Bacterial modular type I polyketide synthases (PKSs) represent giant megasynthases that produce a vast number of complex polyketides, many of which are pharmaceutically relevant. This review highlights recent advances in elucidating the mechanism of bacterial type I PKSs and associated enzymes, and outlines the ramifications of this knowledge for synthetic biology approaches to expand structural diversity. New insights into biosynthetic codes and structures of thiotemplate systems pave the way to rational bioengineering strategies. Through advances in genome mining, DNA recombination technolog
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The history of 'The Bethesda System' for reporting cervical cytology goes back almost 3 decades. This terminology and the process that created it have had a profound impact on the practice of cervical cytology for laboratorians and clinicians alike. The Bethesda conferences and their ensuing output have also set the stage for standardization of terminology across multiple organ systems, including both cytology and histology, have initiated significant research in the biology and cost-effective management for human papillomavirus-associated anogenital lesions, and, finally, have fostered worldw
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We implemented a Systems Biology approach using Correlation Difference Probability Network (CDPN) analysis to provide insights into the statistically significant functional differences between HIV-infected patients and uninfected individuals. The analysis correlates bacterial microbiome ("bacteriome"), fungal microbiome ("mycobiome"), and metabolome data to model the underlying biological processes comprising the Human Oral Metabiome. CDPN highlights the taxa-metabolite-taxa differences between the cohorts that frequently capture quorum-sensing modifications that reflect communication disrupti…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The characterization of the interacting behaviors of complex biological systems is a primary objective in protein-protein network analysis and computational biology. In this paper we present FunMod, an innovative Cytoscape version 2.8 plugin that is able to mine undirected protein-protein networks and to infer sub-networks of interacting proteins intimately correlated with relevant biological pathways. This plugin may enable the discovery of new pathways involved in diseases. In order to describe the role of each protein within the relevant biological pathways, FunMod computes and scores three
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The specific objective of this article was to update the reader on biologic modifiers being used or suggested for use in therapies directed at regenerating periodontal tissues. As indicated from the studies presented here, many of these biologic modifiers have significant influences on cell behavior and show great promise for use in regenerative therapies. As discussed here, however, additional investigations are required both at the molecular level and at the clinical level to improve the predictability of regenerative therapies. With active investigations directed toward understanding the bi
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CSF-1 (colony stimulating factor-1), initially considered to be a monocyte specific growth and differentiation factor [4], has recently been shown to be produced in human endometrium [16], placenta [7], as well as in numerous solid tumors [19-23, 26, 27]. The CSF-1 receptor (a protein product of c-fms) [24] is a member of the tyrosine kinase receptor family and an autocrine or paracrine mechanism of activation has been suggested. Overactivation of this receptor can lead to a malignant phenotype in various cell systems [20, 21]. We review the biology of CSF-1 and fms expression in normal as wel
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Central nervous system (CNS) diseases such as glioblastoma (GBM), multiple sclerosis (MS), and Alzheimer's disease (AD) remain challenging due to their complexity and limited treatments. Conventional drug repurposing strategies often rely on bulk RNA sequencing data, which can overlook cellular heterogeneity and mask rare but critical cell populations. Here, we introduce scDrugLink, a computational method that integrates single-cell transcriptomic data with drug targets and perturbation signatures to improve repurposing. For each cell type, scDrugLink constructs a Drug2Cell matrix based on dru
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a complex neurodegenerative disorder with a growing body of evidence suggesting the involvement of immune responses. To better understand the interplay between lactylation-related genes and immune reactions in PD, we conducted an integrated bioinformatics analysis. Utilizing publicly available PD gene expression datasets, we performed a detailed analysis employing Single-sample Gene Set Enrichment Analysis and Weighted Gene Co-expression Network Analysis. Diagnostic models were constructed using Support Vector Machine (SVM) and LASSO+SVM to evaluate the performance
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid advancement of synthetic biology has enabled the construction of artificial cells that closely mimic the morphology and functionality of their natural counterparts. However, significant limitations remain in engineering artificial cells capable of regulated protein expression. Here, we demonstrate that engineered polymers containing multivalent association motifs can reversibly regulate translational activity through liquid-liquid phase separation (LLPS)-induced protein aggregation, enabling precise temporal control of cell-free protein synthesis (CFPS) activity. This aggregation mec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Neisseria, a gram-negative diplococcus, includes commensal and pathogenic species that infect mucosal tissues, causing diseases such as gonorrhea and meningitis. The type VI secretion system (T6SS), a multifunctional molecular machine that facilitates the ability of gram-negative bacteria to deliver effectors for bacterial competition, virulence, and interaction with host cells, has been widely studied across various bacterial taxa. However, research on the T6SS in the genus Neisseria remains limited. In this study, we employed comparative genomics and pangenomics, among other bioinf
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Broad-spectrum antibiotics target multiple gram-positive and gram-negative bacteria, and can collaterally damage the gut microbiota. Yet, ou … describes recent developments in the field and discusses future study areas that will benefit from systems biology approaches to better understand the mechanistic role of the human gut microbiota in drug actions.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The application and integration of molecular profiling technologies create novel opportunities for personalized medicine. Here, we introduce the Tumor Profiler Study, an observational trial combining a prospective diagnostic approach to assess the relevance of in-depth tumor profiling to support clinical decision-making with an exploratory approach to improve the biological understanding of the disease.
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Limited cutaneous systemic sclerosis-associated pulmonary arterial hypertension (lcSSc-PAH) is a complex multi-system disease with high morbidity and mortality. The purpose of this study is to identify the hub genes and immune characteristics of limited cutaneous systemic sclerosis (lcSSc) and lcSSc-PAH through bioinformatics.
MAIN METHODS: LcSSc-PAH raw data were obtained from the GEO database (GSE19617). Weighted gene Co-expression Network analysis (WGCNA) was used to evaluate key modules. Then, we performed Gene Ontology (GO) terms and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) e
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interruptions in nonlinear wave propagation, commonly referred to as wave breaks, are typical of many complex excitable systems. In the heart they lead to lethal rhythm disorders, the so-called arrhythmias, which are one of the main causes of sudden death in the industrialized world. Progress in the treatment and therapy of cardiac arrhythmias requires a detailed understanding of the triggers and dynamics of these wave breaks. In particular, two very important questions are: 1) What determines the potential of a wave break to initiate re-entry? and 2) How do these breaks evolve such that the s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is a critical need for new tools to investigate the spatio-temporal heterogeneity and phenotypic alterations that arise in the tumor m … establish the foundation of a novel 'cancer atlas' for investigators to develop their own in silico systems biology applications. We expect this hybrid image-based modeling framework to be adaptable for the study of other tissues (e.g. brain, heart) and other vasculature-dependent diseases (e.g. stroke, myocardial infarction).
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Mycobacterium tuberculosis complex includes bovine and human strains of the tuberculosis bacillus, including Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis and the Mycobacterium bovis BCG vaccine strain. M. bovis has evolved from a M. tuberculosis-like ancestor and is the ancestor of the BCG vaccine. The pathogens demonstrate distinct differences in virulence, host range and metabolism, but the role of metabolic differences in pathogenicity is poorly understood. Systems biology approaches have been used to investigate the metabolism of M. tuberculosis, but not to probe differences between…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyglutamine diseases are hereditary neurodegenerative disorders caused by an abnormal expansion of a trinucleotide CAG repeat, which encodes a polyglutamine tract. To date, nine polyglutamine diseases are known: Huntington's disease (HD), spinal and bulbar muscular atrophy (SBMA), dentatorubral-pallidoluysian atrophy (DRPLA) and six forms of spinocerebellar ataxia (SCA). The diseases are inherited in an autosomal dominant fashion except for SBMA, which shows an X-linked pattern of inheritance. Although the causative gene varies with each disorder, polyglutamine diseases share salient genetic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe here the use of nonnegative matrix factorization (NMF), an algorithm based on decomposition by parts that can reduce the dimension of expression data from thousands of genes to a handful of metagenes. Coupled with a model selection mechanism, adapted to work for any stochastic clustering algorithm, NMF is an efficient method for identification of distinct molecular patterns and provides a powerful method for class discovery. We demonstrate the ability of NMF to recover meaningful biological information from cancer-related microarray data. NMF appears to have advantages over other m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования