During extracellular glutamate overproduction in Corynebacterium glutamicum, an increase in metabolic flux toward glutamate synthesis occurs without an increase in the transcriptional or translational levels of relevant enzymes, suggesting the involvement of unprecedented post-translational regulatory mechanisms. Here, we investigated the relationship of enzyme condensation with the metabolic shifts that lead to glutamate overproduction. We systematically analyzed the subcellular localization of enzymes involved in glutamate overproduction using fluorescent protein tagging to identify enzyme c
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diazo group is a highly valuable functional group in organic synthesis; however, its conventional preparation requires harsh conditions. Here, we provide a systematic analysis of ATP-dependent diazotases from actinomycetes that catalyze the condensation of nitrite with aromatic amines. Sequence similarity network analysis of AMP-binding enzymes revealed two families (type Ia/Ib), with type Ib further classified into 14 groups. In vitro assays confirmed the diazotization activities of the diazotases from 7 groups in the type Ib family, each displaying distinct substrate preferences. Remarka
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The direction of conformational coupling in a membrane protein, that is, which domain drives which, has been inaccessible to experimental measurement. We recover this directivity from molecular dynamics (MD) of transmembrane-juxtamembrane (TM-JM) dimers of receptor tyrosine kinases EGFR and FGFR3. Coupling is detected with a Bayesian network framework (CASCADE); its direction is measured with PERI (Phase-plane Estimation of Rotational Irreversibility) as the net phase-plane circulation, validated on synthetic data, and resolved at 0.1 ns. Direction is summarized as the TM→JM directed-mass frac
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The PI3K/AKT signaling pathway is triggered by the recruitment of AKT to cellular membranes. Although AKT is a multidomain serine/threonine kinase composed of an N-terminal pleckstrin homology (PH) domain and a C-terminal kinase domain (KD), how these domains cooperate to regulate AKT activation on membranes remains unclear at the molecular level. Here, using molecular dynamics simulations of full-length AKT on phosphatidylinositol (3,4,5)-trisphosphate (PIP3)-containing lipid bilayers, we identify four distinct membrane-binding modes that differ in the orientations and membrane contacts of th
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular glues (MGs) offer a unique modality for inducing protein-protein interactions (PPIs), yet their rational design is often hindered by the limitations of static structural data. Here, we present a computational pipeline for the design of cooperative MGs for the FKBP12-MAPRE1 system using replica exchange with solute scaling (REST2) for enhanced sampling in molecular dynamics (MD) simulations. By sampling the conformational ensembles of binary and ternary complexes, we identified a "stabilized configurational space" that facilitates ternary-complex formation through a combination of con
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Natural products have been paramount in inspiring novel chemistry as well as providing therapeutic agents and chemical tools for biological applications. A recently emerging class of natural products, the thio/seleno-imidazoles (TSIs), contains C-S or C-Se bonds that are installed by nonheme iron sulfoxide and selenoxide synthases (NHISSs). These TSIs, which include ergothioneine, are ubiquitous, but little is known about the broader TSI chemical space or co-occurrence with other biosynthetic enzymes. Here, we use NHISSs as a bioinformatic hook to identify a widespread family of biosynthetic g
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytochrome P450 dimerases generate the remarkable structural diversity of dimeric diketopiperazine (DKP) natural products through highly selective intermolecular radical-mediated reactions. Although radical addition mechanisms have been established for most bacterial DKP dimerization modes, the molecular basis underlying the formation of the unusual C3-N1' linkage has remained unresolved, preventing a unified mechanistic understanding of P450-catalyzed DKP dimerization. Here, we combine structure-guided protein engineering, X-ray crystallography, biochemical characterization, molecular dynamic
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The semireduction of alkynes represents a powerful yet challenging transformation that requires simultaneous control of stereoselectivity and chemoselectivity. Currently, synthetic methods for the trans-reduction of alkynes to E-alkenes remain limited, particularly in the realm of biocatalysis. Herein, we report the repurposing of a nonheme iron dioxygenase for the trans-reduction of alkynes. Through screening and directed evolution, we obtained variants of gentisate 1,2-dioxygenase that enable the preparation of structurally diverse E-alkenes in high yields (up to 99% yield) with excellent st
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anthropogenic emissions of CO₂ continue to rise, contributing significantly to global warming and climate change. Among the available mitigation strategies, carbonic anhydrase (CA)-mediated CO₂ capture and conversion represents a green and efficient approach for accelerating the hydration of CO2 under mild conditions. α‑carbonic anhydrases (α-CAs) are highly efficient metalloenzymes for CO2 hydration, yet a limited number of bacterial α-CAs combine high catalytic turnover with adequate thermostability. Herein, this study presents a detailed characterization of an α-CA from Bacillus yunxiaonens
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beta-coronaviruses have caused three major coronavirus outbreaks, underscoring the urgent need for broad-spectrum antivirals. The coronavirus main protease (Mpro) is an ideal drug target due to its high conservation and absence of human homologs. Zevotrelvir (EDP-235) is an oral Mpro inhibitor with broad-spectrum activity against betacoronaviruses, but its molecular mechanism remains unclear. Here, we systematically evaluated Zevotrelvir against SARS-CoV-2 Mpro and its mutants (G15S, M49I, K90R, S144A), as well as SARS-CoV and MERS-CoV Mpro, using enzyme activity assays, crystallography, and m
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rising atmospheric CO2 levels not only drive global warming but also exert toxic effects on plant photosynthesis and physiology under extreme exposure, however the adaptive responses of stress tolerant species such as Prunus mira Koehne remain poorly understood. In this study, we investigated the physiological and stomatal response mechanisms of P. mira under 5% CO2 conditions. The results of our physiological and biochemical analyses revealed that 5% CO2 concentrations reduced chlorophyll content and impaired photosynthetic efficiency. Concurrently, high CO2 stimulated alternative respiration
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nicotinamide mononucleotide (NMN), a key Nicotinamideadeninedinucleotide (NAD+) precursor, has attracted attention for anti-aging potential. As an oral bioactive molecule, NMN inevitably interacts with digestive enzymes in the gastrointestinal tract, which may affect its bioavailability, stability and physiological function. Nevertheless, the interactions between NMN and digestive enzymes have not been systematically characterized. This study investigated NMN binding with three digestive enzymes (trypsin, pepsin, and α-amylase) using multi-spectroscopic techniques, molecular docking, and molec
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lignocellulosic biomass is a renewable carbon source for medium-chain fatty acid (MCFA) production, but conversion from solid feedstock to recoverable C6-C8 products is limited by biomass recalcitrance, enzyme deactivation, microbial inhibition, and downstream separation. This review critically evaluates metal-organic frameworks (MOFs) as stage-specific materials rather than a universal platform, linking manufacture and stability to biomass conversion, enzyme immobilization, carbohydrate upgrading, chain elongation, product recovery, regeneration, and process economics. Direct studies are dist
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glutathione (GSH) plays a key role in cellular homeostasis. There are two major enzymatic pathways in invertebrates to reduce oxidized glutathione (GSSG): 1) glutathione reductase (GR) and 2) thioredoxin glutathione reductase (TGR). In some insects, thioredoxin reductase (TR), reduces GSSG non-enzymatically via thioredoxin. The search for these enzymes in crustaceans has recently become a focal point to better understand redox homeostasis under stress conditions. This study aimed to characterize TGR in the shrimp Penaeus vannamei and to evaluate gene expression, GR activity, GSH and GSSG conte
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, the continuous flow moving bed biofilm reactor (MBBR) was developed for conversion of nitrogen and manganese including MBBR1 (R1, with manganese redox cycling function) and MBBR2 (R2, control group). The result suggested that NH4+-N removal reached 95±2% and 78±1% by R1 and R2 with NO3--N effluent concentrations of 2.1±0.4 and 7.1±0.6 mg·L-1, and TN removal through R1 increased compared with R2. Fluorescence characteristics and concentration of extracellular polymeric substances (EPS) were explored, and reactive oxygen species, apoptosis and enzyme activity of biofilm including
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quinoa is a representative pseudocereal widely used in developing gluten-free products for gluten-sensitive people. While enzymatic pretreatment improves the processing performance of pseudocereal flours, the impacts of glycoside hydrolases on the microbiota-modulating potential of quinoa products remain largely unexplored. This study compared the three-dimensional (3D) printing performance of wheat and quinoa flours, as well as quinoa flours treated with α-galactosidase, β-glucanase, or their sequential enzymatic treatment (α-galactosidase followed by β-glucanase), and then evaluated the colo
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Postharvest dehydration and senescence limit the shelf life of vegetable soybean. This study investigated the effects of pre-harvest potassium (K) fertilization and postharvest low-temperature storage on quality preservation, using physiological assays, widely targeted metabolomics, and transcriptomics in pods produced under K-deficient (K0) and K-sufficient (K120) conditions and stored at 4 °C or 25 °C. K120 seeds contained significantly higher K than K0 seeds (15.0 vs. 12.0 mg g-1 DW), confirming differential nutritional status. After 9 days of storage, low temperature combined with optimal
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Probiotics are indispensable functional microorganisms in food fermentation with increasingly promising application prospects. Although genetically modified probiotics show great potential in improving the quality of fermented foods, their practical application is hampered by ethical controversies and safety concerns. To address these issues, the sacB gene encoding levansucrase was cloned from Bacillus atrophaeus in this study. Three non-genetically modified (non-GMO) engineered strains were constructed via the binding of AcmA to peptidoglycan through key hydrogen-bonding residues. In jujube j
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Soft wheat (Sy) and mixed wheat (My; a 7:3 blend of soft and hard wheat) are used to produce high-temperature Daqu (HTD) for reducing production costs in certain baijiu enterprises. However, the differences between single-wheat HTD (S-HTD) and mixed-wheat HTD (M-HTD) remain unclear. This study aimed to compare the physicochemical properties, microbial succession, and flavor metabolism during fermentation of HTD produced from two different wheat raw materials. Although all monitored properties followed the same trends, differences existed between the two types of HTD during fermentation. At the
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Starch crystalline type is a key structural factor influencing its interaction with lipids. This study compared how three starch crystalline types, namely A-type wheat starch (WS), B-type potato starch (PS), and C-type mung bean starch (MBS), influenced the formation and properties of starch-palmitic acid (PA) complexes under ultrasonic treatment. A-type WS formed complexes (UWS-PA-500) that exhibited the highest pasting temperature (93.82 °C) and the largest decrease in gelatinization enthalpy with ΔH reduced from 9.65 J/g to 7.95 J/g, indicating the most pronounced improvement in thermal sta
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.