Intracellular calcium signaling plays a crucial role in intestinal epithelial function. In this chapter, we describe a method to monitor calcium dynamics in live pig small intestinal organoids using stably expressed genetically encoded FRET-based biosensor in combination with intensity-based ratiometric and fluorescence lifetime imaging (FLIM) microscopy readouts. The calcium biosensor Twitch-2B was introduced into organoids by electroporation. Despite the modest lifetime contrast, the biosensor provides a highly reliable ratiometric signal and is compatible with both conventional fluorescence
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Milk quality is essential to ensure the excellence of dairy products and consumer safety. However, cold chain storage and transportation do not always prevent milk contamination, compromising its quality. This study aims to analyze the physical, chemical, and biological variables involved in milk spoilage, identifying indicators that facilitate its monitoring through a lab-made sequential injection analysis (SIA) system. The study was conducted on batches of milk refrigerated and at room temperature, revealing that changes in bacterial concentration and the activity of hydrolytic enzymes, part
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-based gene editing is a growing therapeutic strategy for modifying or silencing disease-causing genes. This chapter focuses on the in vivo delivery of CRISPR systems using recombinant adeno-associated viral (rAAV) vectors. Specifically, we detail a methodology using a rAAV vector carrying Staphylococcus aureus Cas9 (SaCas9) to target the murine Hao1 gene in liver parenchymal cells as a curative treatment for primary hyperoxaluria type 1 (PH1). We provide comprehensive protocols for plasmid design and cloning, rAAV production, animal administration, and evaluation of editing efficacy.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phospholipases are a diverse group of lipolytic enzymes that hydrolyze membrane glycerophospholipid substrates at specific ester bonds at the lipid-water interface. They are involved in numerous functions such as the production of various intracellular signaling molecules, inflammation, and human digestion. These highly widespread enzymes in nature vary considerably in terms of structure, mode of action, and regulation. Research on phospholipases has progressed greatly in recent decades. This review aims to provide a general framework of the current understanding of phospholipases and a discus
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to identify the formation of membrane domains during the interfacial activation of pancreatic sPLA2 using fluorescence spectroscopy. The identification of phospholipase A2 (PLA2) activity by biphotonic methods is based on the behavior of fluorescent molecules present in the liposomal systems (enzyme-substrate). The liposomal system consists of a lipid membrane, which can be anything from a liposome to a cell membrane, and the PLA2 enzyme. Liposomes are biophysical models that can be used to study physicochemical processes, which boost the catalytic reaction at the het
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV), an arthropod-borne alphavirus within the Togaviridae family, is transmitted primarily by Aedes aegypti and Aedes albopictus. The virus causes an acute febrile illness characterized by severe, often bilateral polyarthralgia, with potential progression to chronic musculoskeletal pain and rare systemic complications involving cardiovascular and neurological systems. CHIKV exhibits a spherical, enveloped virion (~70 nm) with T = 4 icosahedral symmetry, incorporating E1/E2 glycoprotein heterodimers that mediate receptor binding and membrane fusion. Its positive-sense RNA
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV) represents a significant global health threat due to its recent resurgence. This protocol highlights the use of capillary-modified visual loop-mediated isothermal amplification (LAMP) technology for the rapid detection of CHIKV. We employed Vero cells for virus propagation and utilized the MolPure Viral DNA/RNA Kit for nucleic acid extraction, successfully amplifying extracted viral RNA at 63°C for 25 min. The presence of CHIKV was indicated by a distinct yellowish-green color change, demonstrating the effectiveness and simplicity of this protocol. Our protocol unders
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV) is transmitted through the bite of Aedes mosquitoes, specifically A. aegypti and A. albopictus. CHIKV belongs to the alphavirus with a positive-sense ssRNA genome of 11-12 kb size. The virus has been reported from various geographical regions across the globe. Chikungunya fever is an acute febrile illness, which, if left untreated, may develop into chronic arthralgia that may persist for several months or acute encephalitis syndrome. Therefore, early diagnosis of CHIKV is crucial to initiate prompt supportive treatment. Laboratory diagnosis of CHIKV typically relies o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cytopathic effect (CPE) is a key to understanding the pathogenicity of the chikungunya virus (CHIKV) and is useful for evaluating viral infectivity in vitro. The plaque assay, based on the CPE induced by viral infection, provides an infectious virus titer for test samples. Additionally, the assay is simple, quantitative, and cost-effective. Thus, the plaque assay remains the gold standard for determining the infectivity of CHIKV. However, manually counting of virus-induced plaques with the naked eye or under the microscope is often time-consuming and labor-intensive. Therefore, automated p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We adapted the plaque reduction neutralization test (PRNT) to detect chikungunya virus (CHIKV) neutralizing antibodies in liver homogenates instead of serum. This approach enables serological investigation using tissues collected from animal carcasses as nonhuman primate ones, during arbovirus surveillance, expanding opportunities for CHIKV monitoring and strengthening epidemiological surveillance efforts.