Salmonella 4,[5],12:i:- (S. 4,[5],12:i:-) has emerged as an important foodborne pathogen, and the continued expansion of its dominant ST34 l … around 2017. MGE copy number was significantly positively correlated with ARG burden and accessory-genome size (P < 0.001). ST34 harbored substantially more temporally increasing MGE-associated gene clusters than ST19, among which the highly prevalent and continuously increasing ISEc42 was located within a Gifsy-1-associated prophage region. Pangenome analys …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolution of viviparity increases the potential for genomic conflicts between mothers and offspring over the level of maternal investment. The viviparity-driven-conflict hypothesis predicts that such conflicts will drive the evolution of asymmetrical reproductive isolation between populations with divergent mating systems. We tested this hypothesis using crosses between populations of a poeciliid fish that differ in their level of polyandry. Our results support the prediction of an asymmetry in the rate of spontaneous abortion in reciprocal crosses, with the highest rate occurring in cross
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The missing heritability of complex traits remains a key challenge in human genetics. Recent studies have highlighted the potential role of rare variants in addressing this gap. However, their contribution has been difficult to quantify due to small sample sizes and large standard errors in large-scale whole-genome sequencing data.
RESULTS: Leveraging whole-genome sequencing data from 348,977 unrelated White British participants in the UK Biobank, we analyze 5,378,300 linkage disequilibrium-independent rare variants to estimate their heritability for five complex traits. This data
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: X-linked genetic diseases affect males and females through different inheritance patterns influenced by sex, where differential methylation caused by X-chromosome inactivation can present with a range of asymptomatic, mild, and severe symptoms in females. Targeted long-read sequencing (LRS) through adaptive sampling (AS) shows robust performance in characterizing genomic composition and methylation status within the X chromosome, but it is not optimal for nonhigh-molecular-weight (non-HMW) DNA. Herein, we optimized a targeted LRS for non-HMW DNA and validated its diagnostic utility
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Relict trees are key to understanding macroevolution, biogeography, and extinction risk under environmental change, yet genome-wide data on diversity and demography remain scarce. Perkinsiodendron macgregorii, a monotypic East Asian relict within Styracaceae, is of notable horticultural and conservation significance. Here, we assembled a chromosome-level genome (∼1.15 Gb) and resequenced 167 individuals from 30 populations across its range. We performed a comparative analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) and structural variants (SVs) to assess population structure, mutation load,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kidney transplantation outcomes arise from complex interactions among donor organ quality, recipient susceptibility, and immunologic compatibility, yet conventional clinical risk models explain only a modest fraction of outcome variability. Polygenic risk scores (PRS) offer a promising framework to enhance transplant risk assessment by integrating genome-wide genetic information from both donor and recipient into biologically informed models. This narrative review examines the mechanistic basis for PRS application in kidney transplantation and variant clustering approaches that link polygenic
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Develop a preoperative risk classifier for guiding the extent of surgery in differentiated thyroid carcinomas (DTCs) under 4 cm.
STUDY DESIGN: In silico study, validation with retrospective cohort.
SETTING: Genomic data repositories, academic tertiary medical center.
METHODS: Prognostic transcriptional groups and American Thyroid Association (ATA) risk groups in The Cancer Genome Atlas (TCGA) were used to create novel Clinico-TRanscriptomic (CTR) groups. Differential gene expression (DGE) was performed. Consensus clustering was used to assess the reproducibility of genomic and hi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bussuquara virus (BSQV), an orthoflavivirus discovered in Brazil in 1956, has been detected throughout the Americas in diverse mosquito and vertebrate species, including humans. Critical gaps in BSQV knowledge include its capacity for urban transmission and clinical pathogenesis outcomes, with insufficient historical experimentation to draw genomic or phenotypic comparisons to related orthoflavivirus species. The objective of this study was to conduct morphologic, genomic, phylogenetic, and in vitro viral fitness characterization of BSQV using the four available historical strains. We used nex
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Less than half of the individuals with hereditary cerebellar ataxia receives a genetic diagnosis. Repeat expansions account for disproportionate number of hereditary cerebellar ataxia and have genetically heterogeneous causes. These genetic loci include ATXN1, ATXN2, ATXN3, CACNA1A, ATXN7, ATXN8OS, ATXN10, PPP2R2B, TBP, ATN1, FMR1, BEAN1, NOP56, GLS, THAP11, GAA-FGF14, ZFHX3, FXN and RFC1. This study aims to assess the yield of short-read whole genome sequencing in the molecular diagnosis of hereditary cerebellar ataxia. We recruited 380 patients (351 probands) from a national ataxia centre in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to isolate and characterize biological and genomic features of a phage infecting Enterococcus faecalis. The phage was isolated from environmental water and temperature and pH stability, one-step growth curve, and multiplicity of infection (MOI) were determined. Whole genome sequencing (WGS) and structural and functional annotations were performed. Its antibiofilm activity was also evaluated. The optimal MOI was 0.01, the latency period was 5 min, and the burst size was 202 plaque forming unit (PFU). High phage survival rates were observed at between pH 4-10 and temperatures be
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chryseobacterium arthrosphaerae strain FS91703 was isolated from Rana nigromaculata in our previous study. To investigate the genomic characteristics, pathogenicity-related genes, antimicrobial resistance, and phylogenetic relationship of this strain, PacBio RS II and Illumina HiSeq 2000 platforms were used for the whole genome sequencing. The genome size of strain FS91703 was 5,435,691 bp and GC content was 37.78%. A total of 4,951 coding genes were predicted; 99 potential virulence factors homologs were identified. Analysis of antibiotic resistance genes revealed that strain FS91703 harbored…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Strains of Helicobacter cetorum have been cultured from several marine mammals and have been found to be closely related in 16 S rDNA sequence to the human gastric pathogen H. pylori, but their genomes were not characterized further.
METHODS: The genomes of H. cetorum strains from a dolphin and a whale were sequenced completely using 454 technology and PCR and capillary sequencing.
RESULTS: These genomes are 1.8 and 1.95 mb in size, some 7-26% larger than H. pylori genomes, and differ markedly from one another in gene content, and sequences and arrangements of shar
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ascaris lumbricoides and Ascaris suum are parasitic nematodes living in the small intestine of humans and pigs, and can cause the disease ascariasis. For long, there has been controversy as to whether the two ascaridoid taxa represent the same species due to their significant resemblances in morphology. However, the complete mitochondrial (mt) genome data have been lacking for A. lumbricoides in spite of human and animal health significance and socio-economic impact globally of these parasites. In the present study, we sequenced the complete mt genomes of A. lumbricoides and A. suum (China iso
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mammalian gene expression patterns, and their variability across populations of cells, are regulated by factors specific to each gene in concert with its surrounding cellular and genomic environment. Lentiviruses such as HIV integrate their genomes into semi-random genomic locations in the cells they infect, and the resulting viral gene expression provides a natural system to dissect the contributions of genomic environment to transcriptional regulation. Previously, we showed that expression heterogeneity and its modulation by specific host factors at HIV integration sites are key determinants
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Francisella tularensis is the causative agent of tularemia, which is a highly lethal disease from nature and potentially from a biological weapon. This species contains four recognized subspecies including the North American endemic F. tularensis subsp. tularensis (type A), whose genetic diversity is correlated with its geographic distribution including a major population subdivision referred to as A.I and A.II. The biological significance of the A.I - A.II genetic differentiation is unknown, though there are suggestive ecological and epidemiological correlations. In order to understand the di
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Computerized mating programs using genomic information are needed by breed associations, artificial-insemination organizations, and on-farm software providers, but such software is already challenged by the size of the relationship matrix. As of October 2012, over 230,000 Holsteins obtained genomic predictions in North America. Efficient methods of storing, computing, and transferring genomic relationships from a central database to customers via a web query were developed for approximately 165,000 genotyped cows and the subset of 1,518 bulls whose semen was available for purchase at that time
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STUDY QUESTION: Are there any novel genetic markers of susceptibility to polycystic ovary syndrome (PCOS)?
SUMMARY ANSWER: We identified a novel susceptibility locus on chromosome 8q24.2 and several moderately associated loci for PCOS in Korean women.
WHAT IS KNOWN ALREADY: PCOS is a highly complex disorder with significant contributions from both genetic and environmental factors. Previous genome-wide association studies (GWAS) in the Han Chinese population identified several risk loci for PCOS. However, GWAS studies on PCOS remain very few. The aim of this study was to identify novel marke
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exposure of the human food-borne pathogen Listeria monocytogenes to sublethal concentrations of triclosan can cause resistance to several aminoglycosides. Aminoglycoside-resistant isolates exhibit two colony morphologies: normal-size and pinpoint colonies. The purposes of the present study were to characterize the small colonies of L. monocytogenes and to determine if specific genetic changes could explain the triclosan-induced aminoglycoside resistance in both pinpoint and normal-size isolates. Isolates from the pinpoint colonies grew poorly under aerated conditions, but growth was restored b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Strain RP23018ST was isolated from the solar panels in Gebze, Türkiye. According to the phylogenetic analysis of 16S rRNA gene sequences, st … C16:1 ω7c), summed feature 8 (C18:1 ω6c and/or C18:1 ω7c), and C17:0 cyclo. Strain RP23018ST had a genome size of 4,944,510 bp and a G + C ratio of 63.0%. The average nucleotide identity (ANI) and digital DNA–DNA hybridization (dDDH) values between RP23018ᵀ and related Pseudomonas species were below 86.4% and 26.7%, respectively, clearly falling below the th …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A Gram-stain-negative, strictly aerobic, yellow-pigmented, non-motile, rod-shaped rod-shaped bacterium, designated J2K-J805T, was isolated f … e 87.7 and 34.5%, respectively, both below their respective thresholds for species delineation. The genome size and DNA G+C content were 3,825,400 bp and 34.9 mol%, respectively. The predominant respiratory quinone was MK-6, and the major cellular fatty acids were iso-C15:1 G, iso-C15:0 and iso-C17:0 3-OH. The polar lipid profile comprised phosphatidylethanol …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования