beta-Spectrin is an erythrocyte membrane protein that is defective in many patients with abnormalities of red blood cell shape including hereditary spherocytosis and elliptocytosis. It is expressed not only in erythroid tissues but also in muscle and brain. We wished to determine the regulatory elements that determine the tissue-specific expression of the beta-spectrin gene. We mapped the 5'-end of the beta-spectrin erythroid cDNA and cloned the 5'-flanking genomic DNA containing the putative beta-spectrin gene promoter. Using transfection of promoter/reporter plasmids in human tissue culture
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infection of Nicotiana tabacum Samsun NN with tobacco mosaic virus (TMV) results in a hypersensitive plant response and leads to systemic acquired resistance (SAR). The induction of SAR is mediated by the plant hormone salicylic acid (SA) and is accompanied by the induced expression of a number of genes including the pathogenesis-related (PR) gene 1a. Previously, it has been found that TMV infection and SA treatment resulted in a reduction of binding of nuclear protein GT-1 to far-upstream regions (-902 to -656) of the PR-1a gene. To test if GT-1 is a negative regulator of PR-1a gene expressio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Even though elongation factor 4 (EF4) is the third most conserved protein in bacteria, its physiological functions remain largely unknown and its proposed molecular mechanisms are conflicting among previous studies. In the present study, we show that the growth of an Escherichia coli strain is more susceptible to tetracycline than its EF4 knockout strain. Consistent with previous studies, our results suggested that EF4 affects ribosome biogenesis when tetracycline is present. Through ribosome profiling analysis, we discovered that EF4 causes 1-nucleotide shifting of ribosomal footprints on mRN
СтатьяОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chinese hamster ovary (CHO) cells are used to produce almost 90% of therapeutic monoclonal antibodies (mAbs) and antibody fusion proteins (Fc-fusion). The annotation of non-canonical translation events in these cellular factories remains incomplete, limiting our ability to study CHO cell biology and detect host cell protein (HCP) impurities in the final antibody drug product. We utilised ribosome footprint profiling (Ribo-seq) to identify novel open reading frames (ORFs) including N-terminal extensions and thousands of short ORFs (sORFs) predicted to encode microproteins. Mass spectrometry-bas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteria sense and respond to the stress of phosphate limitation, anticipating Pi deletion/starvation via the two-component PhoR-PhoP system. The role of the response regulator PhoP in primary metabolism and avermectin biosynthesis in Streptomyces avermitilis was investigated. In response to phosphate starvation, S. avermitilis PhoP, like Streptomyces coelicolor and Streptomyces lividans PhoP, activates the expression of phoRP, phoU, and pstS by binding to the PHO boxes in their promoter regions. Avermectin biosynthesis was significantly increased in ΔphoP deletion mutants. Electrophoretic mob
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The strand-separation activity that is important for many cellular DNA processing machineries is provided by DNA helicases. In order to understand the physiological properties of a helicase acting in the context of its macromolecular machinery, it is imperative to identify the proteins that interact with the enzyme and to analyze how these proteins affect its helicase activities. The archaeal Rad3 helicase XPD (xeroderma pigmentosum group D protein) from Ferroplasma acidarmanus (FacXPD) is a superfamily II 5'-->3' DNA helicase. Similar to its mammalian homolog working as an integral part of th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus aureus is the causative agent of serious human health conditions, such as sepsis, endocarditis, and necrotizing pneumonia, as well as less severe clinical manifestations including epithelial and mucosal infections. This pathogen expresses a wide range of surface virulence factors, among which fibronectin-binding proteins play a crucial role in both bacterial adhesion and infection of host cells. Fibronectin is utilized by S. aureus during the early stages of infection to form a protective coating that shields the bacterium from host defenses, facilitating adhesion to the extrace
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD), a widespread environmental contaminant and suspected human carcinogen, is believed to act by altering expression of a number of genes involved in cell growth control. In a previous study, we demonstrated the transcriptional down regulation of transforming growth factor-beta2 (TGF-beta2) by TCDD. To identify the region of the TGF-beta2 promoter necessary for the observed down-regulation by TCDD, we studied the effect of TCDD on a series of TGF-beta2 gene promoter deletions ranging from 1391 to 64 base pairs upstream of the transcription start site. We
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human T-cell lymphotropic virus type I (HTLV-I) transactivator, Tax, the ubiquitous transcriptional factor cyclic AMP (cAMP) response element-binding protein (CREB protein), and the 21-bp repeats in the HTLV-I transcriptional enhancer form a ternary nucleoprotein complex (L. J. Zhao and C. Z. Giam, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:7070-7074, 1992). Using an antibody directed against the COOH-terminal region of Tax along with purified Tax and CREB proteins, we selected DNA elements bound specifically by the Tax-CREB complex in vitro. Two distinct but related groups of sequences containing the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We address the limitations of the low binding capacity of smooth metal affinity surfaces (below 1.661 femtomoles per mm2) and the well-documented low sensitivity of DESI-MS toward larger proteins by increasing the specific surface area of the sampling substrate, thereby providing a greater binding capacity per unit area of the desorption footprint. This was achieved using Ni-NTA-functionalized magnetic beads adhered to a flat surface. Close packing of the spherical beads provides a greater surface area, yielding an increased protein binding capacity as high as 4.028 nmol per mm2 of sampled sur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microfabricated methods to compartmentalize neurons have become essential tools for many neuroscientists. This protocol describes the use of a commercially available pre-assembled plastic chip for compartmentalizing cultured primary rat hippocampal neurons. These plastic chips, contained within the footprint of a standard microscope slide, are compatible with high-resolution, live, and fluorescence imaging. This protocol demonstrates how to retrograde label neurons via isolated axons using a modified rabies virus encoding a fluorescent protein, create isolated microenvironments within one comp
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meningitis is the most serious of invasive infections caused by the Gram-positive bacterium Streptococcus pneumoniae. Vaccines protect only against a limited number of serotypes, and evolving bacterial resistance to antimicrobials impedes treatment. Further insight into the molecular pathogenesis of invasive pneumococcal disease is required in order to enable the development of new or adjunctive treatments and/or pneumococcal vaccines that are efficient across serotypes. We applied genomic array footprinting (GAF) in the search for S. pneumoniae genes that are essential during experimental men
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DevR-DevS two-component system of Mycobacterium tuberculosis mediates bacterial adaptation to hypoxia, a condition believed to be associated with the initiation and maintenance of dormant bacilli during latent tuberculosis. The activity of the Rv3134c-devRS operon was studied in M. tuberculosis using several transcriptional fusions comprised of promoter regions and the gfp reporter gene under inducing and aerobic conditions. Aerobic transcription was DevR independent, while hypoxic induction was completely DevR dependent. The hypoxia transcriptional start point, T(H), was mapped at -40 bp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In a recent gene-trap screen, we identified the gene coding for Epidermal Bullous Pemphigoid Antigen 1 (BPAG1) as a putative transcriptional target of Engrailed and of other homeoproteins with a glutamine in position 50 of their homeodomain. We now show that the nuclear addressing of the homeodomains of Engrailed (EnHD) and Antennapedia (AntpHD) upregulates BPAG1e transcription in immortalized human keratinocytes (GMA24FIA) expressing En1. This upregulation is not observed with AntpHD-Q50A, a variant of AntpHD in which a single mutation abolishes its high-affinity binding to target DNA, thus s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
5-Azacytidine (5-AzaC) is a cytidine analog and is widely used to treat myelodysplastic syndromes (MDS) and acute myeloid leukemia (AML). Although its therapeutic activity is primarily attributed to hypomethylation resulting from DNA incorporation, the majority of 5-AzaC is incorporated into RNA. However, the functional consequences of 5-AzaC incorporation into RNA have been unknown. Here, we show that 5-AzaC treatment of cells leads to inhibition of protein synthesis. Ribo-seq, Disome-seq, and RNA-seq in cells treated with 5-AzaC exhibit a time-dependent C-to-G transversion signature in mRNAs
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Open reading frames are common in long noncoding RNAs (lncRNAs) and 5'UTRs of protein coding transcripts (uORFs). The question of whether those ORFs are translated was recently addressed by several groups using ribosome profiling. Most of those studies concluded that certain lncRNAs and uORFs are translated, essentially based on computational analysis of ribosome footprints. However, major discrepancies remain on the scope of translation and the translational status of individual ORFs. In consequence, further criteria are required to reliably identify translated ORFs from ribosome
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 3-nitropropionic acid animal model is a model where excitotoxicity, mitochondrial dysfunction and oxidative stress, mechanisms common to various neurodegenerative diseases, are involved. The present study investigated whether behavioural alterations in this model were related to striatal damage. Wistar and Lewis rats were exposed to 3-nitropropionic acid and their behavioural performance (open field, walking pattern and Morris Water Maze task) was tested after the injections and after a recovery period of 3 weeks. No changes in activity were found in the open field test. Altered walking pa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Progressive multifocal leukoencephalopathy (PML) is a fatal demyelinating disease that results from an oligodendrocyte infection caused by JC virus. The JC virus early promoter directs cell-specific expression of the viral replication factor large T antigen, and thus transcriptional regulation constitutes a major mechanism of glial tropism in PML. We have previously demonstrated that T antigen controls the JC virus basal promoter in a glial cell-specific manner, since T antigen repressed the JC virus and simian virus 40 (SV40) early promoters in glioma cells but induced strong activation of th
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein folding is a complex, multisystem process characterized by heavy molecular and cellular footprints. Chaperone machinery enables proper protein folding and stable conformation. Other pathways concomitant with the protein folding process include transcription, translation, post-translational modifications, degradation through the ubiquitin-proteasome system, and autophagy. As such, the folding process can go awry in several different ways. The pathogenic basis behind most neurodegenerative diseases is that the disruption of protein homeostasis (i.e. proteostasis) at any level will eventu
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA imaging techniques enable researchers to monitor RNA localization, dynamics, and regulation in live or fixed cells. While the MS2-MCP system-comprising the MS2 RNA hairpin and its binding partner, the MS2 coat protein (MCP)-remains the most widely used approach, it relies on a tag containing multiple fluorescent proteins and has several limitations, including the potential to perturb RNA function due to the tag's large mass. Alternative methods using small-molecule binding aptamers have been developed to address these challenges. This protocol describes the synthesis and characterization o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования