Bacterial signal transduction systems commonly use receiver (REC) domains, which regulate adaptive responses to the environment as a function of their phosphorylation state. REC domains control cell physiology through diverse mechanisms, many of which remain understudied. We have defined structural features that underlie activation of the multi-domain REC protein, PhyR, which functions as an anti-anti-σ factor and regulates transcription of genes required for stress adaptation and host-microbe interactions in Alphaproteobacteria. Though REC phosphorylation is necessary for PhyR function in viv…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cutaneous Leishmaniasis (CL) affects millions of people globally and has a significant impact on morbidity and mortality. Innate immune medi … alent in healthy controls (30.71 ± 8.44) while (20.57 ± 9.51) in CL-infected individuals. The class Alphaproteobacteria was found to be more in CL-infected individuals (5.47 ± 2.07) as compared to healthy controls (1.85 ± 0.39). The CL-infected individuals had a significantly lower relative abundance of the Clostridia class (p < 0.0001). An altered serum microbiome o …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Frequent and improper use of herbicides disrupts a plant's metabolism, causing oxidative stress that degrades crop quality. However, few stu … also decreased the microbial α diversity and, in particular, the abundance of Gammaproteobacteria, Alphaproteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidia, Verrucomicrobia, Bacilli, Acidimicrobiia, Deltaproteobacteria, and Gemmatimonadetes by disrupting the level of enzymes (e.g., urease and sucrase) and metabolites (indole-3-acetic acid, salicylic acid, apigenin, 4-hydrox …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rhinonyssidae (Mesostigmata) is a family of nasal mites only found in birds. All species are hematophagous endoparasites, which may damage t … , a previous study found evidence of a highly abundant putatively endosymbiotic bacteria from Class Alphaproteobacteria. Here, we expanded the sample size of this species (two different hosts- ten nasal mites from two independent samples per host), incorporated contamination controls, and increased sequencing depth in shotgun sequencing and genome-resolved metagenomi …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oxalic acid and its oxalate salts have been linked to kidney stones and other health problems and about 80% kidney stones are made up of calcium oxalate. Oxalyl coenzyme A decarboxylase (OXC) is a key enzyme in the catabolism of oxalate. In this study, we performed bioinformatic and biochemical analysis of OXC. First, we mined the OXC sequences from a public protein database and collected 1396 putative OXC sequences. These sequences were widely spread and mainly distributed in Actinobacteria, Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, and Betaproteobacteria and classified into seven clusters. T…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lake Uchum is a newly defined meromictic lake in Siberia with clear seasonal changes in its mixolimnion. This study characterized the temporal dynamics and vertical profile of bacterial communities in oxic and anoxic zones of the lake across all four seasons: October (autumn), March (winter), May (spring), and August (summer). Bacterial richness and diversity in the anoxic zone varied widely between time points. Proteobacteria was the dominant bacterial phylum throughout the oxic and anoxic zones across all four seasons. Alphaproteobacteria (Loktanella) and Gammaproteobacteria (Aliidiomarina) …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In tropical and subtropical oceanic surface waters phosphate scarcity can limit microbial productivity. However, these environments also hav … ed periods of phosphate depletion. In these regions, C-P lyase was prevalent in several lineages of Alphaproteobacteria (Pelagibacter, SAR116, Roseobacter and Rhodospirillales), Gammaproteobacteria, and Actinobacteria. The global scope of this analysis supports previous studies that infer phosphonate catabolism via C-P lyase is an important adaptive strategy implemen …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe a novel biosynthetic pathway for glycerophosphoinositides in Rhodothermus marinus in which inositol is activated by cytidine tri … ositol. Database searching showed homologous proteins in two bacterial classes, Sphingobacteria and Alphaproteobacteria. This is the first report of the involvement of CDP-inositol in phospholipid synthesis.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heavy metal pollution impacts on soil microorganisms are of growing concern. This study employed high-throughput sequencing and qPCR to investigate rhizosphere microbial communities and functional genes responses in ryegrass (Lolium perenne L.) under cadmium (Cd) stress. Results showed dose-dependent shifts in microbial diversity, metabolic pathways and functional gene abundance. The relative abundances of bacterial classes Alphaproteobacteria and Bacteroidia and genera Cellvibrio and Algoriphagus increased with Cd levels, suggesting roles in Cd adaptation. The classes Actinobacteria, Sacchari…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cold-water coral reefs host diverse microbial communities that play key roles in nutrient cycling and deep-sea productivity. Among them, met … to 16S rRNA gene sequences affiliated with sponge-associated Gammaproteobacteria and Methylocystis (Alphaproteobacteria). Supported by searching the genera's genomes, these findings reveal a broad range of bacteria potentially active in C1 cycling within deep, cold-water reef ecosystems.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to evaluate the microbiological quality and functional properties of Moringa oleifera Lam. leaves from plants cultivated in … colonies of undesired microorganisms in PMOLs. The MiSeq Illumina analysis revealed that the class Alphaproteobacteria was dominant (83.20% of Relative Abundance) among bacterial groups found in PMOLs. The hydroalcoholic extract from PMOLs exhibited strong redox-active properties in solution assays and provided antioxidant protection in a cell-based lipid peroxidati …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two novel natural products, the polyketide cuniculene and the peptide antibiotic aquimarin, were recently discovered from the marine bacteri … nd an inhibitory activity of most Aquimarina strains against Candida glabrata and marine Vibrio and Alphaproteobacteria species. Aquimarina sp. Aq135 and Aquimarina muelleri crude extracts showed particularly promising antimicrobial activities, amongst others against methicillin-resistant Staphylococcus aureus. The metabolomic and functional genomic profiles of Aquim …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The fitness of the endangered green sea turtle (Chelonia mydas) may be strongly affected by its gut microbiome, as microbes play important r … (14.7 ± 21.7%). Additionally, we found the presence of two red algae bacterial indicator ASVs (the Alphaproteobacteria Brucella pinnipedialis with 75 ± 0% and a Gammaproteobacteria identified as methanotrophic endosymbiont of Bathymodiolus, with <1%) in cloacal compartments, along with six bacterial ASVs shared only between cloacal and local environmental red algae …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two alphaproteobacterial strains, designated EGI L300112T and EGI L300120, were isolated from sediment collected from Chaiwopu Lake in Xinjiang, China. The taxonomic position of the two strains was determined using polyphasic taxonomic analysis and phylogenomic analysis. Based on 16S rRNA gene sequence similarities, strain EGI L300112T and EGI L300120 were both closely related to Pelagerythrobacter rhizovicinus AY-3RT and shared the highest sequence identities of 96.2% and 96.3%, respectively. However, phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene and genomes clearly demonstrated that the t…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A Gram-stain-negative bacterium, designated YJ20T, was isolated from rhizosphere soil of a spinach farmland at Shinan in Korea. Strain YJ20T was found to be aerobic, non-motile rods which can grow at 10-33 °C (optimum, 28 °C), at pH 6.5-8.5 (optimum, pH 6.5-7.5) and in the absence of NaCl. The 16S rRNA gene sequence analysis showed that strain YJ20T belongs to the genus Altererythrobacter with moderate sequence similarities to Altererythrobacter dongtanensis KCTC 22672T (96.8%), Altererythrobacter soli MN-1T (96.6%) and Altererythrobacter xinjiangensis S3-63T (96.5%). The phylogenomic analysis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dinitrogen (N2) fixation was investigated together with organic matter composition in the mesopelagic zone of the Bismarck (Transect 1) and Solomon (Transect 2) Seas (Southwest Pacific). Transparent exopolymer particles (TEP) and the presence of compounds sharing molecular formulae with saturated fatty acids and sugars, as well as dissolved organic matter (DOM) compounds containing nitrogen (N) and phosphorus (P) were higher on Transect 1 than on Transect 2, while oxygen concentrations showed an opposite pattern. N2 fixation rates (up to ~1 nmol N L-1 d-1) were higher in Transect 1 than in Tra
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Australian paralysis tick (Ixodes holocyclus) is of significant medical and veterinary importance as a cause of dermatological and neurological disease, yet there is currently limited information about the bacterial communities harboured by these ticks and the risk of infectious disease transmission to humans and domestic animals. Ongoing controversy about the presence of Borrelia burgdorferi sensu lato (the aetiological agent of Lyme disease) in Australia increases the need to accurately identify and characterise bacteria harboured by I. holocyclus ticks.
METHODS: Universal P
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acid mine drainage (AMD) can lead to severe pollution of surrounding aquatic systems like rivers. Although microbial ecosystems have been do … abitats, the relative abundances of Gamma- and Beta-proteobacteria decreased along the river, while Alphaproteobacteria and Acidobacteriota increased. Conversely, water habitats were characterized by Acidovorax and Acidocella. Furthermore, the alpha diversity of rare taxa showed no significant correlation with spatial distance in either sediment or water habitats. Ho …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The role of the microbiome in COVID-19 outcomes remains an area of exploration. We comprehensively explored the gut microbiome o … tunistic pathogens like Enterococcus species, along with a decrease in beneficial microbes, such as Alphaproteobacteria, when comparing mild and severe cases. Machine-learning identified age and microbes like Ruminococcaceae, Bacilli, Enterobacteriales, porphyromonadaceae and Prevotella copri as predictive of severity.
CONCLUSION: The microbiome likely plays a role …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction: The study aimed to provide a systematic review and analysis of previously reported studies investigating the association betwe … spp., Faecalibacterium spp., Bifidobacterium spp., Xanthomonadales spp., Gammaproteobacteria spp., Alphaproteobacteria spp., Bacteroides spp., Sphingomonas spp., Streptococcus agalactiae, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Chlamydia trachomatis, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum or Group B Streptococcus begin to dominate, leading to PPROM. Recognising …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования