In the last decade the 'comet assay' or 'single cell gel electrophoresis assay' has been established as a sensitive method for the detection of DNA damage and the measurement of its recovery. The results published in the literature have often been obtained with different methods for comet structure measurement. In most cases these data are not comparable with each other. Even when using similar systems for the analysis, it is difficult to obtain matching data. This presentation will describe some technical aspects of our measurement equipment and evaluation software. It focuses on necessary ex…
Technical ReportСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcription-coupled repair (TCR) is a pathway dedicated to the removal of damage from the template strands of actively transcribed genes. … 10-100-fold higher level of resolution. Fluorescence in situ hybridization (FISH) combined with the Comet assay (Comet-FISH) affords a heightened level of sensitivity for the assessment of repair in defined DNA sequences of cells treated with physiologically relevant doses of genotoxins. This approach also reveals localized susceptibility to chromosomal break …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In accordance with the 3 Rs to reduce in vivo testing, more advanced in vitro models, moving from 2D monolayer to 3D cultures, should be dev … igated by alamarBlue assay, flow cytometry and confocal imaging. DNA damage was investigated by the comet assay with and without Fpg enzyme for detection of DNA strand breaks and oxidized or alkylated base lesions. The results from the cyto- and genotoxicity tests showed differences in sensitivity comparing the 2D and 3D HepG2 models. This study shows that hu …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
On a global scale, the versatility and high sensitivity of the comet assay have promoted its use from different perspectives to determine genotoxic damage. With this in mind and through the formation of a Latin American group denominated "LA-COMET", a review of the manuscripts published by the group is proposed from the perspective of in vitro studies, using the alkaline comet assay. To facilitate the analysis of the 81 manuscripts published between 1996 and 2022, they were classified into four categories based on the type of agents evaluated by the assay: 1) environmental pollutants; 2) pesti…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anthropogenic activities, indiscriminate and rapid industrialization, as well as pursuance of a comfortable lifestyle have led to an increase in the use of industrial chemicals, pesticides, fossil fuels, polymers, new chemical entities, engineered nanomaterials, and nanocomposites. This has increased environmental pollution leading to adverse impact on all living beings including humans. Sensitive and robust test systems are thus required for accurate hazard identification and risk assessment. The Comet assay has been used widely as a simple, rapid, and sensitive tool for assessment of DNA dam…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Physica medica : PM : an international journal devoted to the applications of physics to medicine and biology : official journal of the Italian Association of Biomedical Physics (AIFB)2001eng
The comet assay is a sensitive and rapid method for DNA strand break detection in individual cells. The principle of break detection, using either the alkaline or neutral version of the assay, makes it a good technique for studying both double and single strand DNA breaks. Furthermore, the possibility of following DNA damage at different time moments also makes it possible to investigate the cell repair mechanisms. This explains why in the last few years there has been a tremendous increase in the number of laboratories which started to use this technique. The technique was first created for l…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Single cell gel electrophoresis or comet assay is used at present in the world to study of DNA damage, DNA repair and apoptosis. The aim of the work is to introduce the principle of comet assay to the medical community and to give a basic survey of its possible clinical applications. The article includes our first experience with this method in detection of apoptosis in bone marrow cells of patients with myelodysplastic syndrome (MDS).
METHODS AND RESULTS: The whole bone marrow aspirates from 6 patients with MDS and 7 control persons were processed by alkaline version of comet ass…
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conventional two-dimensional (2D) cell culture models for genotoxicity testing often yield false-positive results due to their limited metabolic capacity and lack of tissue architecture. Three-dimensional (3D) reconstructed human skin models offer a more physiologically relevant alternative for evaluating genotoxicity. In this study, the reproducibility, dose-response, and predictive performance of the micronucleus test (MNT) and comet assay were systematically assessed using 3D skin models EpiSkin-MNT and T-Skin. A panel of reference chemicals, including both genotoxic and non-genotoxic agent…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND Tongue cancer is the most prevalent of head and neck squamous cell carcinomas, including base of tongue cancer (BOT) and oral squamous cell carcinoma of the mobile tongue (OTSCC). We aimed to investigate the role of RIPOR3 in tumorigenesis and its development as a potential prognostic biomarker for tongue cancer, especially OTSCC. MATERIAL AND METHODS Associations of expression, clinical pathologic features, and overall survival were analyzed by logistic regression, multivariate Cox analysis, and Kaplan-Meier methods. Gene set enrichment analysis (GSEA) and the CIBERSORT algorithm w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Behcet's disease (BD) was originally described by Turkish dermatologist, Hulusi Behcet in 1937. BD is an inflammatory disorder of unknown ca … he assessment of genotoxicity. The most popular method is based on single cell gel electrophoresis (COMET assay) in alkaline condition. After electrophoresis, captured images are subjected to digital image analysis to find the values for percent tail DNA from comet assay parameters consistent with genotoxicity. COMET assay was performed in isolated lymphocyte …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundThe comet assay is a sensitive and widely used technique for assessing DNA damage at the single-cell level. Despite its advantages, traditional manual scoring methods remain time-consuming, subjective and limited in scalability, posing challenges for high-throughput and standardized analysis.ObjectiveThis study aims to develop and evaluate a deep learning-based system for automated comet assay image classification, addressing limitations of manual and semi-automated approaches while enhancing accuracy, reproducibility and processing efficiency.MethodA YOLOv5-based object detection mo…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The in vivo comet assay is a well-established genotoxicity test. It is currently mainly performed with somatic cells from different organs to detect a genotoxic activity of potential carcinogens. It is regarded as a useful test for follow-up testing of positive or equivocal in vitro test results and for the evaluation of local genotoxicity. However, the comet assay also has the potential to detect germ cell genotoxicity and may be used for demonstrating the ability of a substance or its metabolite(s) to directly interact with the genetic material of gonadal and/or germ cells. Such results are …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multicell spheroids were exposed to DNA-damaging agents with the aim of determining whether prompt DNA damage could be predictive for cell k … zine-1,4-dioxide (tirapazamine), and nitrogen mustard. Average DNA damage measured using the alkali comet assay generally correlated with cell killing irrespective of exposure times or drug concentration. However, better predictive power was achieved by using DNA damage levels in individual cells to identify the fraction of cells containing sufficient numbers …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A potential genotoxic effect of cigarette smoking has repeatedly been investigated with the comet assay (alkaline single cell gel electrophoresis) and conflicting results have been reported. Besides differences in the methodology and the study design used, genetic differences between the subjects investigated might contribute to the variability of test results. Considering genetic polymorphisms of genes involved in metabolism or DNA repair has led to a better discrimination of smoking-related genotoxic effects in some cases but also led to discrepant results. We therefore evaluated our baselin…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza virus A2/HK/68 is known to be a biological mutagen and teratogen. Reports are available implicating influenza virus as a causative agent of chromosomal aberrations in cells in culture and also in circulating leukocytes of humans. Also, an increased incidence of abortions, prenatal mortality and congenital abnormalities during the periods of epidemics has also been reported. In view of these reports, it would be worthwhile to screen persons especially pregnant women exposed to influenza virus for possible DNA damage. The present study reports the use of Comet assay to measure influenz…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Outer membrane vesicles (OMVs) from different Gram-negative bacteria, including Salmonella spp., have appeared as potential acellular vaccine candidates for their role in host-pathogen interaction by delivering virulence factors and modulating immune response. Given this host-cell contact, it is crucial to assess their genotoxic effects to ensure safety as vaccine candidates. The Comet assay, a sensitive and effective method for detecting single-cell DNA strand breaks, offers an effective approach for evaluating such effects. This study explores the application of the Comet assay as a highly s…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Isotretinoin is a retinoic acid frequently used in monotherapy or combined with narrow-band ultraviolet B (NBUVB) irradiation to treat patie … noin/day+NBUVB). The genotoxic effect was evaluated by the cytokinesis-blocked micronucleus and the comet assays. Our studies showed that isotretinoin alone was not genotoxic when tested in human lymphocytes in vitro and in vivo. There was no clear genotoxic effect in psoriatic patients treated with isotretinoin and NBUVB. The in vitro studies showed that iso …
Контролируемое клиническое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Within the pathology of human reproduction, genetic abnormalities play an important role in spontaneous abortions. This paper describes the morphologic, karyotypic features of a consecutive series of singleton spontaneous abortions collected as part of this study and also reports the application of the alkaline comet assay to assess levels of DNA damage in 31 couples comprised of 13 control couples and a patient group of 18 couples with a history of more than one fetal loss. For the cytogenetic analyses, the conventional lymphocyte culture method was applied to all subjects. In this analysis, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OECD TG 489 recognizes that some modifications of the in vivo comet assay (e.g., longer electrophoresis times) can detect DNA crosslink inductions expressed as DNA migration decreases. But the application of these methods in regulated safety testing has been limited because identifying an in vivo crosslinking positive control for every tissue that can be evaluated with the comet assay can be very challenging. Most crosslinking agents induce crosslinks in just one tissue (e.g., site of contact) with the agent's toxicity limiting exposure and effects induced in other tissues. This complication c…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Comet assay is a reproducible and sensitive assay for the detection of DNA damage in eukaryotic cells and tissues. Incorporation of lesion specific, oxidative DNA damage repair enzymes (for example, Fpg, OGG1 and EndoIII) in the standard alkaline Comet assay procedure allows for the detection and measurement of oxidative DNA damage. The Comet assay using white blood cells (WBC) has proven useful in monitoring DNA damage from environmental agents in humans. However, it is often impractical to performance Comet assay immediately after blood sampling. Thus, storage of blood sample is required…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования