Repetitive extragenic palindromic (REPs) sequences were first described in enterobacteriacea and later in Pseudomonas putida. We have detected a new variant (51 base pairs) of REP sequences that appears to be disseminated in more than 300 copies in the Pseudomonas syringae DC3000 genome. The finding of REP sequences in P. syringae confirms the broad presence of this type of repetitive sequence in bacteria. We analyzed the distribution of REP sequences and the structure of the clusters, and we show that palindromy is conserved. REP sequences appear to be allocated to the extragenic space, with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aimed to investigate the identification of blaCARBA-positive multidrug-resistant Mixta calida isolates from human hosts and to elucidate their genomic determinants in a species-wide context.
METHODS: Two carbapenemase-producing M. calida isolates were received by the Galway Reference Laboratory Service in Ireland between June and July 2024. One isolate originated from a sputum sample, while the other was recovered from a routine screening rectal swab. Initial identification was performed using MALDI-ToF mass spectrometry, with genomic confirmation via 16S rRNA sequencing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this work, we characterized a novel chromosome-encoded AmpC β-lactamase gene, bla PRC-1, in an isolate of a newly classified Pseudomonas species designated Pseudomonas wenzhouensis A20, which was isolated from sewage discharged from an animal farm in Wenzhou, China. Susceptibility testing, molecular cloning, and enzyme kinetic parameter analysis were performed to determine the function and enzymatic properties of the β-lactamase. Sequencing and comparative genomic analysis were conducted to clarify the phylogenetic relationship and genetic context of the bla PRC-1 gene. PRC-1 is a 379-amino
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The plastid genome of Trifolium subterraneum is 144,763 bp, about 20 kb longer than those of closely related legumes, which also lost one copy of the large inverted repeat (IR). The genome has undergone extensive genomic reconfiguration, including the loss of six genes (accD, infA, rpl22, rps16, rps18, and ycf1) and two introns (clpP and rps12) and numerous gene order changes, attributable to 14-18 inversions. All endpoints of rearranged gene clusters are flanked by repeated sequences, tRNAs, or pseudogenes. One unusual feature of the Trifolium subterraneum genome is the large number of disper
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Borrelia hermsii is the primary cause of tick-borne relapsing fever in North America. When its tick vector, Ornithodoros hermsi, acquires these spirochetes from the blood of an infected mammal, the bacteria switch their outer surface from one of many bloodstream variable major proteins (Vmps) to a unique protein, Vtp (Vsp33). Vtp may be critical for successful tick transmission of B. hermsii; however, the gene encoding this protein has been described previously in only one isolate. Here we identified and sequenced the vtp gene in 31 isolates of B. hermsii collected over 40 years from localitie
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The release of pathogens and DNA from the cryosphere (glacier, permafrost, and, sea ice) has become a new threat to society and environment. Due to enhanced glacier retreat, the size of glacier forefields has greatly expanded. Herein, we used a combination of metagenomic and metatranscriptomic methods and adopted a sequence-based approach to investigate the distribution and changing patterns of virulence factor genes (VFGs) and antibiotic resistance genes (ARGs) in two glacier forefields. The forefields are separated by approximately 400 km located in the center and north of the Tibetan Platea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotics are the most efficient type of therapy developed in the twentieth century. From the early 1960s to the present, the rate of discovery of new and therapeutically useful classes of antibiotics has significantly decreased. As a result of antibiotic use, novel strains emerge that limit the efficiency of therapies in patients, resulting in serious consequences such as morbidity or mortality, as well as clinical difficulties. Antibiotic resistance has created major concern and has a greater impact on global health. Horizontal and vertical gene transfers are two mechanisms involved in the
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The overprescribing and misuse of antibiotics have led to the rapid development of multidrug-resistant bacteria, such as those that cause UTIs. UTIs are the most common outpatient infections and are mainly caused by Escherichia coli and Klebsiella spp., although some Gram-positive bacteria, such as Pseudomonas aeruginosa, have been isolated in many cases. The rise of antimicrobial-resistant bacteria is a major public health concern, as it is predicted to lead to increased healthcare costs and poor patient outcomes and is expected to be the leading cause of global mortality by 2050. Antibiotic
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmid mediated quinolone resistance (PMQR) is a public health challenge arising among other things, from indiscriminate use of the floroquinolones (FQr) prophylactically in animal husbandry. This study examines the occurrence of PMQR genes amongst enteric bacteria isolated from human and animal sources. A total of 720 (360 stool and 360 fish pond water/poultry litter) samples were examined for fluoroquinolone resistant (FQr) bacteria. Percentage FQr was generally higher among human isolates than isolates from animals. Proportion of PMQR amongst FQr isolates were (1.05 and 4.32) % for E. coli
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates the effect of psychrophilic, mesophilic and thermophilic temperatures on the anaerobic treatment of slaughterhouse wastewater, in terms of biogas production, occurrence of 30 pharmaceutical compounds of veterinary use, 4 antibiotic resistance genes (ARGs) which provide resistance to tetracyclines (tetW), fluoroquinolones (qnrS), macrolide-lincosamide-streptogramin (ermB) and sulfonamides (sul1) antibiotics, as well as class I integron-integrase gene (intI1), related to horizontal gene transfer. The highest methane yield was obtained at a mesophilic temperature (35 °C) (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing bacteria are a global health threat both in hospital and in community settings. The emergence of these organisms poses major difficulty in treating infections. This study was carried out to assess major ESBL-producing uropathogens in female patients of Sikkim and Darjeeling by phenotypic and genotypic methods. Out of 1,516 urine samples, 454 uropathogens were isolated with a prevalence rate of 29.94%. Among them, Escherichia coli (74.3%) was the predominant type followed by Klebsiella pneumoniae (20.1%), Pseudomonas aeruginosa (2.4%), and Proteus
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningitidis is a leading cause of infectious childhood mortality worldwide. Most research efforts have hitherto focused on disease isolates belonging to only a few hypervirulent clonal lineages. However, up to 10% of the healthy human population is temporarily colonized by genetically diverse strains mostly with little or no pathogenic potential. Currently, little is known about the biology of carriage strains and their evolutionary relationship with disease isolates. The expression of a polysaccharide capsule is the only trait that has been convincingly linked to the pathogenic pot
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pneumococci with decreased susceptibility or resistant to penicillin (PRP) have been isolated with an increasing frequency in France. Among PRP, isolates of serotypes 23F and 9V were the most frequently recovered in our children's hospital. Penicillin-resistance is due to the appearance of altered penicillin binding proteins (PBPs) with reduced affinity for beta-lactam antibiotics. 3 PBPs have been well studied, 2b, 2x and 1a, and the sequences of their genes have been determined. Our molecular epidemiological study of 14 PRP 9V and 26 PRP 23F isolated mainly from otitis in 1993-94, consisted
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phenomenon of antimicrobial resistance (AMR) in cold environments, exemplified by the Antarctic, calls into question the assumption that pristine ecosystems lack clinically significant resistance genes. This study examines the molecular basis of AMR in Acinetobacter spp. Isolated from Antarctic soil, focusing on the blaTEM and blaSHV genes associated with extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) production; Soil samples were collected and processed to isolate Antarctic soil bacteria. Molecular detection was then conducted using polymerase chain reaction (PCR) to identify the bacteria specie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The emergence of macrolide and tetracycline resistance within Pasteurella multocida isolated from feedlot cattle and the dominance of ST394 in Australia was reported recently.
OBJECTIVES: To establish the genetic context of the resistance genes in P. multocida 17BRD-035, the ST394 reference genome, and conduct a molecular risk assessment of their ability to disperse laterally.
METHODS: A bioinformatic analysis of the P. multocida 17BRD-035 genome was conducted to determine if integrative conjugative elements (ICEs) carrying resistance genes, which hamper antibiotic treatment opti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the current study, ceftazidime- and ciprofloxacin-resistant—or dual drug-resistant (DDR)—E. coli were isolated from river Mula-Mutha, which flows through rural Pune district and Pune city. The DDR E. coli were further examined for antibiotic resistance to six additional antibiotics. The study also included detection of genes responsible for ceftazidime and ciprofloxacin resistance and vectors for horizontal gene transfer. Twenty-eight percent of the identified DDR E. coli were resistant to more than six antibiotics, with 12% being resistant to all eight antibiotics tested. Quino
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus constellatus is an opportunistic pathogen frequently associated with abscess formation in various body sites. While the species has been shown to acquire exogenous DNA through natural transformation, functional analyses of its underlying mechanisms and optimized genetic editing protocols remain limited. Thus, our aim was to characterize the natural transformation system in S. constellatus and investigate environmental factors coordinating its activation. In addition, we sought to develop an optimized protocol for genome editing. Genomic analysis revealed that 73% of analyzed stra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acinetobacter baumannii is a critical WHO priority pathogen due to its multidrug resistance and high mortality in carbapenem-resistant infections. Resistance is predominantly mediated by class D carbapenemase genes blaOXA-23 and blaOXA-40, which spread rapidly via horizontal gene transfer in healthcare settings. To address the lack of a rapid assay capable of detecting both blaOXA-23 and blaOXA-40 in a single analytical workflow, we developed a multiplex two-step RPA-CRISPR/Cas12a assay. Since infections caused by strains harboring either gene require identical therapeutic management, their co
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The growing prevalence of metallo-β-lactamase (MBL)-producing Pseudomonas aeruginosa in nosocomial pathogen populations has been attributed to their clonal spread, and/or horizontal transfer of MBL determinants in mobile genetic elements, including integrons. To characterize the genetic background of the beta-lactamase VIM-2 encoding gene in the population of carbapenemresistant (Carba-R) P. aeruginosa clinical isolates.The detection of class 1 integrons was performed by PCR. Typing of the class 1 integrons containing the blaVIM gene cassette was performed by the PCR-restriction fragment lengt
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prevalence and antimicrobial susceptibilities of Staphylococci and Streptococci were assessed from subclinical mastitis cases. One hundred Coagulase-Negative Staphylococci (CNS) and 34 Streptococci were identified. The most frequently isolated species were Staphylococcus haemolyticus (27%) and Staphylococcus simulans (24%). Susceptible CNS species revealed the highest resistance to penicillin G (58%), ampicillin (48%), neomycin (20%), and oleandomycin (14%). CNS methicillin resistance rates within 82 isolates were 21.95% and 1.22% by disk diffusion and PCR methods, respectively. These resu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.