Despite abundant literature on pathogenicity and virulence of the opportunistic pathogen Escherichia coli, much less is known about its ecological and evolutionary dynamics as a commensal. Based on two detailed longitudinal datasets on the gut microbiota of healthy adults followed for months to years in France and the USA, we identified a robust trade-off between the ability to establish in a new host (colonization) and to remain in the host (residence). Major E. coli lineages (phylogroups or subgroups) exhibited similar fitness but diverse strategies, from strong colonisers residing few days
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Urinary tract infection is one of the most prevalent forms of bacterial infection, and prompt and efficient identification of pathogenic bacteria plays a pivotal role in the management of urinary tract infections. In this study, we propose a novel approach utilizing aptamer-functionalized graphene quantum dots integrated with an artificial intelligence detection system (AG-AI detection system) for rapid and highly sensitive detection of Escherichia coli (E. coli).
METHODS: Firstly, graphene quantum dots were modified with the aptamer that can specifically recognize and bind to E.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urinary tract infections (UTIs) are one of the most common infectious diseases worldwide, predominantly affecting women due to anatomical factors. Among UTIs, emphysematous cystitis (EC) is a rare but clinically significant entity characterized by gas presence in the bladder wall or lumen, often caused by gram-negative bacteria like Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae. Diagnosis is challenging due to nonspecific symptoms such as dysuria, abdominal pain, and occasionally pneumaturia, with computed tomography being the diagnostic method of choice. We report the case of a 65-year-old male
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli (E. coli) is a rod-shaped gram-negative bacterium that includes the diarrheagenic strains, an identical group of intestinal pathogens.E. coli diarrhea is transmitted through the feco-oral route, through contaminated food and water. Enteropathogenic E. coli (EPEC) is one of the leading causes of diarrhea in the pediatric age group in developing and developed countries. Depending on the absence or presence of E. coli adherence factor plasmids, they are classified as typical or atypical isolates. The distinguishing feature of EPEC's pathology is the attaching and effacing lesions
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The type VI secretion system (T6SS) is a versatile nanomachine that injects effectors into target cells, playing a role in bacterial competition and virulence. While widespread in Gram-negative bacteria, T6SS prevalence varies across species and strains, and its distribution in Escherichia coli remains underexplored despite it being an important intestinal (IPEC) and extraintestinal (ExPEC) pathogen. Here, we examined the prevalence of T6SS subclasses (T6SSi) across 131,610 E. coli genomes, which we annotated for clinical relevance. T6SS genes were identified while focusing on the three subcla
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global rise of antimicrobial resistance is a major public health threat, with Escherichia coli facilitating the spread of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) genes like blaCTX-M, which confer resistance to third-generation cephalosporins (3GCs). This study examines the impact of 3GC treatment on resistant E. coli clones and horizontal gene transfer (HGT) of ESBL genes in broiler chickens in Quito, Ecuador. Fifteen-day-old Ross broilers were divided into three groups: oral ceftriaxone (100 mg/kg), parenteral ceftriaxone (100 mg/kg intramuscular), and control (no treatment). The study in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli, a significant zoonotic pathogen, continuously evolves to produce hybrid strains with diverse pathogenic characteristics, threatening public health. These hybrid strains are capable of causing multiple diseases across various tissues within a single host or among genetically diverse hosts. They have been reported to exhibit heightened virulence, enhanced infectiousness, and increased resistance to environmental clearance. Here, we identified a hybrid aEPEC/ExPEC isolate, PE164, from the bloody stool of a piglet with severe diarrhoea, which exhibited both intestinal and extrain
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel disease (IBD), encompassing Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), is characterized by chronic gastrointestinal inflammation, leading to unpredictable flares and substantial morbidity. Gastrointestinal polymerase chain reaction (GI-PCR) testing has emerged as a widely used diagnostic tool to identify enteric pathogens during IBD exacerbations. It is a novel, quick and sensitive diagnostic test to detect Clostridioides difficile infection (CDI), as well as other enteric pathogens. However, the clinical significance of non-C. difficile pathogens detected by GI-PCR r
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Diarrheal disease caused by Gram-negative enteric pathogens, such as enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC), Vibrio cholerae, Shigella spp., and Salmonella spp., is a leading cause of morbidity and mortality of children, especially in low resource nations. While progress has been made in reducing this burden, there remains a need to develop effective therapies. Recently, we determined the structure of Rns, a member of the AraC/XylS family that regulates the expression of pili and other virulence factors in ETEC. The structure revealed decanoic acid bound between the N- and C-termi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance represents a significant threat to global public health, and poultry production is a critical sector within this context. Since the use of antimicrobials in poultry farming can promote the selection of resistant bacterial strains, the search for effective alternatives is essential. Thymol and carvacrol, two aromatic monoterpenes, as well as biogenic silver nanoparticles (bio-AgNP) have antimicrobial potential. Therefore, the aim of this study was to evaluate the action of thymol, carvacrol, and bio-AgNP against multidrug-resistant (MDR) Escherichia coli strains with vi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) pose a critical threat in intensive care units (ICUs) due to rapid transmission potential and limited treatment options. The study aimed to determine the incidence of intestinal CRE colonization among ICU patients, characterize the isolates phenotypically and genotypically and identify associated risk factors. This cross-sectional study was conducted in a tertiary care hospital in North India and included 236 ICU patients. Clinical, demographic, lifestyle, and dietary data were collected through standardizedv questionnaires and medical records. CRE i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prevailing dogma is that enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) use plasmid-borne colonization factors (CFs) to adhere to the intestinal epithelium, where the organisms proliferate and produce their diarrhea-causing virulence factors, the heat-stable (ST) and/or heat-labile (LT) enterotoxins. However, vaccines that target major CF antigens fail to induce complete protective immunity, indicating that ETEC may also use other antigens to colonize the small intestines. We previously demonstrated that ST intoxication limits magnesium bioavailability in the intestinal lumen, but the role of mag
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus (SGG) is a bacterial pathogen implicated in bacteremia and endocarditis and is often associated with colon tumors in elderly individuals. The development of colorectal cancer (CRC) has been linked to intestinal dysbiosis, characterized by increased proportions of SGG and other intestinal microbes. In this study, we present the complete nucleotide sequence of five novel clinical isolates of SGG associated with colorectal cancer, revealing unexpected genetic diversity. Sequencing an additional 30 SGG clinical isolates provided a more comprehensive d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of non-antibiotic agents to control avian colibacillosis has become urgent work. Probiotics Enterococcus faecium strains are promising antibiotic alternatives to combat pathogen infection. This study investigated the protective efficacy and action mechanism of dietary probiotic Enterococcus faecium NCIMB 11181 (E. faecium 11181) supplementation on broilers infected with avian pathogenic Escherichia coli (APEC) O78 by measuring immune functions and intestinal microbiota. A total of 120 one-day-old male Arbor Acres broiler chicks were randomly assigned to a 2 × 2 factorial arrang
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emphysematous cystitis (EC) is a rare, potentially life-threatening urinary tract infection characterized by gas formation within the bladder wall and lumen, typically associated with diabetes, immunosuppression, or advanced age. We present the case of a 72-year-old woman with systemic sclerosis and hypothyroidism, who was admitted for an infected distal limb wound following femoropopliteal bypass. During hospitalization, she developed emphysematous cystitis accompanied by radiological features of intestinal pseudo-obstruction. Prompt diagnosis, conservative treatment with bladder catheterizat
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction. The distribution of micro-organisms in healthy organisms remains a subject of debate. Emerging evidence revealed the colonization of microbial communities in multiple anatomical sites previously considered sterile under homeostatic conditions. However, the mechanistic relationship between compromised intestinal epithelial barrier integrity and subsequent translocation of gut-resident bacteria into systemic circulation has yet to be comprehensively elucidated.Hypothesis/Gap Statement. Under intestinal leakage, gut micro-organisms can break through the intestinal barrier and then t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of antimicrobial resistance (AMR) Escherichia coli in poultry farming is a growing global public health concern, particularly in Bangladesh, where the use of antibiotics remains largely unregulated. This study aimed to determine the prevalence and AMR patterns of E. coli isolated from broiler chickens in Sylhet district of Bangladesh and to investigate the network of coexisting resistance traits among the isolates. A total of 130 samples (44 cloacal, 46 faecal, 21 liver and 19 intestinal) were collected from live and dead broiler chickens in the Sylhet district of Bangladesh from
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study was conducted to assess the effects of a postbiotic, Saccharomyces cerevisiae fermentation product (SCFP) and a commercial phytogenic feed additive (PFA) as alternative to antibiotic growth promoter(AGP) on growth performance, gut microbiota, intestinal morphology, and immune response of commercial broiler chickens at a Food and Agriculture Organization (FAO) classified sector 3 commercial poultry farm. One-day-old mixed sex Vencobb 430 Y chicks (n=4800) were randomly divided into four dietary treatment groups for 35 days experimentation encompassingT1 (positive control, PC) basal di
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Avian colibacillosis caused by Escherichia coli O78 (E. coli O78) compromises poultry health and performance. Medium-chain fatty acids (MCFAs) exhibit antimicrobial and immunomodulatory properties. This study explored the effects of dietary MCFAs on growth performance, intestinal immune function, and microbiota composition in broilers under E. coli O78 challenge. A total of 312 one-day-old male Arbor Acres broilers were randomly assigned to three groups (8 replicates × 13 birds): negative control (NC), E. coli O78-challenged (EC), and E. coli O78-challenged supplemented with 700 mg/kg MCFAs (E
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The guts of animals and humans harbor diverse microbial communities that are regularly exposed to bacteria originating from food, water, and their surroundings. Species such as Escherichia coli are adept at colonizing multiple hosts, along with surviving in the environment. By encoding pathogenic traits and transmissible forms of antimicrobial resistance (AMR), E. coli can also pose a zoonotic risk. Our understanding of the factors that govern host residency is limited. Here, we used a chicken cecal fermentation model to study survival and the AMR transfer potential of 17 host-associated exten
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования