BACKGROUND: In the present study, we aimed to explore whether common genetic targets or signaling pathways existed in chemical cystitis.
METHODS: Gene Expression Omnibus (GEO) database was used to search the related gene expression profiles. The differentially expressed genes (DEGs) were identified by using GEO2R. The DAVID 6.8 Beta and R software were used to perform Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway analysis and Gene Ontology function analysis of DEGs. The protein-protein interaction network was constructed by STRING 11.0 to reveal the potential gene interactions. The expressi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Existing studies on PROTAC technology frequently rely on modifications and validation of already marketed drugs, which limits the exploration of non-drug-forming proteins and targets that do not have existing therapeutic agents. In contrast, utilizing easily synthesized combinatorial chemical databases that offer a broad selection of compounds presents a promising strategy for discovering new PROTAC molecules. In this study, virtual screening was conducted on a small molecule database created using combinatorial chemistry, which contains a total of 12,904 active molecules. A potential CDK6 inh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Farming is one of the most important components of most economies. No comprehensive picture exists of the health status of Iranian farmers and the work-related hazards that affect them. We aimed to determine the gaps in the current knowledge regarding the occupational health of Iranian farmworkers. Electronic databases including Medline, Web of Science, Scopus, and Embase, as well as national databases including the Scientific Information Database, MagIran, and Barakat Knowledge System, were searched for articles published through March 2017. All epidemiologic studies regarding the occupationa
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the advent of artificial intelligence (AI), it is now possible to design diverse and novel molecules from previously unexplored chemical space. However, a challenge for chemists is the synthesis of such molecules. Recently, there have been attempts to develop AI models for retrosynthesis prediction, which rely on the availability of a high-quality training dataset. In this work, we explore the suitability of large language models (LLMs) for extraction of high-quality chemical reaction data from patent documents. A comparative study on the same set of patents from an earlier study showed t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biofilms play an important role in the antibiotic drug resistance, which is threatening public health globally. Almost, all microbes mimic multicellular lifestyle to form biofilm by undergoing phenotypic changes to adapt adverse environmental conditions. Many anti-biofilm agents have been experimentally validated to disrupt the biofilms during last three decades. To organize this data, we developed the 'aBiofilm' resource (http://bioinfo.imtech.res.in/manojk/abiofilm/) that harbors a database, a predictor, and the data visualization modules. The database contains biological, chemical, and stru
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to their strong dependence on local atonic environments, NMR chemical shifts are among the most powerful tools for strucutre elucidation of powdered solids or amorphous materials. Unfortunately, using them for structure determination depends on the ability to calculate them, which comes at the cost of high accuracy first-principles calculations. Machine learning has recently emerged as a way to overcome the need for quantum chemical calculations, but for chemical shifts in solids it is hindered by the chemical and combinatorial space spanned by molecular solids, the strong dependency of c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the most prominent topics in drug discovery is efficient exploration of the vast drug-like chemical space to find synthesizable and novel chemical structures with desired biological properties. To address this challenge, we created the DrugSpaceX (https://drugspacex.simm.ac.cn/) database based on expert-defined transformations of approved drug molecules. The current version of DrugSpaceX contains >100 million transformed chemical products for virtual screening, with outstanding characteristics in terms of structural novelty, diversity and large three-dimensional chemical space coverage.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The majority of primary and secondary metabolites in nature have yet to be identified, representing a major challenge for metabolomics studies that currently require reference libraries from analyses of authentic compounds. Using currently available analytical methods, complete chemical characterization of metabolomes is infeasible for both technical and economic reasons. For example, unambiguous identification of metabolites is limited by the availability of authentic chemical standards, which, for the majority of molecules, do not exist. Computationally predicted or calculated data are a via
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The primary purpose of this study was to examine patterns in the reliance on respiratory tract irritation as a toxicological basis for occupational exposure limits (OELs), focused on U.S.-based OELs. This study pursued three aims: (1) to evaluate the degree to which OELs are based on respiratory irritation, or more broadly, on respiratory effects; (2) to assess the variability in the OEL values across organizations; and (3) to determine how well surrogate endpoints align with respiratory irritation for OELs having respiratory tract effects as their critical effect. To address these aims, a dat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purchasable chemical space has grown rapidly into the tens of billions of molecules, providing unprecedented opportunities for ligand discovery but straining the tools that might exploit these molecules at scale. We have therefore developed ZINC-22, a database of commercially accessible small molecules derived from multi-billion-scale make-on-demand libraries. The new database and tools enable analog searching in this vast new space via a facile GUI, CartBlanche, drawing on similarity methods that scale sublinearly in the number of molecules. The new library also uses data organization methods
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: The lung is uniquely positioned for chemical inhalation exposures considering its direct communication with the environment. Childhood interstitial lung diseases (chILD) syndrome is a rare and heterogeneous group of pediatric lung diseases. Despite common inhalation exposures, few studies have associated chemical inhalation exposures with chILD. The purpose of this review was to assess for chILD syndromes following toxic chemical inhalation exposures.
