OBJECTIVES: To determine the prevalence, trends, and potential nosocomial transmission events of the hidden reservoir of rectal carriage of extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacterales (ESBL-E).
METHODS: From 2013 to 2022, yearly point prevalence surveys were conducted in a large Dutch teaching hospital. On the day of the survey, all admitted patients were screened for ESBL-E rectal carriage using peri-anal swabs and a consistent and sensitive selective culturing method. All Enterobacterales phenotypically suspected of ESBL production were analysed using whole genome sequencing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli is a frequent pathogen isolated from bloodstream infections. This study aimed to characterize the genetic features of EC092, an E. coli strain isolated from bacteremia that harbors enteroaggregative E. coli (EAEC) genetic markers, indicating its hybrid pathogenic potential. Whole-genome sequencing showed that EC092 belongs to phylogroup B1, ST278, and serotype O165:H4. Genes encoding virulence factors such as fimbriae, toxins, iron-uptake systems, autotransporter proteins (Pet, Pic, Sat, and SepA), and secretion systems were detected, as well as EAEC virulence genes (aggR, aat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) cause hundreds of millions of cases of infectious diarrhea annually, predominantly in children from low-middle income regions. Notably, in children, as well as volunteers challenged with ETEC, diarrheal severity is significantly increased in blood group A (bgA) individuals. EtpA, is a secreted glycoprotein adhesin that functions as a blood group A lectin to promote critical interactions between ETEC and blood group A glycans on intestinal epithelia for effective bacterial adhesion and toxin delivery. EtpA is highly immunogenic resulting in robust antibod
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Environmental Enteric Dysfunction (EED) is an acquired disorder of asymptomatic altered gut function, the etiology of which is unknown. EED is postulated to be a major contributor to growth faltering in early childhood in regions where early-life enteropathogenic carriage is prevalent. Few studies have examined the critical organ (the upper small bowel) with enteropathogens in the evolution of small bowel disease.
OBJECTIVES: The objective of this study was to determine if fecal enteropathogenic detection predicts subsequent EED histology.
METHODS: Fecal samples were obtained fro
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colistin, also known as polymyxin E, is a member of the polymyxin group of antibiotics. It is approved in Europe to treat enteric infections caused by Gram-negative bacteria, such as Escherichia coli, in poultry, although the similarity of infections between species make it likely used off-label in geese as well.This study investigated the pharmacokinetics and tissue residues of colistin in geese through in vivo experiments. The study involved longitudinal open studies on 16 healthy adult male geese, divided into three phases separated by one-month washout period. Geese were administered colis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) are major foodborne pathogens that result in thousands of hospitalizations each year in the United States. Cattle, the natural reservoir, harbor STEC asymptomatically at the recto-anal junction (RAJ). The molecular mechanisms that allow STEC and non-STEC E. coli to adhere to the RAJ are not fully understood, in part because most adherence studies utilize human cell culture models. To identify a set of bovine-specific E. coli adherence factors, we used the primary RAJ squamous epithelial (RSE) cell-adherence assay to coculture RSE cells
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gastrointestinal and respiratory systems are closely linked in different ways, including from the embryological, anatomical, cellular, and physiological angles. The highest number (and various types) of microorganisms live in the large intestine/colon, and constitute the normal microbiota in healthy people. Adverse alterations of the microbiota or dysbiosis can lead to chronic inflammation. If this detrimental condition persists, a sequence of pathological events can occur, such as inflammatory bowel disease, dysplasia or premalignant changes, and finally, cancer. One of the most commonly
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) is a severe gastrointestinal cancer and a leading cause of cancer-related deaths in Ghana. The potential role of gut Enterobacteriaceae in the increasing incidence of CRC in Ghana is yet to be thoroughly investigated. In this study, Enterobacteriaceae from CRC patients and healthy control participants were analyzed by whole genome sequencing to identify genomic features that are associated with CRC. Socio-demographic data showed a significant association between age and alcohol consumption and CRC. Escherichia coli was the most abundant Enterobacteriaceae isolated from
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver-expressed antimicrobial peptide-2 (LEAP-2) is a cysteine-rich peptide that plays a crucial role in the innate immune system of fish. To investigate the molecular function of LEAP-2 from olive flounder, Paralichthys olivaceus, we cloned the gene encoding LEAP-2 using PCR and expressed it in Escherichia coli. Analysis of LEAP-2 expression revealed predominant transcripts in the liver and lower levels in the intestine of olive flounder, whereas their expression levels in the liver and head kidney increased, during the initial stage of infection with the aquapathogenic bacterium Edwardsiella
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the commercial swine farm setting, the postweaning period is a critical window during which piglets are highly susceptible to infection and enterotoxigenic E. coli (ETEC)-associated diarrhea. Short-chain fatty acids and their glycerides are compounds that may influence intestinal health; however, valerate is one that has not been well-characterized for its role as a dietary supplement. Therefore, the major objective of this experiment was to investigate two forms of valerate glycerides on diarrhea, intestinal physiology, and systemic immunity of weaned pigs experimentally infected with ETEC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae have become widely prevalent globally because of antibiotic misuse and the spread of drug-resistant plasmids, where carbapenem-resistant Escherichia coli (CREC) is one of the most common and prevalent pathogens. Furthermore, E. coli has been identified as a member of normal gut flora and does not cause disease under normal circumstances. However, certain strains of E. coli, due to the expression of virulence genes, can cause severe intestinal and extra-intestinal infections. Therefore, clinically, drug resistance and pathogenic E. coli strains are signif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli is a Gram-negative bacterium and part of the intestinal microbiota. However, it can cause various diarrhoeal illnesses, i.e., traveller's diarrhoea, dysentery, and extraintestinal infections when the bacteria are translocated from the intestine to other organs, such as urinary tract infections, abdominal and pelvic infections, pneumonia, bacteraemia, and meningitis. It is also an important pathogen in intensive care units where cross-infection may cause intrahospital spread with serious consequences. Within this study, four E. coli isolates from the tracheal aspirates of a tra
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extra-intestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) is a virulent pathogen found in humans that causes the majority of urinary tract infections, and other infections such as meningitis and sepsis. ExPEC can enter the urinary tract through two modes: ascending from the bladder or descending from the kidneys. Human anatomical structures generally prevent the transmission of pathogens between the extra-intestinal area, kidneys, bladder, and urinary tract. However, adhesins, a virulence protein of ExPEC, promote the initial bacterial attachment and invasion of host cells. In addition to adhesion
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two distinct stx2f-carrying Escherichia coli (E. coli) strains, isolated from a child with uncomplicated diarrhea fifteen weeks apart, were characterized by combining short- and long-read sequencing to compare their genetic relatedness. One strain was characterized as Shiga toxin-producing E. coli (STEC)/typical enteropathogenic E. coli (tEPEC) O63:H6 with a repertoire of virulence genes including stx2f, eae (α2-subtype), cdt, and bfpA. The other STEC with serotype O157:H16, reported for the first time as stx2f-carrying Escherichia coli in this study, possessed, in addition, eae (ε-subtype) an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We focused on investigation of E. coli infection influence on the turnover and apoptosis of intestinal mucosa. We have verified changes in proliferation and apoptosis in epithelial lining as well as in lamina propria of jejunum and colon of germ-free (GF) piglets as healthy control group and GF piglets in which at 5th day their gut was colonized with E. coli bacteria (ECK group). According to our results we detected significant increase in proliferation of the epithelial cells only in the jejunum of the ECK group, indicating a higher sensitivity to colonization with E. coli. Significant change
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This systematic review aimed to explore any demographic, biological and behavioural characteristics of men who have sex with men (MSM) with diarrhoeagenic E.coli.
DESIGN/METHODS: We searched MEDLINE, EMBASE, and CINAHL for manuscripts published to March 2024. One author screened manuscript abstracts; two authors independently conducted a full text review. We only included primary data on gastrointestinal E.coli in MSM. Risk of bias was assessed independently by two authors using the Joanna Briggs Institute tools. This review was registered on PROSPERO(CRD42023455321).
RESULTS: Ele
СтатьяСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated the pathogenic mechanisms of Aeromonas veronii in macrophages. THP-1 derived macrophages were used as a human macrophage model and were treated with A. veronii strain AS1 isolated from intestinal biopsies of an IBD patient, or Escherichia coli strain K-12. RNA was extracted and subjected to RNA sequencing and comparative transcriptomic analyses. Protein levels of IL-8, IL-1β, IL-18, and TNFα were measured using ELISA, and apoptosis was assessed using caspase 3/7 assays. Both A. veronii AS1 and E. coli K-12 significantly upregulated the expression of many genes involving
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal bacterial infections have become a significant threat to human health. However, the current typical antibiotic-based therapies not only contribute to drug resistance but also disrupt gut microbiota balance, resulting in additional adverse effects on life activities. There is an urgent need to develop new antibacterial materials that selectively eliminate pathogenic bacteria without disrupting beneficial bacterial communities or promoting drug resistance. Herein, we utilize bacterial quorum sensing (QS), a universal mechanism for regulating community behavior, to develop a supramolec
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mucosal infections normally cause an immune response including activation of antigen-specific B cells in regional mucosa-associated lymphoid tissue. After recirculation of plasmablasts, and maturation at mucosal surfaces or bone marrow, plasma cells produce secretory or systemic IgA. It remains uncertain to what extent secretory and systemic IgA share the same target specificities. For vaccine candidate optimization, it is important to know whether IgA targeting of glycosylated epitopes of a protein antigen vary between mucosal and systemic sites. We evaluated glycosylated epitope specificity
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157:H7 is an important intestinal pathogen that causes severe foodborne diseases. We previously demonstrated that the genomic island-encoded regulator LmiA activates the locus of enterocyte effacement (LEE) genes to promote EHEC O157:H7 adherence and colonization in the host intestine. However, whether LmiA is involved in the regulation of any other biological processes in EHEC O157:H7 remains largely unexplored. Here, we compared global gene expression differences between the EHEC O157:H7 wild-type strain and an lmiA mutant strain using RNA-seq techn
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.