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV) causes a disease characterized by chronic musculoskeletal inflammation for which specific antivirals are not yet available. Currently, a supportive therapy to alleviate fever and pain is used, but it does not limit viral replication or the persistence of chronic arthritis symptoms. Thus, the identification and development of new active molecules against CHIKV is urgently needed. Here, we present a cell-based methodology that enables the implementation of a rapid and cost-effective strategy for high- and medium-throughput screening (HTS) of compounds, including repurpo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histopathological analysis of tissues infected with Chikungunya virus (CHIKV), including biopsy and autopsy specimens, can provide valuable insights into the pathogenesis of atypical and fatal cases. By examining tissue architecture and cellular alterations under the microscope, it is possible to identify patterns of injury, inflammation, and cellular degeneration. These morphological findings provide evidence of how the pathogen interacts with host cells and tissues. Moreover, immunohistochemistry may be performed in tissue sections for the detection of viral antigens. Importantly, this techn
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The processing of adult mosquitoes collected in the field for studies of natural infection with arboviruses of public health interest (genera: Flavivirus, Alphavirus, Orthobunyavirus) follows the assembly of homogenized mosquito pools and extraction of genetic material using commercial or manual techniques, and the detection of viral RNA by polymerase chain reaction (nested RT-PCR) [11]. This paper describes the procedures for capturing, taxonomic determination, obtaining genetic material, and molecular techniques for detecting alphaviruses.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV) is a positive-sense RNA alphavirus transmitted to humans primarily by Aedes aegypti and Aedes albopictus mosquitoes. Its global circulation and significant public health impact underscore the need to better understand the molecular mechanisms driving CHIKV pathogenesis and transmission. Although robust molecular biology methods exist for CHIKV genome sequencing, a major limitation for surveillance and research is the inability to determine whether two nucleotide variations co-occur within the same viral genome when they are separated beyond the span of typical short-r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arboviral diseases represent a major public health challenge, especially in tropical regions where environmental conditions may favor the proliferation and spread of mosquito vectors. Thus, early and accurate detection of chikungunya virus (CHIKV) in mosquito populations can be a valuable tool for effective surveillance of circulating variants and for identifying new viral introductions. Given the challenges of detecting arboviruses in field-captured mosquitoes, we describe an integrated workflow for CHIKV molecular detection and whole-genome sequencing. This protocol includes mosquito homogen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We previously detailed a quantitative systems toxicology modeling framework for early prediction of chemotherapeutic-induced clinical intestinal adverse effects. The model describes stem and progenitor cell dynamics in the small intestinal epithelium and integrates epithelial-related processes, such as transcriptional profiles, citrulline kinetics, and the probability that the organism will have diarrhea. This protocol describes a step-by-step guide to the examples detailed in the original manuscript, namely 5-FU- and doxorubicin-induced intestinal toxicity.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
.: Nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) is a significant global health concern, impacting roughly 25% of people and leading to chronic liver conditions. It involves excess fat accumulation in the liver without significant alcohol intake and can develop into nonalcoholic steatohepatitis (NASH), fibrosis, or cirrhosis. While liver biopsy remains the gold standard for diagnosis, its invasive nature and associated risks restrict its routine use. Noninvasive biomarkers, such as serum ALT, AST, and various composite scores, are available; however, their clinical usefulness is often limited by va
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal stem cells (ISCs) are central to the maintenance and regeneration of the gut epithelium, supporting its rapid turnover and adaptive capacity. Recent advances, including the identification of LGR5+ stem cells, 3D in vitro organoid technology, and single-cell transcriptomics, have uncovered the remarkable heterogeneity and plasticity of ISCs and their niche. The ISC niche comprises dynamic interactions among epithelial, stromal, immune, and microbial components, enabling responses to injury and disease. Notably, both active and reserve stem cell pools, as well as progenitor and differ
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colonic inflammation induces profound alterations in the intestinal mucosa that are evident at both macroscopic and microscopic levels, including disruption of epithelial barrier integrity, crypt fission, and immune cell infiltration. Recent advances in single-cell and spatial RNA sequencing have greatly expanded our understanding of the cellular diversity of the colonic mucosa, enabling pathological features to be directly linked to underlying cellular and molecular mechanisms. This chapter demonstrates the application of single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analysis techniques to interroga
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intestinal epithelium is maintained by stem cells at the crypt base, however, acute or chronic inflammation can severely disrupt stem cell function and tissue homeostasis. To characterize mucosal inflammation and tissue damage, we evaluated time-course gene expression changes using a dextran sulfate sodium (DSS)-induced mouse model of colitis. By applying normalization, Z-score transformation, and spline curve modeling, we trace the temporal expression dynamics of key intestinal genes. This computational approach offer insights into the molecular responses during inflammation and may help
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.