Base editing enables precise genome modification without double-strand breaks but remains limited by narrow editing windows, DNA repair pathway biases, and restricted nucleotide diversity. Here, we report MUTATOR, a MUlTiplexAble and self-iTerative ORthogonal base-editing platform that enables N-to-N diversification in Escherichia coli. MUTATOR combines CWBE and ABE with iterative editing on two complementary DNA strands, thereby overcoming endogenous DNA repair constraints and expanding A-to-N and C-to-N editing outcomes across both strands. This strategy substantially expands accessible nucl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precise enhancement of endogenous protein synthesis offers a reversible therapeutic strategy without permanent genomic modification. However, existing Cas13-mediated translational activation systems are limited by modest potency and restricted modular expandability. Here, we developed the Enhanced Targeted Translational Activation System (ETTAS), a modular RNA-guided platform that combines dCas13a, the SINEB2 translational activation element, and an independently recruitable aptamer-mediated auxiliary module. Systematic ortholog screening identified dCas13a as the most effective scaffold for S
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV-1 remains a threat to global health. There is no effective vaccine or drug for a complete cure of HIV infection. Work continues on the development of gene therapy drugs against HIV-1. The use of DNA base editors delivered to the editing site by CRISPR-Cas systems has shown some success in the field of HIV-1 gene therapy. The MmCas12m isoform obtained from Mycolicibacterium mucogenicum can become a promising platform for this task. MmCas12m has a compact size, the ability to bind strongly to the target DNA sequence, and an absence of nuclease activity. Thus, MmCas12m can act not only as a p
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Duchenne Muscular dystrophy (DMD), a yet-incurable X-linked recessive disorder that results in muscle wasting and loss of ambulation is due to mutations in the dystrophin gene. Exonic duplications of dystrophin gene are a common type of mutations found in DMD patients. In this study, we utilized a single guide RNA CRISPR strategy targeting intronic regions to delete the extra duplicated regions in patient myogenic cells carrying duplication of exon 2, exons 2-9, and exons 8-9 in the DMD gene. Immunostaining on CRISPR-corrected derived myotubes demonstrated the rescue of dystrophin protein. Sub
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parasites of the genus Leishmania pose a global health threat with limited treatment options. New drugs are urgently needed, and genomic screens have the potential to accelerate target discovery, mode of action, and resistance mechanisms against these new drugs. We describe here our effort in developing a genome-wide CRISPR-Cas9 screen in Leishmania, an organism lacking a functional nonhomologous end joining system that must rely on microhomology-mediated end joining, single-strand annealing, or homologous recombination for repairing Cas9-induced double-stranded DNA breaks. A new vector for cl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lesch-Nyhan syndrome (LNS) is a congenital defect disease that results in defective purine metabolism. It is caused by pathogenic variants of the HPRT gene. Its clinical symptoms mainly include high uric acid levels, gout, and kidney stones and damage. The mechanism of LNS has not been fully elucidated, and no cure exists. Animal models have always played an important role in exploring causative mechanisms and new therapies. This study combined CRISPR/Cas9 and microinjection to knock out the HPRT gene to create an LNS rabbit model. A sgRNA targeting exon 3 of HPRT gene was designed. Subsequent
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial plasmids are extensively involved in the rapid global spread of antibiotic resistance. We here present an assay, based on optical DNA mapping of single plasmids in nanofluidic channels, which provides detailed information about the plasmids present in a bacterial isolate. In a single experiment, we obtain the number of different plasmids in the sample, the size of each plasmid, an optical barcode that can be used to identify and trace the plasmid of interest and information about which plasmid that carries a specific resistance gene. Gene identification is done using CRISPR/Cas9 load
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CRISPR RNA-guided Cas9 nuclease gene-targeting system has been extensively used to edit the genome of several organisms. However, most mutations reported to date have been are indels, resulting in multiple mutations and numerous alleles in targeted genes. In the present study, a large deletion of 105 kb in the TYR (tyrosinase) gene was generated in rabbit via a dual sgRNA-directed CRISPR/Cas9 system. The typical symptoms of albinism accompanied significantly decreased expression of TYR in the TYR knockout rabbits. Furthermore, the same genotype and albinism phenotype were found in the F1 g
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Programmable and modular systems capable of orthogonal genomic and transcriptomic perturbations are crucial for biological research and treating human genetic diseases. Here, we present the minimal versatile genetic perturbation technology (mvGPT), a flexible toolkit designed for simultaneous and orthogonal gene editing, activation, and repression in human cells. The mvGPT combines an engineered compact prime editor (PE), a fusion activator MS2-p65-HSF1 (MPH), and a drive-and-process multiplex array that produces RNAs tailored to different types of genetic perturbation. mvGPT can precisely edi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The broad application of clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)/Cas9 genome editing tools is hindered by challenges in the efficient delivery of its two components into specific cells and intracytoplasmic release. Herein, a novel copolymer for delivery of Cas9-mRNA/ single-guide RNA (Cas9-mRNA/sgRNA) in vitro and vivo, using carboxylesterase-responsive cationic triadic copolymeric nanoparticles targeted proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (PCSK9) for hyperlipidemia amelioration is reported. A dimethyl biguanide derivative is designed and synthesized to form
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the GJB2 gene, which encodes Connexin 26 (Cx26), are responsible for the majority of cases of non-syndromic congenital hearing loss in humans. While murine GJB2 knockout models have provided mechanistic insight, anatomical and physiological differences limit their translational relevance. Pigs represent a valuable large-animal model because their auditory anatomy and maturation closely resemble those of humans. This study compared two genome-editing approaches to disrupt GJB2 in porcine oocytes before fertilization: (1) electroporation with CRISPR/Cas9 ribonucleoprotein and (2) mi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The movement of the Drosophila yolk protein (DmYP) across the mosquito oocyte membrane was both fortuitous and puzzling; the cells that become future offspring--oocytes--are closed off to molecules that are not specifically recognized by a receptor, but there is no obvious ortholog of the yolk protein/receptor for DmYP in mosquitoes. Nonetheless, a small fragment of DmYP was sufficient to move the massive ribonucleoprotein complex of Cas9 and a guide RNA from the open circulatory system of a female mosquito into the mosquito oocyte for targeting of the germline DNA and heritable mutation. This
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR activation is a powerful tool to upregulate a vast array of genes in many different contexts. However, there are few dynamic CRISPR transcriptional programs, which limit its usage in the creation of living biosensors, self-regulating microbial factories, or conditional therapeutics. Here, we address this limitation by embedding a molecular switch directly into a guide RNA to create a combined sensor-actuator called a metabolite-responsive scaffold RNA (MR-scRNA). We demonstrate the regulatory potential for MR-scRNAs by conditionally activating genes in three different kingdoms of life.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advances in clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR) technologies have led to the use of diverse CRISPR-associated (Cas) proteins in diagnostic applications. Herein, we present a CRISPR/Cas12a2-based amplification-free RNA detection method that exhibits sub-attomolar sensitivity and substrate versatility. Cas12a2, a recently characterized RNA-guided nuclease, uniquely integrates bimolecular recognition through CRISPR RNA (crRNA)-target complementarity and protospacer flanking sequence identification, enabling highly specific trans-cleavage of single-stranded DNA, doubl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-Cas systems are revolutionizing precision genome editing and gene expression control in crop plants. While effective CRISPR-Cas applications traditionally rely on labor-intensive stable genetic transformation to deliver Cas nucleases and guide RNAs into plant cells, plant viruses have emerged as a faster and efficient alternative, a strategy known as virus-induced gene editing (VIGE). Cas12a, Class 2 Type V CRISPR nucleases, are an alternative to broadly used Cas9 for plant genome engineering. Both kind of nucleases offer precis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats-CRISPR-associated proteins) has undergone marked advancements since its discovery as an adaptive immune system in bacteria and archaea, emerged as a potent gene-editing tool after the successful engineering of its synthetic guide RNA (sgRNA) toward the targeting of specific DNA sequences with high accuracy. Besides its DNA editing ability, further-developed Cas variants can also edit the epigenome, rendering the CRISPR-Cas system a versatile tool for genome and epigenome manipulation and a pioneering force in precision medic
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sequence-specific DNA endonucleases have made significant contributions to biology, biotechnology, and medicine; restriction enzymes and homing endonucleases are among classic examples. The demonstration of programmable genome editing using Cas9 in the CRISPR-Cas system, in which the target DNA sequence is recognized by base pairing with a guide RNA, revolutionized the field of genome engineering, making target selection more flexible and convenient. The OMEGA (Obligate Mobile Element-Guided Activity) system, considered a precursor to Cas12, and likely to Cas9, in the CRISPR-Cas system, is an
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Females of the Mediterranean fruit fly Ceratitis capitata (Medfly) are major agricultural pests, as they lay eggs into the fruit crops of hundreds of plant species. In Medfly, female sex determination is based on the activation of Cctransformer (Cctra). A maternal contribution of Cctra is required to activate Cctra itself in the XX embryos and to start and epigenetically maintain a Cctra positive feedback loop, by female-specific alternative splicing, leading to female development. In XY embryos, the male determining Maleness-on-the-Y gene (MoY) blocks this activation and Cctra pro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas systems in prokaryotes serve as adaptive immune systems that neutralize phage infections through RNA-guided nucleases. Immunization is achieved during the adaptation stage through Cas1-Cas2 integrase-mediated insertion of short foreign DNA snippets, termed spacers, into a CRISPR array in the host genome. This review examines the evolutionary origins of Cas1-Cas2 and the mechanisms of spacer acquisition in DNA-targeting CRISPR-Cas systems. Particular emphasis is placed on the recently characterized effector-assisted adaptation pathways, in which CRISPR effector proteins, such as Casc
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Efficient and site-specific alteration of the genome is key to decoding and altering the genomic information of an organism. Over the last couple of years, the RNA-guided Cas9 nucleases derived from the prokaryotic type 2 CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) systems have drastically improved our ability to engineer the genomes of a variety of organisms including Toxoplasma gondii. In this chapter, we describe detailed protocols for using the CRISPR/Cas9 system adapted from Streptococcus pyogenes to perform efficient genetic manipulations in T. gondii such as gene
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования