The placenta is an organ vital to fetal development as well as the maintenance of a healthy pregnancy and plays a crucial role in developmental programming of the fetus. The mechanisms that link intrauterine milieu, fetal health and disease development later in life are poorly understood. Placenta-specific gene modulation, both by generating transgenic animals as well as by developing methods for in vivo genetic modifications is a growing area of interest as this approach provides the opportunity to investigate the role of particular genes or gene networks in regulating placental function and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA rearrangements are important in genome function and evolution. Genetic material can be rearranged inadvertently during processes such as DNA repair, or can be moved in a controlled manner by enzymes specifically dedicated to the task. DNA transposases comprise one class of such enzymes. These move DNA segments known as transposons to new locations, without the need for sequence homology between transposon and target site. Several biochemically distinct pathways have evolved for DNA transposition, and genetic and biochemical studies have provided valuable insights into many of these. Howeve…
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IS911 naturally produces transposase (OrfAB) derivatives truncated at the C-terminal end (OrfAB-CTF) and devoid of the catalytic domain. A majority species, OrfAB*, was produced at higher levels at 42 degrees C than at 30 degrees C suggesting that it is at least partly responsible for the innate reduction in IS911 transposition activity at higher temperatures. An engineered equivalent of similar length, OrfAB[1-149], inhibited transposition activity in vivo or in vitro when produced along with full-length transposase. We isolated several point mutants showing higher activity than the wild-type
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Treponema denticola is an oral spirochaete that has been strongly associated with chronic periodontitis. The bacterium exists as part of a d … ation of genes encoding several virulence factors, toxin-antitoxin systems and a family of putative transposases. Together, these data indicate that there is a higher potential for genetic mobility in T. denticola when growing as a biofilm and that these systems are important for the biofilm persistence and therefore virulence of this bacterium.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vertebrate brain development is associated with prominent neuronal cell death and DNA breaks, but their causes and functions are not well understood. DNA transposable elements could contribute to somatic genome rearrangements; however, their contributions to brain development are largely unknown. PiggyBac transposable element derived 5 (PGBD5) is an evolutionarily conserved vertebrate DNA transposase-derived gene with DNA remodeling activities in human cells. Here, we show that PGBD5 contributes to normal brain development in mice and humans, and its deficiency causes disorder of intellectual
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since the discovery that the recombination-activating gene (RAG) proteins were capable of transposition in vitro, investigators have been tr … ot only shed light on V(D)J recombination but also may provide insight into the regulation of other transposases.
Сравнительное исследованиеСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-associated transposons (CASTs) are Tn7-like elements that have co-opted RNA-guided CRISPR effectors for targeted DNA insertion. CASTs … r studies highlight molecular features underlying the efficiency of natural and engineered type I-F transposases and establish a mechanistic framework for their continued rational optimization.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many bacteria harbor simple transposable elements termed insertion sequences (IS). In Helicobacter pylori, the chimeric IS605 family elements are particularly interesting due to their proximity to genes encoding gastric epithelial invasion factors. Protein sequences of IS605 transposases do not bear the hallmarks of other well-characterized transposases. We have solved the crystal structure of full-length transposase (TnpA) of a representative member, ISHp608. Structurally, TnpA does not resemble any characterized transposase; rather, it is related to rolling circle replication (RCR) proteins.…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transposases have transformed genetic engineering, yet functional systems remain scarce. In response, an unknown transposase system from Acyrthosiphon pisum was identified by metagenomic screening. Through systematic optimization, we enhanced nuclear localization, transposon architecture, and created a hyperactive transposase variant to boost efficiency. Intriguingly, the combined application of the newly discovered transposase with inverted terminal repeat sequences from a related pea aphid species, Aphis craccivora, further enhanced transposition activity, resulting in the first chimeric tra…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The piggyBac DNA transposon is used widely in genome engineering applications. Unlike other transposons, its excision site can be precisely repaired without leaving footprints and it integrates specifically at TTAA tetranucleotides. We present cryo-EM structures of piggyBac transpososomes: a synaptic complex with hairpin DNA intermediates and a strand transfer complex capturing the integration step. The results show that the excised TTAA hairpin intermediate and the TTAA target adopt essentially identical conformations, providing a mechanistic link connecting the two unique properties of piggy
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The two-step transposition pathway of insertion sequences of the IS3 family, and several other families, involves first the form … at the secondary structure level. The results extend previous structure-function work on IS3 family transposases, identifying the binding domain as a three helix H + HTH bundle and explaining the function of an atypical leucine zipper-like motif in IS2. In addition gain- and loss-of-function mutations in the catalytic active site define its role in regional an …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: BAP1 is a histone deubiquitinase that acts as a tumor and metastasis suppressor associated with disease progression in human cancer. We have used the "Calling Card System" of transposase-directed transposon insertion mapping to identify the genomic targets of BAP1 in uveal melanoma (UM). This system was developed to identify the genomic loci visited by transcription factors that bind directly to DNA; our study is the first use of the system with a chromatin-remodeling factor that binds to histones but does not interact directly with DNA.
