Epigenetic regulation provides a dynamic and reversible layer of gene control that functions independently of changes in DNA sequence, primarily mediated by DNA methylation, histone modifications, and higher-order chromatin organization. Aberrant epigenetic states contribute to a wide range of human diseases. However, conventional epigenetic therapies based on small-molecule inhibitors lack locus specificity and often cause global chromatin disturbances. The emergence of programmable epigenetic editing technologies has transformed the field by enabling targeted rewriting of chromatin states at
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell-penetrating peptides (CPPs) provide a modular nonviral strategy for intracellular delivery of CRISPR/Cas9 components, particularly preassembled Cas9 ribonucleoprotein (RNP) complexes. This chapter summarizes key principles of CPP-mediated Cas9 RNP delivery, including noncovalent complexation and covalent CPP-Cas9 conjugation strategies. A representative protocol is provided for the preparation and evaluation of Cas9-K5 RNP, including in vitro uptake and reporter-editing assays, nucleofection-based functional controls, local intracranial delivery, immunofluorescence staining, and quantitat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lipid nanoparticles (LNPs) are a clinically validated nonviral platform for the delivery of CRISPR-associated components. Composed of ionizable lipids, phospholipids, cholesterol, and PEG-lipids, LNPs enable the efficient encapsulation, protection, and cytosolic delivery of therapeutic cargo such as DNA, RNA, or proteins. The clinical relevance of LNPs has already been shown by multiple FDA-approved therapies, including siRNA-based treatments and mRNA vaccines. Compared with viral vectors, LNPs offer several advantages, including reduced immunogenicity, absence of genomic integration, scalable
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR tools are revolutionizing the landscape of genetic therapies, with the potential to cure a range of previously untreatable diseases. Among all the available genome editing technologies, prime editing is an especially versatile tool that enables precise genetic modifications, including point mutations, insertions, and deletions, without inducing double-strand breaks or requiring a donor DNA template. Through structural modifications and the development of novel systems with additional functionalities, prime editing has expanded its applicability with improved precision, efficacy, and saf
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Base editing is a CRISPR variant approach that enables single-nucleotide conversions without generating double-strand breaks. Cytosine and adenine base editors mediate C•G to T•A and A•T to G•C transitions, respectively, by coupling a deaminase to a catalytically impaired Cas9, a modified nuclease that lacks DNA cleavage activity but retains DNA binding capability. By avoiding double-strand breaks, base editing limits reliance on unpredictable end-joining pathways and facilitates more precise outcomes. This chapter provides a practical protocol for base editing by electroporation in adherent a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intracellular calcium signaling plays a crucial role in intestinal epithelial function. In this chapter, we describe a method to monitor calcium dynamics in live pig small intestinal organoids using stably expressed genetically encoded FRET-based biosensor in combination with intensity-based ratiometric and fluorescence lifetime imaging (FLIM) microscopy readouts. The calcium biosensor Twitch-2B was introduced into organoids by electroporation. Despite the modest lifetime contrast, the biosensor provides a highly reliable ratiometric signal and is compatible with both conventional fluorescence
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human intestinal organoids (HIOs) recapitulate the architecture and cell diversity of intestinal epithelium, hence providing a system for modeling processes like regeneration and tumorigenesis. Here, we describe a detailed whole-mount immunostaining protocol for HIOs to visualize proliferative cell population. Briefly, this protocol includes preparation of HIOs, fixation and permeabilization of tissue, blocking of non-specific binding, antibody crosslinking, and visualization using a confocal microscope. Additionally, the protocol is broadly adaptable for investigating different antibodies, en
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We adapted the plaque reduction neutralization test (PRNT) to detect chikungunya virus (CHIKV) neutralizing antibodies in liver homogenates instead of serum. This approach enables serological investigation using tissues collected from animal carcasses as nonhuman primate ones, during arbovirus surveillance, expanding opportunities for CHIKV monitoring and strengthening epidemiological surveillance efforts.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histopathological analysis of tissues infected with Chikungunya virus (CHIKV), including biopsy and autopsy specimens, can provide valuable insights into the pathogenesis of atypical and fatal cases. By examining tissue architecture and cellular alterations under the microscope, it is possible to identify patterns of injury, inflammation, and cellular degeneration. These morphological findings provide evidence of how the pathogen interacts with host cells and tissues. Moreover, immunohistochemistry may be performed in tissue sections for the detection of viral antigens. Importantly, this techn
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We previously detailed a quantitative systems toxicology modeling framework for early prediction of chemotherapeutic-induced clinical intestinal adverse effects. The model describes stem and progenitor cell dynamics in the small intestinal epithelium and integrates epithelial-related processes, such as transcriptional profiles, citrulline kinetics, and the probability that the organism will have diarrhea. This protocol describes a step-by-step guide to the examples detailed in the original manuscript, namely 5-FU- and doxorubicin-induced intestinal toxicity.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
.: Nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) is a significant global health concern, impacting roughly 25% of people and leading to chronic liver conditions. It involves excess fat accumulation in the liver without significant alcohol intake and can develop into nonalcoholic steatohepatitis (NASH), fibrosis, or cirrhosis. While liver biopsy remains the gold standard for diagnosis, its invasive nature and associated risks restrict its routine use. Noninvasive biomarkers, such as serum ALT, AST, and various composite scores, are available; however, their clinical usefulness is often limited by va
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal stem cells (ISCs) are central to the maintenance and regeneration of the gut epithelium, supporting its rapid turnover and adaptive capacity. Recent advances, including the identification of LGR5+ stem cells, 3D in vitro organoid technology, and single-cell transcriptomics, have uncovered the remarkable heterogeneity and plasticity of ISCs and their niche. The ISC niche comprises dynamic interactions among epithelial, stromal, immune, and microbial components, enabling responses to injury and disease. Notably, both active and reserve stem cell pools, as well as progenitor and differ
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) has revolutionized the ability to resolve cellular heterogeneity within complex tissues, enabling the identification of discrete cell states. Here, we present an in silico analytical pipeline designed to characterize intestinal stem cells (ISC), transit-amplifying (TA) progenitors, and BEST4⁺ enterocyte precursors from human scRNA-seq datasets, with a focus on inflammatory contexts such as inflammatory bowel disease (IBD). The pipeline integrates dataset acquisition, quality control, normalization, dimensionality reduction, unsupervised clustering, and ce
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colonic inflammation induces profound alterations in the intestinal mucosa that are evident at both macroscopic and microscopic levels, including disruption of epithelial barrier integrity, crypt fission, and immune cell infiltration. Recent advances in single-cell and spatial RNA sequencing have greatly expanded our understanding of the cellular diversity of the colonic mucosa, enabling pathological features to be directly linked to underlying cellular and molecular mechanisms. This chapter demonstrates the application of single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analysis techniques to interroga
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intestinal epithelium is maintained by stem cells at the crypt base, however, acute or chronic inflammation can severely disrupt stem cell function and tissue homeostasis. To characterize mucosal inflammation and tissue damage, we evaluated time-course gene expression changes using a dextran sulfate sodium (DSS)-induced mouse model of colitis. By applying normalization, Z-score transformation, and spline curve modeling, we trace the temporal expression dynamics of key intestinal genes. This computational approach offer insights into the molecular responses during inflammation and may help
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Digital spatial profiling (DSP) facilitates RNA sequencing (RNA-seq) of small populations of cells, specifically ~20 pyramidal neurons in postmortem formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) human brain tissue. This approach enables precise expression profiling via RNA-seq data linked to spatially characterized samples utilizing tissue-bound probes. We present a comprehensive protocol for manual slide preparation using the GeoMx DSP system as preliminary steps to spatial characterization of lamina-specific pyramidal neurons in human postmortem Brodmann area 9 (BA9) frontal cortex brain tissue.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Metoidioplasty is used in transmasculine gender-affirming surgery; however, limited neophallus length and girth remain significant challenges (1-4). We describe a combined technique using Total Corpora Mobilization (TCM) for elongation and a Martius flap for girth enhancement (5-9).
MATERIALS AND METHODS: Fifteen transgender men underwent first-stage metoidioplasty with TCM and Martius flap between 2023 and 2026. The vestibular plate and urethra were mobilized, followed by circumferential clitoral degloving and suspensory ligament division. A pubic periosteal incision was made, and s
СтатьяVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arboviruses still represent a major challenge to public health in many parts of the world. Despite shared epidemiological characteristics, each arboviral disorder displays distinct cellular tropism and activation patterns, progressing to immunopathological outcomes that remain not fully elucidated. A deeper understanding of these processes requires methodologies capable of characterizing the often-complex cellular responses. In this context, flow cytometry emerges as a valuable tool, enabling the characterization of heterogeneous cell populations, the assessment of activation and proliferation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clinical success of CRISPR-based interventions depends primarily on the efficient delivery of editing components into target cells. While base and prime editing have refined genomic precision, achieving therapeutic efficacy requires specialized vehicles that can navigate systemic circulation, escape endosomes, and ensure cell-specific entry. Delivery platforms are traditionally categorized into viral and nonviral systems. Viral vectors, namely adeno-associated vectors (AAV), lentiviral vectors, and adenoviral vectors, employ evolved mechanisms to achieve high transduction efficiency and pr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia trachomatis (CT) causes genital tract infection in humans, but the clinical significance of C. trachomatis detection in the gastrointestinal (GI) tract is an area of active research. Chlamydia muridarum (CM) is a mouse-adapted species used to investigate chlamydial biology and pathogenicity in both the genital and gastrointestinal tracts. Since chlamydial colonization of different segments of the GI tract may lead to distinct consequences, quantifying chlamydial yields across these regions will facilitate understanding of chlamydial biology and pathogenicity. This chapter describes a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.