridarum (CM) is a mouse-adapted species used to investigate chlamydial biology and pathogenicity in both the genital and gastrointestinal tracts. Since chlamydial colonization of different segments of the GI tract may lead to distinct consequences, quantifying chlamydial yields across these regions will facilitate understanding of chlamydial biology and pathogenicity. This chapter describes a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-resolution characterization of antigen-specific T cell responses is essential for understanding cellular immunity to Chlamydia trachomatis infection in humans. This chapter describes two complementary flow cytometry-based approaches for measuring human antigen-specific T cell responses: intracellular cytokine staining (ICS) and activation-induced marker (AIM) staining. Both assays enable single-cell-level analysis following antigen stimulation but differ in their readouts. ICS quantifies functional cytokine production in response to short- or long-term stimulation, whereas the AIM assay i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia trachomatis, an obligate intracellular pathogen responsible for trachoma and widespread urogenital infections, replicates exclusively within the confines of a membrane-bound vacuole known as the inclusion. This compartment shields the bacterium from host cellular immune detection; thus, clarifying how inclusion integrity is maintained and protected from vacuole-destabilizing host attacks may identify new therapeutic strategies. To enable such insights, we recently developed split-GFP-based microscopic reporters that can detect early forms of membrane damage and track individual bacte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent application of experimental and computational drug discovery workflows has identified hundreds of new molecules that display potent, and in some cases highly selective, activity against bacteria of the genus Chlamydia. The full value of these novel antichlamydial molecules, however, depends critically on our ability to determine their molecular targets and modes of action. A particularly powerful and widely applied strategy for identifying candidate targets involves selecting for bacterial mutants that have acquired resistance to a compound's inhibitory activity, followed by determi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell migration is a crucial biological process involved in immune responses, early stages of development, metastasis of cancer, and also wound healing. Therefore, it is important to study cell migration and the effects of compounds on this process to better understand conditions such as cancer metastasis and impaired wound healing. Wound Healing Assay, also known as Scratch Assay, is an exceedingly widespread, technically simple, and inexpensive in vitro method used to analyze collective migration of adherent cells, the procedure of which involves creating a wound in a confluent monolayer of c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования