IN BRIEF: Zygotic genome activation failure contributes to the low developmental efficiency of porcine somatic cell nuclear transfer (SCNT) embryos. We show that α-ketoglutarate improves transcriptional activation, epigenetic remodeling, and embryo development in SCNT embryos, supporting its potential use for improving nuclear reprogramming efficiency.
ABSTRACT: Abstract: Incomplete zygotic genome activation (ZGA) is a major barrier limiting the developmental competence of somatic cell nuclear transfer (SCNT) embryos in pigs. α-Ketoglutarate (α-KG), a key metabolic intermediate and cofactor f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) commonly cause gastric ulcers (GUs). We investigated the effects of sulforaphane (SF) and thymoquinone (TQ) in rats with acetylsalicylic acid (ASA)-induced GUs.
MATERIALS AND METHODS: Thirty-five male Wistar-Albino rats were divided into five groups: control; ASA; ASA with vehicle; ASA + SF; and ASA + TQ. Compounds were administered by oral gavage before GU induction. GUs were induced by intragastric administration of ASA. Four hours after GU induction, rats were killed and stomachs excised. Total oxidant status, total antioxidant stat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytoplasmic transactive response DNA-binding protein 43 (TDP43) mislocalization and aggregation are pathological hallmarks of amyotrophic lateral sclerosis (ALS). However, the initial cellular insults that lead to TDP43 mislocalization remain unclear. In this study, we demonstrate that nemo-like kinase (NLK) - a proline-directed serine-threonine kinase - promotes the mislocalization of TDP43 and other RNA-binding proteins by disrupting nuclear import. NLK levels were selectively elevated in neurons exhibiting TDP43 mislocalization in tissues from patients with ALS, and genetic reduction of NLK
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-nucleus RNA sequencing enables high-resolution transcriptomic profiling of brain tissue, facilitating analysis of cell identity in models of neurodegeneration and repair. Here, we present a protocol for isolating nuclei from long-term human stem cell-derived grafts in the rat brain. We describe steps for vibratome sectioning, graft dissection, nuclear extraction, and fluorescence-activated sorting. This workflow supports analysis of human neurons embedded within host tissue or sensitive to dissociation, enabling assessment of graft composition, integration, and neuronal identity in the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interferon-stimulated genes (ISGs) comprise a program of immune effectors important for host immune defense. When uncontrolled, ISGs play a central role in interferonopathies and other inflammatory diseases. The mechanisms responsible for turning on ISGs are not completely known. By investigating MATRIN3 (MATR3), a nuclear RNA-binding protein mutated in familial ALS, we found that perturbing MATR3 results in elevated expression of ISGs. Using an integrative approach, we elucidate a pathway that leads to activation of cGAS-STING. This outlines a plausible mechanism for pathogenesis in a subset
ПрепринтСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a rare variant of generalized granuloma annulare (GGA) in a 62-year-old male patient. The patient presented with large, annular, violaceous patches on the upper arms and thighs. Histological findings were consistent with interstitial granuloma annulare. In addition, high titers of Epstein-Barr Viral Capsid Antigen (EBV VCA) and EBV Nuclear Antigen (EBVNA) antibodies were found. In-situ hybridization did not reveal EBV RNA in the skin lesions. Immune dysregulation in the setting of chronic EBV infection has been suggested as a contributing factor to the development of this rare varian
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 56-year-old Japanese man was admitted to our hospital due to a fever of unknown origin. He had had a history of extranodal natural killer (NK)/T-cell lymphoma, nasal type, and had been in complete remission for 7 years until June 2003, when he developed high fever, eyelid swelling, and muscular weakness. Serum creatine kinase levels were elevated. Histopathological examination of skin and muscle biopsy specimens revealed subcutaneous infiltration of lymphoid cells positive for CD3, CD56, and Epstein-Barr virus-encoded small nuclear RNA-1. We report this unique case of Epstein-Barr virus-asso
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although many RNA-protein complexes or ribonucleoproteins (RNPs) assemble spontaneously in vitro, little is known about how they form in the environment of a living cell. Insight into RNP assembly has come unexpectedly from functional analyses of the survival motor neuron (SMN) protein, a gene product that is affected in the neuromuscular disease spinal muscular atrophy. These studies show that the assembly of spliceosomal U-rich small nuclear RNPs in vivo depends on the activity of two large protein complexes, one of which contains the SMN protein. These complexes might also facilitate the as
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have identified a serine/threonine kinase that is rapidly activated during Fas-mediated apoptosis. Fas-activated serine/threonine kinase (FAST) is phosphorylated on serine and threonine residues in Jurkat cells. In response to Fas ligation, it is rapidly dephosphorylated and concomitantly activated to phosphorylate TIA-1, a nuclear RNA-binding protein that has been implicated as an effector of apoptosis. Phosphorylation of TIA-1 precedes the onset of DNA fragmentation, suggesting a role in signaling downstream events in the apoptotic program. Our results introduce Fast and TIA-1 as componen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TLS (also known as FUS) is an RNA-binding protein that contributes the N-terminal half of fusion oncoproteins implicated in the development of human liposarcomas and leukemias. Here we report that male mice homozygous for an induced mutation in TLS are sterile with a marked increase in the number of unpaired and mispaired chromosomal axes in pre-meiotic spermatocytes. Nuclear extracts from TLS(-/-) testes lack an activity capable of promoting pairing between homologous DNA sequences in vitro, and TLS(-/-) mice and embryonic fibroblasts exhibit increased sensitivity to ionizing irradiation. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: MALAT1 has been confirmed to play a vital role in the progression of preeclampsia (PE). However, as one of the spliceosomes of MALAT1, the role and mechanism of MALAT1-201 in the progression of PE remain elusive. Mesenchymal stem cells (MSCs) correlate with angiogenesis and trophoblast formation and could maintain successful pregnancy, while the molecular mechanisms are still unclear. The aim of the study was to investigate the role and potential mechanism of MALAT1-201 in PE.
METHODS: We isolated MSCs from bone marrow and cultured in vitro. We overexpressed MALAT1-201 in MSCs and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arsenic (As) is a natural hepatotoxicity inducer that is ubiquitous in water, soil, coal, and food. Studies have found that arsenite exposure elicits increased mRNA transcription and decreased protein expression of SOD1 in vivo and in vitro; however, the specific mechanisms remain unclear. Here, we established a model of arsenic-induced chronic liver injury by providing rats with drinking water containing different concentrations of sodium arsenite (NaAsO2) and found that NaAsO2 exposure decreased the mRNA and protein levels of AUF1 and the protein level of SOD1 and elevated the mRNA and prote
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The only member of the Epstein-Barr virus family of nuclear proteins (EBNAs) expressed during type I and type II latent infections is EBNA-1. This is in contrast to type III latency, during which all six nuclear proteins are expressed from a common transcription unit. The exclusive expression of EBNA-1 during type I and II latency is mediated through a recently identified promoter, Fp. The objective of this study was to characterize Fp in the Burkitt lymphoma cell background, where it is known to be differentially utilized. Using a short-term transfection assay and reporter gene plasmids conta
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Splicing is catalyzed by the spliceosome, a compositionally dynamic complex assembled stepwise on pre-mRNA. We reveal links between splicing machinery components and the intrinsically disordered ciliopathy protein SANS. Pathogenic mutations in SANS/USH1G lead to Usher syndrome-the most common cause of deaf-blindness. Previously, SANS was shown to function only in the cytosol and primary cilia. Here, we have uncovered molecular links between SANS and pre-mRNA splicing catalyzed by the spliceosome in the nucleus. We show that SANS is found in Cajal bodies and nuclear speckles, where it interacts
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circular RNAs (circRNAs) are a class of non-coding RNAs generated through back splicing. High expression of circRNAs is often associated with numerous abnormal cellular biological processes. However, the regulatory factors of circRNAs are not fully understood.
RESULTS: In this study, we identified PTBP1 as a crucial regulator of circRNA biogenesis through a comprehensive analysis of the whole transcriptome profiles across 10 diverse cell lines. Knockdown of PTBP1 led to a significant decrease in circRNA expression, concomitant with a distinct reduction in cell proliferation. To in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nuclear hormone receptors play crucial roles in embryonic development, neural regulation, metabolism, and organogenesis in insects. This study aimed to investigate the expression and function of the nuclear hormone receptor 3 (HR3) in the 28-spotted ladybeetle, Henosepilachna vigintioctopunctata.
RESULTS: Our findings revealed that HvHR3 was expressed at all developmental stages, with the highest expression levels in the 1st instar larvae, 3rd instar larvae, and pupa. HvHR3 silencing in both the 1st and 3rd instar larvae resulted in high mortality rates. Reduced HvHR3 expression i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Treacher Collins syndrome (TCS) is a craniofacial genetic disorder caused by loss-of-function variants in TCOF1, POLR1B, POLR1C, or POLR1D. Here, we describe two previously undiagnosed paternal half-siblings affected with clinical TCS, and their apparently unaffected father. Diagnostic short-read RNA sequencing) identified aberrant expression of TCOF1 and optical genome mapping detected a large genomic insertion therein. Long-read genome sequencing (lrGS) resolved a deep intronic 3.5 kb SINE-VNTR-Alu (SVA) retrotransposon insertion in intron 17 of TCOF1. Long-read RNA sequencing (lrRNA-seq) de
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The liver is a major organ that performs essential metabolic functions. Developing an efficient and safe method to knock down gene expression in the liver provides an important tool for determining gene function in liver pathophysiology. In this study, we describe a method for intrasplenic injection of adeno-associated virus serotype 8 (AAV8) engineered to express a small hairpin RNA (shRNA) against a target gene of interest, nucleostemin (NS). Intrasplenic injection of AAV8 expressing an NS-targeting shRNA (AAV8-shNS1) achieved the same knockdown efficiency of NS in the liver as did portal ve
СтатьяVideo-Audio MediaПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The malignant Hodgkin and Reed Sternberg (HRS) cells of classical Hodgkin lymphoma (cHL) are scarce in affected lymph nodes, creating a challenge to detect driver somatic mutations. As an alternative to cell purification techniques, we hypothesized that ultra-deep exome sequencing would allow genomic study of HRS cells, thereby streamlining analysis and avoiding technical pitfalls. To test this, 31 cHL tumor/normal pairs were exome sequenced to approximately 1,000× median depth of coverage. An orthogonal error-corrected sequencing approach verified >95% of the discovered mutations.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The highly conserved family of cyclophilins comprises multifunctional chaperones that interact with proteins and RNAs, facilitating the dynamic assembly of multimolecular complexes involved in various cellular processes. Cyclophilin A (CypA), the predominant member of this family, exhibits peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity. This enzymatic function aids with the folding and activation of protein structures and often serves as a molecular regulatory switch for large multimolecular complexes, ensuring appropriate inter- and intra-molecular interactions. Here, we investigated the involv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования