Extracts of human lymphoblastoid cells catalyzed complete release of uracil (Ura) from PBS1 DNA, which contains Ura instead of thymine as a normal component (Ura-DNA), and 3-methyladenine (3-MeAde) from DNA methylated with methyl methanesulfonate (Me-DNA). These two activities, Ura-DNA glycosylase and 3-MeAde-DNA glycosylase, differed in heat stability. Cell extracts released Ura more rapidly and 3-MeAde more slowly from alkali-denatured preparations of Ura- and Me-DNA, respectively, than from native DNA's. On incubation with reconstituted chromatins, prepared from Ura-DNA and Me-DNA, respecti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Contemporary cardiovascular disease (CVD) risk equations may not fully capture cumulative biological aging or long-term exposure burden. DNA methylation (DNAm) biomarkers may capture aging- and exposure-related biology, but their incremental prognostic value beyond clinical risk-factor models like PREVENT remains uncertain. To our knowledge, no prior study has benchmarked DNAm-based biomarkers with PREVENT.
METHODS: In a population-based cohort study, we analyzed NHANES 1999-2002 participants with DNAm biomarkers and mortality follow-up. We derived a DNAmScore from candidate DNAm …
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is the most abundant epigenetic modification on the human genome and plays a critical role in gene regulation, development, and is altered in many diseases. Since its discovery over a century ago, advancements in our understanding of DNA methylation have enabled the development of programmable epigenome editors for manipulating DNA methylation at target genomic loci for use in fundamental research and clinical applications. In this review, we describe major findings in the field of DNA methylation biology and how these findings have been utilized to build DNA methylation-based …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Apart from a few subtype-specific genetic alterations, pituitary neuroendocrine tumours (PitNETs) exhibit a limited number of recurrent genetic alterations, emphasising the pivotal role of epigenetic dysregulation in their pathogenesis. DNA methylation has been widely investigated in PitNETs and has been associated with tumour subtypes, tumour biology, and clinical outcome. Most studies use methodologies that cannot distinguish between methylation and active demethylation. DNA methylation is a dynamic and reversible process, governed by a tightly regulated cycle involving 5-methylcytosine and …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epigenomic testing complements sequence-based analysis by detecting downstream changes in epigenomic state associated with genetic variation. Genome-wide DNA methylation episignatures are reproducible molecular phenotypes that can serve as biomarkers of specific Mendelian disorders, particularly those involving chromatin regulators, DNA methylation machinery, and transcriptional regulatory pathways.
METHODS: We reviewed the biological basis, laboratory methodology, analytical approaches and clinical applications of DNA methylation episignature testing, with emphasis on neurodevelo…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Bronchiectasis is a chronic lung respiratory disease whose systemic aspect is poorly understood. We aimed to characterise the blood DNA methylation profiles of bronchiectasis patients and to determine the relationship of these profiles with disease severity and their functional relevance to circulating immune cells.
METHODS: Whole-genome DNA methylation was measured in blood from 165 bronchiectasis patients (Illumina 850k). The cohort was divided into discovery (n=94) and validation (n=71) sets. Differentially methylated positions (DMPs) associated with the Bronchiectasis Severity …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation alterations are well-established contributors to carcinogenesis, yet, in the tumor microenvironment (TME), patterns of lineage and cell-specific methylation alterations are not well understood. Single-cell DNA methylation profiling in the TME is limited by technical challenges and high costs. Here, we use bulk DNA methylation, cell type deconvolution (HiTIMED), and an interaction testing framework (CellDMC) to identify reproducible, computationally inferred lineage-specific epigenetic alterations in the TME supported by orthogonal data sources. Tumor endothelial cells (TECs), c…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a progressive neurodegenerative disorder influenced by both genetic and epigenetic mechanisms. Among these mechanisms, DNA methylation has emerged as a key regulatory process affecting gene expression without altering the DNA sequence. The synuclein alpha (SNCA) gene is a well-established contributor to Parkinson's disease pathogenesis, yet the extent and consistency of its methylation changes remain unclear. This scoping review aimed to map and summarise existing evidence on DNA methylation changes associated with PD in the SNCA gene. A scoping review methodology g…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sex differences in the function and morphology of the human placenta can lead to sex differences in pregnancy outcomes. X chromosome inactivation (XCI) is the primary mechanism for dosage compensation between the sexes, and is strongly associated with X-chromosome promoter DNA methylation (DNAme) in somatic cells. However, in the placenta, low X-chromosome promoter DNAme has been reported. The placenta is a complex organ consisting of cells of different developmental origins, but the sex differences in DNAme by specific cell types have not been investigated.
METHODS: We examined s…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ankylosing spondylitis (AS) is a persistent autoimmune disorder marked by inflammation of the spine and sacroiliac joints, along with atypical bone development. In recent years, DNA methylation, a significant epigenetic modification, has become a pivotal element affecting AS pathogenesis, disease progression, and clinical diagnosis. This review summarizes what we know so far about abnormal DNA methylation patterns in AS-related genes like DKK1, ERAP1, PDCD1, FOXO1/3a, LGR6, and IRF5, as well as how these patterns affect gene expression. It examines the interaction between DNA methylation and e…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is almost completely erased throughout the genome in primordial germ cells, and then reestablished during mammalian germ cell development. In this study, we demonstrate that in three primate species-marmosets, macaques, and humans-de novo methylation occurs postnatally in prospermatogonia in males and growing oocytes in females. In monkey prospermatogonia, de novo methylation is a prolonged process spanning 6 months to 1 year, primarily occurring within the first year after birth. In human testes, this process may occur more slowly over an extended period. Single-cell bisulfite…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cardia cancer (GCC) is an aggressive malignancy with poor prognosis, underscoring the need for better characterization of molecular alterations during early gastric cardia carcinogenesis. This study aimed to identify and validate tissue-based DNA methylation markers associated with early precancerous and neoplastic lesions of the gastric cardia. We integrated genome-wide DNA methylation data (850 K array) from 69 gastric cardia samples, including normal mucosa (n = 22), intestinal metaplasia (IM, n = 32), intraepithelial neoplasia (IEN, n = 7), and GCC (n = 8). Differential methylation…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CVDs arise from the interplay of multiple factors, with genetics and environmental exposures representing key drivers. Accumulating evidence over recent decades has unequivocally established that epigenetic modifications, most prominently DNA methylation, play a pivotal, non-redundant role in the initiation, development, and progression of CVDs. As a critical molecular bridge linking genetic predisposition, environmental insults, and the pathogenesis of CVDs, DNA methylation dynamically mediates crosstalk among these three components, thereby emerging as a core focus for dissecting the underly…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA methylation is an epigenetic modification that regulates gene expression in response to environmental exposures. We measured differential DNA methylation levels in blood before after general anesthesia and surgery in participants with and without postoperative delirium (POD) and postoperative neurocognitive disorder (PNCD).
METHODS: Blood sampling, delirium assessment and cognitive testing were prospectively performed at baseline before non-cardiac, non-neurologic surgery, and at 24 hours (24h) and 6 weeks (6wk) thereafter in 94 participants comprising 13 with POD and 81 witho…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetes mellitus (DM) is a complex metabolic disorder with polygenic inheritance.The morbidity associated with DM and its complications, especially the microvascular complication of diabetic nephropathy (DN), is tremendous, with a high disease burden globally and in India. A literature search has identified various studies on genetic and epigenetic factors in the pathophysiological processes of DN. However, epigenetics knowledge is limited and requires ongoing research into DN pathogenesis, progression, and outcome mechanisms. Therefore, this study was proposed to conduct a genome
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ovarian cancer (OC) remains difficult to detect at an early stage, and current screening approaches using CA125 and transvaginal ultrasonography have not demonstrated sufficient benefit for population screening. DNA methylation is a promising biomarker class because epigenetic alterations may arise early in tumourigenesis, can be detected in circulating cell-free DNA (cfDNA), and may provide tissue-of-origin information. This review critically evaluates recent evidence on DNA methylation biomarkers for early OC detection. PubMed/MEDLINE, Web of Science, and Scopus were searched for studies pub…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic cancer (PC) is characterized by its aggressive nature, limited options for radiochemotherapy, and poor prognosis, highlighting the urgent need for the identification of novel therapeutic targets to broaden treatment strategies.
METHODS: We employed a two-sample Mendelian randomization (MR) approach, utilizing genetically informed druggable genes to identify key genes associated with PC risk. To validate these candidate targets, we conducted sensitivity, colocaliztion, and summary data-based MR (SMR) analyses. Furthermore, DNA methylation mediation analysis was utilized …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The methylation of DNA is a prevalent epigenetic modification that plays a crucial role in the pathological progression of ocular diseases. DNA methylation can regulate gene expression, thereby affecting cell function and signal transduction. Ophthalmic diseases are a kind of complex diseases, and their pathogenesis involves many factors such as genetic, environmental and individual differences. In addition, inflammation, oxidative stress and lipid metabolism, which abnormal DNA methylation is closely related to, are also considered to be major factors in eye diseases. The current understandin…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oocyte maturation involves both nuclear and cytoplasmic processes that are critical for the acquisition of oocyte competence. Granulosa cells, surrounding the oocyte, play a pivotal role in the maturation process, with mechanisms such as cAMP signaling significantly influencing oocyte development. Epigenetic mechanisms - including DNA methylation and its oxidative derivatives, histone post-translational modifications and chromatin remodeling - interfere with the accessibility of transcription factors to regulatory regions of the genome, such as promoter regions of genes, hence generally regula…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kidney transplantation (KTx) is the method of choice for treating kidney failure. Identifying biomarkers predictive of transplant (Tx) outcomes is critical to optimize KTx; however, the immunosuppressive therapies required after KTx must also be considered. We applied targeted bisulfite sequencing (TBS-seq) to PBMCs isolated from 90 patients, with samples collected pre- and post-Tx (day 90), to measure DNA methylation changes. Our findings indicate that the PBMC DNA methylome is significantly affected by induction immunosuppression with anti-thymocyte globulin (ATG). We discovered that the ris…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования