Pneumocystis jirovecii is an opportunistic fungal pathogen responsible for Pneumocystis pneumonia (PCP) in immunocompromised patients. Antifolate drugs targeting the dihydrofolate reductase (DHFR), including trimethoprim (TMP), remain central to treatment, but studying the effects of mutations in DHFR on resistance to treatment is limited by our inability to culture this organism in vitro or in animal models. We expressed P. jirovecii DHFR (PjDHFR) in Saccharomyces cerevisiae and performed deep mutational scanning (DMS) on this protein to measure the effects of all single amino-acid substituti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pneumocystis jirovecii pneumonia (PJP) remains a life-threatening opportunistic infection in renal transplant recipients despite universal prophylaxis, with its risk factors in this setting poorly defined. This study aimed to investigate these factors and develop a nomogram to predict PJP risk, identifying patients requiring extended prophylaxis.
METHODS: Demographic characteristics and perioperative outcomes of consecutive patients who underwent kidney transplantation from DCD or DCBD donors at a high-volume kidney transplant center in China between January 2016 and January 2019
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pneumocystis jirovecii pneumonia (PJP) is a common opportunistic infection with high mortality among immunocompromised patients. Although adjunctive glucocorticoid therapy improves outcomes in HIV-associated PJP, its role in non-HIV patients remains controversial. Immune reconstitution inflammatory syndrome (IRIS), a potentially overlooked inflammatory response, may lead to rapid clinical deterioration.
CASE PRESENTATION: A 60-year-old woman developed non-HIV-associated PJP following high-dose glucocorticoid therapy for anti-IgLON5 antibody-associated encephalopathy, which progres
СтатьяКлинический случайСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction. Pneumocystis jirovecii pneumonia (PJP) is a life-threatening infection that affects patients with impaired immunity (primarily cellular immunity). Given that few studies have evaluated the incidence of PJP in pediatric patients with solid tumors, the objective of this study was to estimate the incidence of PJP among pediatric patients with solid tumors treated at a general hospital. Population and methods. A retrospective cohort study of 251 patients under 18 years of age with a confirmed diagnosis of solid organ cancer treated at a general hospital. Clinical, oncological, and in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Kidney transplant recipients are at risk for Pneumocystis jirovecii pneumonia (PJP), particularly under profound immunosuppression. Mycophenolic acid (MPA) is widely used after transplantation and is associated with interindividual variability in exposure and hematologic toxicity. Genetic variation affecting MPA metabolism and pharmacodynamics may contribute to lymphopenia and PJP.
METHODS: We performed a matched 1:2 case-control study to assess risk factors for PJP in kidney transplant recipients (1993-2022) using multivariable logistic regression. In addition, a retrospective co
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Compared with microscopy, quantitative real-time PCR (qPCR) is more sensitive for the diagnosis of Pneumocystis jirovecii pneumonia (PcP) and may also help distinguish PcP from colonization based on fungal burden. In this retrospective cohort study, we evaluated the performance of the LeaDEA Pneumocystis PCR Kit, a single-packaged reagent system designed for use on a fully automated molecular testing platform, using respiratory specimens from immunocompromised patients. The analytical and clinical performance of the LeaDEA assay on the GeneLEAD VIII platform was compared with that of a previou
СтатьяОценочное исследованиеСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interferons (IFNs) coordinate host defense at the lung barrier by linking pathogen recognition to epithelial and immune-cell responses. Their effects are highly context-dependent and can be protective or pathological according to IFN class and ligand, cellular source and target, and the timing and duration of signaling. In this minireview, we compare the induction of type I, II, and III IFNs during respiratory viral infection and pulmonary Aspergillus fumigatus infection, highlighting epithelial-led antiviral sensing and predominantly myeloid-centered antifungal sensing. We then examine how re
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Candida species are major causes of hospital-acquired bloodstream infections associated with high mortality in critically ill patients. This study aimed to evaluate temporal changes in species distribution, antifungal resistance, clinical outcomes, and mortality predictors in ICU patients with candidemia.
METHODS: This retrospective study included 250 ICU patients with candidemia between January 2018 and January 2022. The study period was divided into two cohorts (2018-2020, n = 80; 2020-2022, n = 170). Clinical, laboratory, and microbiological characteristics were compared. Multi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pneumocystis pneumonia (PCP) is a well-known infectious complication of organ transplantation requiring prophylaxis at least within the first 6 month to 1 year post transplantation.
RESEARCH QUESTION: Few data exist comparing the characteristics of Pneumocystis pneumonia associated with kidney, heart, liver or lung transplant recipients.
STUDY DESIGN & METHOD: We here conducted a cross-sectional study nested within the surveillance of our national reference center for invasive mycoses to analyze the prospectively declared cases of PCP occurring in solid organ transplant recipient
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pneumocystis jirovecii is an opportunistic fungus responsible for Pneumocystis pneumonia (PJP) in hosts with impaired cell-mediated immunity, particularly solid organ transplant recipients. The aim of our study was to identify risk factors associated with PJP in kidney transplant recipients (KTRs).
METHODS: We conducted a single-center, retrospective, case-control study (1 case per 2 controls) of KTRs from May 2014 to May 2024. Cases were defined as KTRs with a confirmed diagnosis of PJP, while controls were matched on transplant and hospitalization dates (±3 months) and had not d
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The morbidity and mortality of Pneumocystis pneumonia (PCP) are rising among patients with autoimmune or inflammatory diseases (AID). Prospective studies focusing on severe PCP in this population remain scarce. A better understanding of the disease course and prognostic factors is urgently needed.
METHODS: A 5-year prospective single-center study in the ICU enrolled AID patients with severe PCP. Clinical, laboratory, radiological, therapeutic, and outcome data were collected prospectively. Multivariable regression was used to identify risk factors for initial treatment failure and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To develop and validate an interpretable HRCT radiomics-based machine learning model for early risk stratification and identification of invasive fungal infection (IFI) in patients with community-acquired pneumonia (CAP). A total of 570 CAP patients who underwent HRCT from July 2022 to August 2024 in Center 1 and Center 2 were recruited. A VB-net pneumonia automatic segmentation algorithm was employed. Three models, a radiomics model (HRCT-derived radiomics features), a clinical model (clinical variables), and a combined model (integrating both), were developed. The performance of the model wa
СтатьяМногоцентровое исследованиеВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Viral-associated pulmonary aspergillosis (VAPA) is a severe complication of viral pneumonia (VP) that is associated with pronounced inflammatory amplification, immune dysregulation, and increased mortality. However, systemic metabolic and immune response patterns accompanying VAPA remain incompletely understood.
METHODS: Plasma samples were obtained from 35 patients with viral pneumonia (VP group) and 20 with viral-associated pulmonary aspergillosis (VAPA group). An integrated multi-omics strategy combining data-independent acquisition (DIA)-based proteomics and untargeted metabol
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: COVID-19-associated pulmonary aspergillosis (CAPA) has emerged as a severe and potentially underrecognised complication in patients with SARS-CoV-2 infection, particularly in intensive care units (ICUs). Existing reviews show substantial heterogeneity in diagnostic criteria, incidence estimates, and reported risk factors, limiting reliable interpretation of the overall evidence base.
MATERIALS AND METHODS: this umbrella review synthesised systematic reviews and meta-analyses published between 2020 and 2025 to clarify the incidence, mortality, and risk factors associated with CAP
СтатьяСистематический обзорМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fungal respiratory infections are rare in immunocompetent children, and their recognition remains challenging since clinical features are often subacute and overlapping with other causes of respiratory disease. A structured diagnostic approach is fundamental to facilitating earlier diagnosis and prompt targeted therapy, thereby improving outcomes. Fungal spores are ubiquitous in the environment and fungal colonisation of skin and mucosal membranes is common, hence differentiation of infection from colonisation is key to an accurate diagnosis and a prudent approach to management. The diagnosis
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Pneumocystis jirovecii pneumonia (PJP) remains a life-threatening lower respiratory tract infection associated with respiratory failure in patients with impaired T-cell immunity. Its incidence is increasing in non-HIV patients, who typically experience a more severe disease course and poorer outcomes than HIV patients. Keeping a high level of suspicion for PJP when confronted to an immunocompromised patient presenting with an acute respiratory failure (ARF) is essential to start promptly the treatment and thereby reduce associated morbidity and mortality.
AREAS COVERED: The mech
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance represents a paramount challenge to global public health in the 21st century. The multidrug-resistant fungal pathogen Candida auris poses a critical and escalating threat to global public health. Characterized by rapid nosocomial transmission, persistent environmental contamination, and resistance to multiple antifungal classes, C. auris challenges healthcare systems worldwide. Its independent emergence across distinct geographic clades and exponential rise in cases, exacerbated by the COVID-19 pandemic, underscore the urgent need for robust, coordinated response. This
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Invasive fungal infections (IFI) represent a serious complication in critically ill sepsis patients with severe pneumonia, contributing to increased mortality and prolonged hospitalization. Early prediction of IFI remains challenging due to the lack of specific clinical tools. This study aimed to develop and validate a predictive nomogram for IFI risk in this high-risk population.
METHODS: A total of 1,890 sepsis patients with severe pneumonia admitted to the ICU of the primary center were retrospectively enrolled from Shaanxi Provincial People's Hospital. Patients were randomly d
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epidemiology of candidemia changed during the COVID-19 pandemic, but direct comparisons of episodes with and without coronavirus disease 2019 (COVID-19) remain limited. We performed a retrospective cohort study of consecutive adult patients with candidemia diagnosed from February 2020 through February 2023 at a Brazilian tertiary-care teaching hospital. Demographic, clinical, microbiological, treatment, and outcome variables were compared according to COVID-19 status, and predictors of 30-day mortality were evaluated among treated patients. Among 106 episodes in 103 patients, 36 (34.0%) oc
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: COVID-19-associated pulmonary aspergillosis (CAPA) is a frequent and life-threatening complication in critically ill patients. However, the role of antifungal prophylaxis and preemptive therapy remains unclear. This study aimed to evaluate the effects and safety of these strategies.
METHODS: This single-center, retrospective study included patients with COVID-19 who required advanced respiratory support (high-flow nasal cannula, non-rebreathing mask, mechanical ventilation, or extracorporeal membrane oxygenation) between November 2022 and December 2023. The primary outcome was the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.