METHODS: PubMed and Embase databases were searched with the following inclusion criteria: (1) toxic chemical inhalation exposure, (2
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Use of physical and chemical restraints are common in residential aged care facilities worldwide. Restraint use can pose harm to residents even causing deaths.
OBJECTIVE: To synthesize the prevalence and variability in physical and chemical restraint use, and examine factors that may contribute to this variability of prevalence rates.
METHODS: Six health science databases were searched from inception up to 21st January 2020. Quantitative studies investigating restraint use in residential aged care facilities that reported data from year 2000 onwards were included. Meta-analyses o
СтатьяМетаанализСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Trends in male reproductive health have been reported for increased rates of testicular germ cell tumors, low semen quality, cryptorchidism, and hypospadias, which have been associated with prenatal environmental chemical exposure based on human and animal studies.
OBJECTIVE: In the present study we aimed to identify significant correlations between environmental chemicals, molecular targets, and adverse outcomes across a broad chemical landscape with emphasis on developmental toxicity of the male reproductive system.
METHODS: We used U.S. EPA's animal study database (ToxRefDB) a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Descriptions of molecular environments have many applications in chemoinformatics, including chemical shift prediction. Hierarchically ordered spherical environment (HOSE) codes are the most popular such descriptions. We developed a method to extend these with stereochemistry information. It enables distinguishing atoms which would be considered identical in traditional HOSE codes. The use of our method is demonstrated by chemical shift predictions for molecules in the nmrshiftdb2 database. We give a full specification and an implementation.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chemical shift assignment in solid-state nuclear magnetic resonance (NMR) is a challenging process that usually relies on a set of 1D and 2D experiments to determine the assignment by establishing connectivities along the covalent backbone. A Bayesian probabilistic assignment method was recently introduced based on a fragment analysis using a database of chemical shifts. Here, we propose a fast 3D structure validation method that utilizes predictions from a crystal structure as a starting point for Bayesian probabilistic chemical shift assignment. We demonstrate the approach with improved conf
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymer informatics has emerged as an area of interest in the search for more sustainable plastics. Yet, there is a dearth in large, high-quality, polymer-based materials databases that are open-source for the polymer research community. Efforts to curate such databases involve autogenerating large experimental materials databases by mining chemical data from scientific literature, with a specific focus on mining tabular data as these are particularly rich sources of polymeric information. This study compares the performance of two tools in extracting large volumes of tabular data about polyme
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: The genus Polygonatum (Asparagaceae) comprises 71 species distributed throughout the temperate Northern Hemisphere. The medicinal plants of Polygonatum have been traditionally used as tonics in China, India, Pakistan, Iran and Japan, and have been demonstrated to be highly effective in clinical practice for treating age-related diseases, diabetes, lung diseases, fatigue, feebleness and indigestion.
AIM OF THE REVIEW: This paper aims to provide the links among traditional uses, chemical constituents, pharmacological effects and toxicity to support their therapeu
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The liver is a vital organ in vertebrates that can be subject to disease, among others due to exposure to toxic xenobiotic compounds. A group of transcription factors named ligand activated nuclear receptors (LANR) influence and regulate important liver functions, and can be activated by many xenobiotic compounds, which thereby can cause hepatotoxicity. Systematic analysis of the gene pathways regulated by LANR using modern 'omics technologies is important for investigating modes-of-action of hepatotoxicants. So far, these pathways are not publicly available in a format that allows these studi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cleft palate has been linked to both genetic and environmental factors that perturb key events during palatal morphogenesis. As a developmental outcome, it presents a challenging, mechanistically complex endpoint for predictive modeling. A data set of 500 chemicals evaluated for their ability to induce cleft palate in animal prenatal developmental studies was compiled from Toxicity Reference Database and the biomedical literature, which included 63 cleft palate active and 437 inactive chemicals. To characterize the potential molecular targets for chemical-induced cleft palate, we mined the Tox
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The goal of eliminating animal testing in the predictive identification of chemicals with the intrinsic ability to cause skin sensitization is an important target, the attainment of which has recently been brought into even sharper relief by the EU Cosmetics Directive and the requirements of the REACH legislation. Development of alternative methods requires that the chemicals used to evaluate and validate novel approaches comprise not only confirmed skin sensitizers and non-sensitizers but also substances that span the full chemical mechanistic spectrum associated with skin sensitization. To t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.