Base editing enables the direct, programmable conversion of one nucleotide into another at a defined genomic site without introducing a double-strand break. First reported in 2016, a decade later, it has expanded into a broad family of molecular tools that has now entered clinical trials. This chapter reviews the development of base editing from its origins, including the early transition of cytosine and adenine base editors, to the more recent emergence of transversion editors. For each class, this section describes the mechanism, the optimization of on-target efficiency, product purity, and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Virus-like particles (VLPs) are self-assembling viral protein complexes that mimic native virions while lacking replicative and infectious capacity. By retaining efficient cellular entry and cargo protection, they overcome key limitations of viral vectors, including insertional mutagenesis and strong immunogenicity. Their ease of production, flexible cargo capacity, and tunable tropism make them highly versatile tools. Here, we describe a protocol for generating VSV-G-pseudotyped VLPs that deliver CRISPR/Cas9 RNPs and their functional validation in surrogate cell lines.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Electroporation-based delivery of CRISPR/Cas systems has emerged as a powerful and versatile approach for gene editing in primary human T cells, enabling efficient, transient, and nonviral modification while minimizing genomic integration risks. This chapter focuses on the principles and practical implementation of electroporation (nucleofection) for the delivery of Cas9 ribonucleoprotein (RNP) complexes into human T cells, highlighting critical parameters that influence editing efficiency, cell viability, and scalability for research and clinical applications. We provide a comprehensive proto
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia trachomatis (CT) causes genital tract infection in humans, but the clinical significance of C. trachomatis detection in the gastrointestinal (GI) tract is an area of active research. Chlamydia muridarum (CM) is a mouse-adapted species used to investigate chlamydial biology and pathogenicity in both the genital and gastrointestinal tracts. Since chlamydial colonization of different segments of the GI tract may lead to distinct consequences, quantifying chlamydial yields across these regions will facilitate understanding of chlamydial biology and pathogenicity. This chapter describes a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intestinal epithelium consists of a single layer of polarized cells that serves as a crucial barrier against pathogens while mediating food digestion and nutrient absorption. The differentiated villus cells, important for the intestine's function, originate from rapidly dividing Lgr5+ stem cells located in the intestinal crypts. These stem cells can be expanded in vitro and form three-dimensional (3D) "mini-organs" known as intestinal organoids, which closely phenocopy the intestinal epithelium. The development and maintenance of these 3D organoids depend on a defined growth factor cocktai
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two-dimensional (2D) culture systems are powerful in vitro tools that have revolutionized the study of intestinal stem cell biology. These culture systems derived from mouse intestinal and colonic epithelia enable the modeling of tissue architecture, barrier function, and disease mechanisms under physiologically relevant conditions. This protocol details methods for isolating and maintaining mouse intestinal crypts as 2D monolayers. Monolayers are established via enzymatic dissociation and seeding onto ECM-functionalized hydrogels. This protocol also describes a deep learning pipeline that per
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intestinal epithelium maintains continuous self-renewal and multi-differentiation capacities through the integrated regulation of multiple signaling pathways, including Wnt, bone morphogenetic protein, epidermal growth factor (EGF), and Notch signaling pathways. Based on this principle, a defined combination of EGF, Noggin, and the Wnt agonist R-spondin has been shown to support long-term expansion of mouse intestinal stem cells and the formation of organoids with indefinite self-renewal and full differentiation capacity. In human intestinal organoid cultures, the addition of small molecul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic manipulation of cells represents one of the fundamental techniques in current biological research, essential for elucidating the regulatory mechanisms underlying various biological phenomena, modeling many diseases, and investigating their therapeutic interventions. However, in the context of organoid biology, the manipulation of target genes and the selection of resultant genetically modified clones often encounter significant technical challenges due to the typically low gene introduction efficiency. This difficulty is largely attributed to the three-dimensional culture of organoids
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteomics, the large-scale study of proteins, enables the identification, quantification, and functional characterization of proteins, revealing post-translational modifications and protein interactions that are not apparent from transcriptomic data. Human organoids, which recapitulate the structural and functional complexity of native epithelial tissues, provide powerful tools to study disease mechanisms and personalize therapies. However, their culture poses challenges for efficient protein extraction and reproducible analysis. Here, we present a proteomics workflow optimized to maximize pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal stem cell (ISC)-derived organoids provide a physiologically relevant 3D culture system to model intestinal biology, regeneration, and disease mechanisms. Their complex architecture, recapitulating crypt structures, poses challenges for downstream histological and immunohistochemical analyses, necessitating optimized processing, and staining protocols. Here, we describe robust workflows for the fixation, embedding, sectioning, and staining of ISC-derived organoids. Each method is detailed stepwise, with emphasis on preserving morphology and antigenicity. We discuss reagent choices, c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here, we present an optimized whole-organoid immunofluorescence staining protocol that preserves morphology, achieves uniform antibody penetration, and enables deep-tissue imaging without the need for tissue clearing. Organoids are three-dimensional, self-organizing structures that replicate many of the cellular and architectural features of their tissue of origin, making them powerful preclinical models for studying development, disease, and therapeutic responses. Most organoid research is performed on formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) samples, in which organoids are sectioned across t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Globally in 2024, only 54% of people diagnosed with tuberculosis received an initial WHO-recommended rapid molecular diagnostic test. Pooled testing could expand access to molecular detection using existing laboratory capacity. We aimed to evaluate the performance of pooled tuberculosis testing in a multicentre diagnostic accuracy study.
METHODS: In this prospective diagnostic accuracy study, we enrolled individuals with presumptive tuberculosis through facility-based case finding (district hospitals and primary health centres) and community-based case finding in Bangladesh, Brazi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Organoids and fibroblasts derived from patient tissue serve as physiologically meaningful in vitro models to investigate tissue biology, diseases, and treatment responses. In this study, we present a robust protocol for the simultaneous isolation and long-term culture of patient-derived organoids (PDOs) and fibroblasts from both healthy and colorectal cancer samples. The workflow uses enzymatic dissociation followed by efficient separation into epithelial and stromal cell fractions. Organoids are embedded in Matrigel or Matrigel-Collagen I mixtures to support three-dimensional growth, whereas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) is a major malignancy with significant global implications for human health. The development of a reliable and pathologically relevant orthotopic CRC model is essential for advancing our understanding of its molecular mechanisms and for developing more effective therapeutic interventions. However, the construction of such models is fraught with challenges primarily because of the technical complexities involved in the transplantation of CRC cells into the intestinal epithelium. In this chapter, we describe a recently developed method for generating an orthotopic CRC mod
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Automated external defibrillators (AEDs) are rarely used by bystanders in Birmingham, Alabama. We sought to characterize AED availability, accessibility, and usability in the highest-risk out-of-hospital cardiac arrest neighborhoods of Birmingham.
METHODS: We conducted a descriptive observational study from June 12 to August 27, 2025, in 3 Birmingham neighborhoods with the highest relative out-of-hospital cardiac arrest risk. Potential public AED sites, defined as properties other than single-family residences, were identified using Google Maps landmark descriptions. Sites were co
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
Письмо в редакциюПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
Редакционная статьяКомментарийПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
Редакционная статьяКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяRetraction NoticeПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.