Уникальные публикации PubMed, Europe PMC и Crossref, сохранённые в библиотеке. Одна статья учитывается один раз, даже если получена из нескольких источников. Личные исследования и документы команд не публикуются.
Идёт проверка счётчикаДоступно в поиске—
Публикации, уже подготовленные для быстрого поиска. Остальная библиотека подключается в фоне.
Переведено на русский—
Готовые переводы среди доступных в поиске публикаций. Автоматический медицинский перевод и проверка специалистом учитываются отдельно.
Полные тексты—
Найденные полные тексты среди доступных в поиске публикаций. Доступность определяется первоисточником и условиями использования.
Оригиналов на русском—
Русскоязычные оригиналы доступны без ожидания перевода. Ниже — языки остальных оригиналов; для них готовится медицинский перевод на русский.
Пополняем библиотеку по диагнозам—Проверяем состояние обновлений
Для каждого диагноза из справочника МКБ-10 ищем связанные публикации в научных базах и добавляем их в библиотеку. Числа ниже — диагнозы, а не статьи.
Если сбор прервался, тема требует повторной попытки. Уже сохранённые статьи остаются в библиотеке.
Нажмите на показатель для подробностей. Показатели поиска обновляются автоматически; размер всей библиотеки сверяется отдельно. Время последней проверки указано явно.
Доступно в поиске
17233 публикаций
Поиск: 43 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 5 с найденным полным текстом
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)2027eng
The incorporation and visualization of modified D-amino acids into the peptidoglycan (PG) of actively replicating microbes have made a tremendous impact on the field of bacterial physiology. Here, we describe the optimization of this technique for labeling PG in obligate, intracellular Chlamydia species as well as Chlamydia-like organisms. Fluorescent D-amino acids (FDAAs) are D-alanine analogs that readily incorporate into the stem peptides of living bacteria and can be visualized rapidly with a fluorescence microscope without the need for laborious postfixation procedures. By comparison, D-a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite a high level of conservation within its core genome, the Chlamydia genus comprises various species that exhibit diverse pathogenic profiles. Genetic engineering techniques employing shuttle vectors are crucial tools for elucidating the pathogenesis of these obligate intracellular bacteria. In recent years, the introduction of calcium chloride-mediated transformation methods has significantly advanced genetic manipulation techniques for Chlamydia trachomatis. However, the efficiency of transformation using shuttle vectors, as well as plasmid maintenance, varies not only between Chlamydi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic manipulation of Chlamydia trachomatis can elucidate the determinants involved in pathogenesis but is difficult due to this bacterium's obligate intracellular lifestyle and comparatively low transformation rate. Deletion mutants can be generated in Chlamydia by allelic exchange via homologous recombination, but require conditionally replicating vectors that have to be maintained and propagated through several rounds of the intracellular developmental cycle. An additional challenge is that Chlamydia and E. coli cannot stably maintain each other's endogenous plasmids. As a solution, the o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter describes a lambda Red-based recombineering approach for targeted genetic manipulation in Chlamydia species. The method uses a non-replicative plasmid encoding lambda Red recombination proteins together with locus-specific homology arms to generate precise gene deletions in the Chlamydia chromosome. Detailed protocols are provided for construct design, host cell-based selection, and genetic validation of recombinant strains, and noteworthy considerations for transforming different Chlamydia species and strains are given.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the minimal gene set required for cellular viability is a central goal in microbiology. A transposon mutagenesis protocol has been developed for use in Chlamydia to enable gene function analysis and reveal the essential genome. This method utilizes a self-replicating Himar-1 transposon delivery system, with a hyperactive transposase gene under inducible transcriptional and translational control, coupled with long-read nanopore sequencing to identify transposon insertion sites. In a step-by-step protocol, we describe how to prepare the transposon library by infecting cells with a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic manipulation of Chlamydia trachomatis is challenging because of its obligate intracellular lifestyle and reduced genome with a high proportion of essential genes. Functional analysis of chlamydial genes often requires alternative genetic strategies such as conditional knockdown rather than gene disruption. This chapter describes the use of an engineered small RNA (sRNA) to achieve inducible protein knockdown in C. trachomatis. This approach utilizes the C. trachomatis sRNA CtrR3 as a scaffold to express a targeting sequence that interferes with a target mRNA by binding its 5' untransla
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe an oligonucleotide RNA-guided, DNase-dead CRISPR-associated protein 12 (dCas12)-mediated transcriptional interference (CRISPRi) system optimized for gene knockdown in Chlamydia trachomatis. In this system, while guide RNAs are expressed constitutively, dCas12 expression is conditional and depends on the presence of the small molecule anhydrotetracycline (ATC). This design enables temporal control of gene repression, allowing the functional analysis of a wide range of genes, including essential genes, without permanent genetic disruption. Due to its T-rich protospacer adjacent motif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe in detail an experimental strategy, DOPE (Dependence On Plasmid-mediated Expression), to enable disruption of an essential chlamydial gene. A wild-type Chlamydia trachomatis strain is first transformed with a β-lactamase-selectable plasmid carrying a copy of the gene under the inducible control of an anhydrotetracycline (ATC)-responsive promoter. Transformants are selected under permissive conditions in the absence of ATC to establish stable plasmid maintenance. The resulting chlamydiae are subsequently transformed with a suicide plasmid encoding a group II intron engineered to tar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia trachomatis (CT) causes genital tract infection in humans, but the clinical significance of C. trachomatis detection in the gastrointestinal (GI) tract is an area of active research. Chlamydia muridarum (CM) is a mouse-adapted species used to investigate chlamydial biology and pathogenicity in both the genital and gastrointestinal tracts. Since chlamydial colonization of different segments of the GI tract may lead to distinct consequences, quantifying chlamydial yields across these regions will facilitate understanding of chlamydial biology and pathogenicity. This chapter describes a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-resolution characterization of antigen-specific T cell responses is essential for understanding cellular immunity to Chlamydia trachomatis infection in humans. This chapter describes two complementary flow cytometry-based approaches for measuring human antigen-specific T cell responses: intracellular cytokine staining (ICS) and activation-induced marker (AIM) staining. Both assays enable single-cell-level analysis following antigen stimulation but differ in their readouts. ICS quantifies functional cytokine production in response to short- or long-term stimulation, whereas the AIM assay i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia subverts host cell pathways by secreting effector proteins into the membrane of its inclusion. These bacterial membrane proteins, called Incs, mediate interactions between the inclusion and the host cell. To study Inc protein dynamics in live cells, we have developed a methodology that relies on host cell expression of antibodies fused to fluorescent proteins, known as frankenbodies, which detect epitopes exposed to the cytosol. HeLa cells are first stably transfected with a plasmid encoding an mScarlet3-tagged anti-FLAG frankenbody. These cells are then infected with Chlamydia expre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This chapter describes methodological approaches for studying intracellular ion dynamics during Chlamydia trachomatis infection. It emphasizes the requirement for live-cell imaging to capture active and compartmentalized ion fluxes in infected cells precluded by fixed-cell techniques. Specifically, we present step-by-step protocols for labeling Chlamydia-infected cells with a fluorescent potassium ion (K+)-sensitive probe for performing live imaging with confocal microscopy or spinning disc confocal microscopy for higher resolution and procedures for image processing and quantification. We als
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pathogenic bacterium Chlamydia replicates via an unusual developmental cycle that takes place within a membrane-bound inclusion inside an infected host cell. Immunofluorescence microscopy has revealed many details about the two specialized developmental forms and the recruitment of host organelles to the inclusion, but lacks the high resolution of electron microscopy (EM). In this chapter, we describe the use of an innovative microscopy method, called Tenfold Robust Expansion (TREx) microscopy, to visualize proteins in Chlamydia-infected cells at nanoscale resolution. We present a detailed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The obligate intracellular bacterial pathogen Chlamydia trachomatis establishes a membrane-bound compartment called the inclusion, which serves as a replicative niche, within host cells. Sphingolipids, a major class of eukaryotic membrane lipids, are acquired from the host and incorporated into chlamydial membranes. Visualization of individual bacteria within inclusions or sub-bacterial structures by fluorescence microscopy remains challenging due to the limited resolution of conventional light microscopy. Expansion microscopy (ExM), a super-resolution imaging technique, enables nanoscale reso
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin immunoprecipitation (ChIP) measures binding between a specific protein and its in vivo DNA-binding sites. It is challenging to perform ChIP for bacteria that reside inside a eukaryotic cell, but we have optimized this method for Chlamydia-infected cells and used it to identify genome-wide binding sites of chlamydial transcription factors and sigma factors. The ability to measure protein-DNA interactions in intracellular chlamydiae without the need to isolate bacteria from the host cell allows changes in DNA binding to be measured during the Chlamydia developmental cycle and under dif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The obligate intracellular bacterium Chlamydia employs a unique, asynchronous biphasic developmental cycle characterized by distinct morphological forms: the replicative reticulate body (RB), the infectious elementary body (EB), and an intermediate body (IB). The simultaneous presence of these phenotypically distinct cell types throughout infection complicates the study of gene expression regulation during development. Conventional population-level assays are inadequate for dissecting the regulatory mechanisms within this mixed population. This chapter describes a robust method utilizing hybri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to genome streamlining, many genes in the ~1 Mb genome of Chlamydia trachomatis are essential and cannot be deleted. Ectopic overexpression and CRISPRi-based knockdown are complementary genetic approaches to study the function of genes in C. trachomatis, including essential genes. When used in combination with inducible promoters, these tools allow researchers to determine how precise regulation of gene expression contributes to proper progression of the chlamydial developmental cycle. This chapter includes protocols which detail ectopic overexpression of a protein or conversely, transcrip
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To subvert host defenses and establish a replicative niche, obligate intracellular pathogens remodel the host cell using a discrete repertoire of effector proteins. For Chlamydia trachomatis, defining the repertoire of conventional type III secretion system effectors (cT3SS) has been exceedingly difficult as many of these proteins are present at low levels in the host cell and do not accumulate within a specific host compartment, necessitating signal amplification for accurate detection. Drawing on approaches widely used for assessing secretion of candidate T3SS and T4SS substrates, several en
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia trachomatis, an obligate intracellular pathogen responsible for trachoma and widespread urogenital infections, replicates exclusively within the confines of a membrane-bound vacuole known as the inclusion. This compartment shields the bacterium from host cellular immune detection; thus, clarifying how inclusion integrity is maintained and protected from vacuole-destabilizing host attacks may identify new therapeutic strategies. To enable such insights, we recently developed split-GFP-based microscopic reporters that can detect early forms of membrane damage and track individual bacte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent application of experimental and computational drug discovery workflows has identified hundreds of new molecules that display potent, and in some cases highly selective, activity against bacteria of the genus Chlamydia. The full value of these novel antichlamydial molecules, however, depends critically on our ability to determine their molecular targets and modes of action. A particularly powerful and widely applied strategy for identifying candidate targets involves selecting for bacterial mutants that have acquired resistance to a compound's inhibitory activity, followed by determi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.