METHODS: The transposase piggyBac (PBase) w
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DAYSLEEPER encodes a domesticated transposase from the hAT-superfamily, which is essential for development in Arabidopsis thaliana. Little is known about the presence of DAYSLEEPER orthologs in other species, or how and when it was domesticated. We studied the presence of DAYSLEEPER orthologs in plants and propose a model for the domestication of the ancestral DAYSLEEPER gene in angiosperms.
RESULTS: Using specific BLAST searches in genomic and EST libraries, we found that DAYSLEEPER-like genes (hereafter called SLEEPER genes) are unique to angiosperms. Basal angiosperms as well a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transposases are ubiquitous mobile genetic elements responsible for genome development, driving rearrangements, such as insertions, deletions and translocations. Across species evolution, some transposases are tamed by their host and are made part of complex cellular systems. The proliferation of retroviruses is also dependent on transposase related enzymes termed integrases. Recombination‑activating gene protein (RAG)1 and metnase are just two examples of transposase domestication and together with retroviral integrases (INs), they belong to the DDE polynucleotidyl transferases superfamily. T…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To develop gene therapy tools based on CRISPR-associated transposons (CASTs), it is essential to define how transposon ends are recognized a … d protein-protein interface that is required for transposition efficiency. Our findings explain how transposases regulate the pairing of transposon end sequences for high-fidelity recognition, reveal a model of transposon-end synapsis, and suggest future avenues to engineer DNA cargo for genome-editing applications.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The current technologies to place new DNA into specific locations in plant genomes are low frequency and error-prone, and this inefficiency … ral ability of the TE to precisely excise and insert into the genome. Inspired by CRISPR-associated transposases that target transposition in a programmable manner in bacteria10-12, we fused the rice Pong transposase protein to the Cas9 or Cas12a programmable nucleases. We demonstrated sequence-specific targeted insertion (guided by the CRISPR gRNA) of enhance …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stable, high-level biosynthesis of complex natural products requires precise control of heterologous pathway expression, yet transcriptional architectures optimized on plasmids often fail when transferred to the chromosome. Here, we present ePathIntegrate, a genome-centric pathway engineering strategy that leverages CRISPR-associated transposases (CASTs) to integrate and rebalance multigene metabolic pathways in Escherichia coli. Direct genomic transfer of plasmid-optimized psilocybin and N,N-dimethyltryptamine (DMT) pathways resulted in a loss of productivity, driven by context-dependent prom…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stable expression of regulatory non-coding RNAs enables targeted cell engineering in Chinese hamster ovary (CHO) cells but commonly relies on random integration, resulting in variable expression. Here, we establish a transposase-mediated platform for stable microRNA (miRNA) expression in CHO cells and demonstrate the first application of a DNA transposon system for long-term miRNA genome integration. Using miR-3096b-5p, we compared piggyBac-mediated integration with conventional random integration in antibody-producing CHO cells. Transposase-mediated integration enabled rapid generation of sta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Assay for Transposase-Accessible Chromatin followed by sequencing (ATAC-seq) is a powerful and widely-used technique for chromatin accessibility profiling due to its low input requirement, simple protocol, high sensitivity, and ability to study single cells. ATAC-seq is a powerful tool in cancer epigenetics research that has enabled the scrutiny of gene regulatory mechanisms, aided the identification of therapeutic targets, and in the exploration of anticancer immunity, thereby advancing our understanding of cancer biology. The protocol includes five main steps: cell isolation and nuclei p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of transgenic mosquitoes that are refractory to the transmission of human diseases such as malaria, dengue, and yellow fever has received much interest due to the ability to transform a number of vector mosquito species with transposable elements. Transgenic strains of mosquitoes have been generated with molecular techniques that exhibit a reduced capacity to transmit pathogens. These advancements have led to questions regarding the fitness of transgenic mosquitoes and the ability of transformed mosquitoes to compete and effectively spread beneficial genes through nontransforme
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования