Despite the critical role of the human microbiota in health, our understanding of microbiota compositional dynamics during and after pregnancy is incomplete. We conducted a case-control study of 49 pregnant women, 15 of whom delivered preterm. From 40 of these women, we analyzed bacterial taxonomic composition of 3,767 specimens collected prospectively and weekly during gestation and monthly after delivery from the vagina, distal gut, saliva, and tooth/gum. Linear mixed-effects modeling, medoid-based clustering, and Markov chain modeling were used to analyze community temporal trends, communit…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To analyze the cervical microbiota in women with preterm prelabor rupture of membranes (PPROM) by pyrosequencing and to document associations between cervical microbiota, cervical inflammatory response, microbial invasion of the amniotic cavity (MIAC), histological chorioamnionitis, and intraamniotic infection (IAI).
STUDY DESIGN: Sixty-one women with singleton pregnancies complicated by PPROM were included in the study. Specimens of cervical and amniotic fluid were collected on admission. The cervical microbiota was assessed by 16S rRNA gene sequencing by pyrosequencing. Interleuk…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel diseases (IBD) are chronic, relapsing and remitting gastrointestinal (GI) disorders of unknown etiology. IBD patients commonly exhibit extra-intestinal manifestations and complications of an inflammatory nature, presenting with disorders such as ankylosing spondylitis, uveitis and vasculitis. Although the metabolic syndrome is less prevalent in patients with IBD, they are at an increased risk for atherosclerosis and cardiovascular events. Considerable evidence supports the role of GI microbiota in the development of IBD. Recent studies have also shown a significant interacti…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cervicitis is an inflammatory condition of the cervix associated with upper genital tract infection and reproductive complications. Although cervicitis can be caused by several known pathogens, the etiology frequently remains obscure. Here we investigate vaginal bacteria associated with bacterial vaginosis as potential causes of cervicitis.
METHODS: Associations between vaginal bacteria and cervicitis were assessed in a retrospective case-control study of women attending a Seattle sexually transmitted disease clinic. Individual bacterial species were detected using 2 molecular met
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sociodemographic, behavioral and clinical correlates of the vaginal microbiome (VMB) as characterized by molecular methods have not been adequately studied. VMB dominated by bacteria other than lactobacilli may cause inflammation, which may facilitate HIV acquisition and other adverse reproductive health outcomes.
METHODS: We characterized the VMB of women in Kenya, Rwanda, South Africa and Tanzania (KRST) using a 16S rDNA phylogenetic microarray. Cytokines were quantified in cervicovaginal lavages. Potential sociodemographic, behavioral, and clinical correlates were also evaluate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bacteria colonizing an enterocutaneous fistula tract have not been clarified. The aims of this study were to investigate the pathogen spectra of fistulous tracts and their resistance to antibiotics in patients with chronic fistulas.
METHODS: We conducted a one-year prospective single-center study. In the absence of significant sepsis, consecutively stabilized patients with chronic enterocutaneous fistula were included. Microbiology and antimicrobial susceptibility of isolates from the tracts were analyzed. The correlations between the existence of bacteria and various clinical val
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the interaction between the intestinal microbiota (microbiome) and enteric pathogens is of interest in the development of alternative treatments that do not rely on chemotherapy and do not lead to drug resistance. We undertook research in a rodent model of cryptosporidiosis to assess whether the bacterial gut microbiota is impacted by infection with the protozoan pathogen Cryptosporidium parvum. The profile of the faecal bacterial microbiota in infected and uninfected animals was compared using 16S amplicon sequencing. In four independent experiments, the intestinal microbiota of…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolites produced by the intestinal microbiota are potentially important physiological modulators. Here we present a metabolomics strategy that models microbiota metabolism as a reaction network and utilizes pathway analysis to facilitate identification and characterization of microbiota metabolites. Of the 2,409 reactions in the model, ~53% do not occur in the host, and thus represent functions dependent on the microbiota. The largest group of such reactions involves amino-acid metabolism. Focusing on aromatic amino acids, we predict metabolic products that can be derived from these source…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The microbiota of the human metaorganism is not a mere bystander. These microbes have coevolved with us and are pivotal to normal development and homoeostasis. Dysbiosis of the GI microbiota is associated with many disease susceptibilities, including obesity, malignancy, liver disease and GI pathology such as IBD. It is clear that there is direct and indirect crosstalk between this microbial community and host immune response. However, the precise mechanism of this microbial influence in disease pathogenesis remains elusive and is now a major research focus. There is emerging literature on the…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Translocation of bacteria and their products across the intestinal barrier is common in patients with liver disease, and there is evidence t … atocytes were more susceptible to toxin-induced cell death in culture. In conclusion, the commensal microbiota prevents fibrosis upon chronic liver injury in mice. This is the first study describing a beneficial role of the commensal microbiota in maintaining liver homeostasis and preventing liver fibrosis.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study was aimed to assess the diversity of the meconium microbiome and determine if the bacterial community is affected by … t and diversity analysis.
RESULTS: All meconium samples were not sterile and contained diversified microbiota. Compared with adult feces, the meconium showed a lower species diversity, higher sample-to-sample variation, and enrichment of Proteobacteria and reduction of Bacteroidetes. Among the meconium samples, the taxonomy analyses suggested that the overa …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel diseases (IBDs), Crohn's disease (CD), and ulcerative colitis (UC) are chronic inflammatory conditions, which are increasing in incidence, prevalence, and severity, in many countries. While there is genetic susceptibility to IBD, the probability of disease development is modified by diet, lifestyle, and endogenous factors, including the gut microbiota. For example, high intakes of mono- and disaccharides, and total fats consistently increases the risk developing both forms of IBD. High vegetable intake reduces the risk of UC, whereas increased fruit and/or dietary fiber inta…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Animals are chronically infected by benign and beneficial microorganisms that generally promote animal health through their effects on the nutrition, immune function and other physiological systems of the host. Insight into the host-microbial interactions can be obtained by comparing the traits of animals experimentally deprived of their microbiota and untreated animals. Drosophila melanogaster is an experimentally tractable system to study host-microbial interactions.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: The nutritional significance of the microbiota was investigated in D. melanogaste…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Interstitial Cystitis (IC) is a chronic inflammatory condition of the bladder with unknown etiology. The aim of this study was to characterize the microbial community present in the urine from IC female patients by 454 high throughput sequencing of the 16S variable regions V1V2 and V6. The taxonomical composition, richness and diversity of the IC microbiota were determined and compared to the microbial profile of asymptomatic healthy female (HF) urine.
RESULTS: The composition and distribution of bacterial sequences differed between the urine microbiota of IC patients and HFs. Red…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Explorations of the vaginal microbiota (VMB) began over 150 years ago. Using light microscopy and bacterial cultures, the concept of normal versus abnormal microbiota in women began to emerge. The latter became known by the term "bacterial vaginosis" (BV). BV microbiota is dominated by Gardnerella vaginalis and includes a number of anaerobic organisms. In contrast, normal flora is dominated by various Lactobacilli. BV microbiota is associated with vaginal discharge, poor pregnancy outcomes, pelvic inflammatory disease, postoperative wound infections and endometritis after elective abortions. I…
Историческая статьяСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gut flora plays an important role in the pathogenesis of the complications of cirrhosis. Hepatic encephalopathy (HE) represents a broad … of gut barrier function and the influence of gut-derived factors on HE, focusing on the role of gut microbiota in the pathogenesis of HE and the recent literature findings on its therapeutic manipulation.
Редакционная статьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study describes the development of the rabbit caecum microbiota and its metabolic activities from the neonatal (day 2) until the subadult period (day 70). The caecal microbiota was analysed using 16S rRNA gene approaches coupled with capillary electrophoresis single-stranded conformation polymorphism (CE-SSCP) and qPCR. At day 2, rabbits harboured population levels up to 8.4, 7.2 and 7.4 log(10) copy number g(-1) full caecum of the total bacteria, Bacteroides-Prevotella and Firmicutes groups, respectively. These populations reached their maximum levels from day 14 for Firmicutes groups (1…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Complex microbial populations are organized in relation to their environment. In the intestine, the inner lining (mucosa) is a potential focal point for such organization. The proximal murine colon contains mucosal folds that are known to be associated with morphologically distinct microbes. To identify these microbes, we used the technique of laser capture microdissection (LCM) to sample microbes associated with these folds (interfold region) and within the central lumen (digesta region). Using 16S rRNA gene tag pyrosequencing, we found that microbes in the interfold region were highly enrich
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lafun is a fermented cassava food product consumed in parts of West Africa. In the present work the microorganisms (aerobic bacteria (AB), lactic acid bacteria (LAB) and yeasts) associated with the fermentation of Lafun under traditional conditions have for the first time been studied using a combination of pheno- and genotypic methods. During Lafun fermentation the AB count ranged from 6-7 log(10) CFU/g at the beginning to 9 log(10) CFU/g at the end. Similarly, the number of LAB increased from 5 log(10) CFU/g to 9 log(10) CFU/g during the process while the yeast load increased from 3 log(10)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of the present study was to evaluate the effects of local tetracycline on the occurrence of alveolar osteitis in rats, and on the microbiota associated to this infection. Forty Wistar rats were randomly assigned to 4 groups (n=10): I - the rats had the maxillary right incisor extracted and the alveolar wound did not receive any treatment; II - adrenaline and Ringer-PRAS were introduced into the alveolar wound; III - the alveolar wound was irrigated with sterile saline; and IV - the alveolar wound was irrigated with an aqueous solution of tetracycline. Microbial samples from the alveola…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.