Proteinase K (ProK) is used for the degradation of proteins in cell lysates to isolate nucleic acids, and for the speciation of proteins for mass spectrometry analysis. In this work, a novel and sensitive immobilization process was developed for examination of protein mixtures by combining MALDI-ToF-MS and nLC-TIMS-ToF-MS/MS systems. To achieve these goals, magnetic nanoparticles (MPs) were prepared via thermal coprecipitation reaction under alkaline condition. The MPs were grafted with a silica layer (i.e., 3-(2,3-epoxypropoxy) propyltrimethoxysilane; EPTES) containing reactive epoxy groups.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer (BCa) is the most common malignancy of the urinary system with high incidence and recurrence rates. There are several ways to detect BCa. However, different approaches have different accuracy, which essentially depends on the sensitivity and specificity of the technique. Alternative noninvasive diagnostic tools for BCa are needed. We isolated and compared urinary cell-pellet DNA (cpDNA), cell-free DNA, and exosomal DNA from patients with localized BCa. Consequently, we analyzed 12 tissues and cpDNA samples by next-generation sequencing and then used bioinformatic tools to analyz
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RESEARCH QUESTION: Does the double freeze-thaw procedure affect embryo quality or clinical outcomes for patients?
DESIGN: A retrospective study was conducted on patients undergoing noninvasive chromosome screening (NICS) from March 2018 to April 2024. Patients were divided into two groups: (1) the double freeze-thaw group, whose cryopreserved blastocysts underwent a second NICS after thawing because the first NICS test failed, and (2) the single freeze-thaw group, whose blastocysts were successfully analysed in the first NICS. The clinical outcomes included the detection success rate of NICS
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates serum cell-free DNA fluctuations in patients with herpes zoster or post-herpetic neuralgia, offering insight into the tissue damage and inflammatory dynamics associated with these conditions. A single-centre combined cross-sectional and longitudinal study was conducted with 59 patients to assess cell-free DNA levels in herpes zoster and post-herpetic neuralgia. Cell-free DNA was extracted from blood samples of patients with herpes zoster or post-herpetic neuralgia and compared with healthy controls. The findings demonstrated elevated cell-free DNA levels in patients wit
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is a leading cause of cancer mortality globally, with particularly high burdens among people living with HIV (PLWH) in low-resource settings like Nigeria. Effective early detection remains a major challenge due to limited access to imaging-based surveillance and the low sensitivity of current biomarkers such as alpha-fetoprotein (AFP). We conducted an epigenome-wide association study (EWAS) of circulating cell-free DNA (ccfDNA) methylation in a Nigerian cohort of HIV-positive individuals (n = 245), spanning HCC, cirrhosis (FibroScan ≥12.3 kPa), fibrosis (FibroSca
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neutrophil extracellular traps (NETs) occur when neutrophil chromatin is decondensed and extruded into the extracellular space in a web-like structure. Originally described as an anti-microbial function, this process has been implicated in the pathogenesis of pancreatic disease. In addition, NETs are upregulated during physiologic wound-healing and coagulation. This study evaluated how the inflammatory response to pancreatic surgery influences NET formation.
METHODS: For this study, 126 patients undergoing pancreatectomy gave consent before participation. Plasma was collected at s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Acute cellular (ACR) and antibody-mediated (AMR) rejection are risk factors for allograft loss in heart transplant (HT) recipients. Endomyocardial biopsy (EMB), although considered the gold standard for rejection surveillance, is invasive and has high interobserver variability. Noninvasive donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA) sampling has a high negative predictive value (NPV) for rejection in adults and is increasingly used in pediatrics. This single center study aimed to test the performance of dd-cfDNA in screening for acute rejection (AR) and donor-specific antibodies (DSAs) in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptomeningeal melanoma metastases (LMM) are associated with poor survival. Diagnosis is based on clinical presentation, brain MRI and cerebrospinal fluid (CSF) analysis. Inconclusive findings at initial presentation can delay treatment. In this single-center case series, detection of BRAFV600- and NRASQ61-mutant cell-free tumor DNA (cfDNA) in CSF was evaluated as a complementary diagnostic biomarker. In 12 patients with clinical suspicion of LMM, a retrospective analysis of MRI, CSF cytology and cfDNA analysis on 1 mL of CSF using the Idylla® platform was carried out. Nine patients displayed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The content of eight different cytokines, cell-free DNA (cfDNA) and cell-free fetal DNA (cffDNA) in women's plasma during preterm birth (PB) was studied. The purpose of this study was to identify the relationships between the investigated factors and determine their prognostic significance.
METHODS: Venous blood samples were collected from 45 women with PB and 35 women with full-term labor at 22-31 and 32-36 weeks of gestation, as well as from 17 women during labor at 39-40 weeks of gestation. The concentration of IL-2, IL-4, IL-6, IL-8, IL-10, GM-CSF, IFN-γ and TNF-α cytokines in pe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Massively parallel sequencing of maternal cell-free DNA (cfDNA) is widely used to test fetal genetic abnormalities in non-invasive prenatal testing (NIPT). However, sequencing-based approaches are still of high cost. Building upon previous knowledge that placenta, the main source of fetal circulating DNA, is hypomethylated in comparison to maternal tissue counterparts of cfDNA, we propose that targeting either unmodified or 5-hydroxymethylated CG sites specifically enriches fetal genetic material and reduces numbers of required analytical sequencing reads thereby decreasing cost of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chorioamnionitis has been linked to spontaneous preterm labor and complications such as neonatal sepsis. We hypothesized that microbial cell-free (cf) DNA would be detectable in maternal plasma in patients with chorioamnionitis and could be the basis for a non-invasive method to detect fetal exposure to microorganisms.
OBJECTIVE: The purpose of this study was to determine whether next generation sequencing could detect microbial cfDNA in maternal plasma in patients with chorioamnionitis.
STUDY DESIGN: Maternal plasma (n = 94) and umbilical cord plasma (n = 120) were collected dur
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Perinatal asphyxia is a severe medical condition resulting from oxygen deficiency (hypoxia) at the time of birth, causing worldwide approximately 680,000 newborn deaths every year. Better prediction of severity of damages including early biomarkers is highly demanded. Elevated levels of circulating cell-free DNA (cfDNA) in blood have been reported for a range of different diseases and conditions, including cancer and prematurity. The objective of this study was to validate methods for assessing cfDNA in blood and cerebrospinal fluid (CSF) and to explore temporal variations in a piglet model of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eosinophilic cystitis is a rare manifestation of hypereosinophilia and a cause of morbidity, including dysuria and hematuria. Although some cases can be attributed to infection or allergy, most cases are assessed to be idiopathic and treated with corticosteroids. However, hypereosinophilia can also be due to actionable clonal molecular alterations in the haematopoietic cells, similar to other myeloproliferative neoplasms. Common mutations associated with eosonophilic syndromes are of platelet-derived growth factor receptor α or β or c-kit, though other pathogenic mutations have been found by n
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Massively parallel sequencing (MPS) technology has become increasingly available and has been widely used to screen for trisomies 21, 18, and 13 in singleton pregnancies. This study assessed the performance of MPS testing of cell-free fetal DNA (cffDNA) from maternal plasma for trisomies 21, 18, and 13 in twin pregnancies. Ninety-two women with twin pregnancies were recruited. The results were identified through karyotypes of amniocentesis or clinical examination and follow-up of the neonates. Fluorescent in-situ hybridization was used to examine the placentas postnatally in cases of false-pos
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the rat testis, the vasopressin gene is transcribed into precursor RNAs that are processed into a number of mature transcripts. One of these transcripts has a structure identical to that of the hypothalamic RNA that encodes the vasopressin prepropeptide, but is present at such low levels that it can only be detected by the polymerase chain reaction. Other vasopressin-like RNAs are derived from differential splicing events that join transcribed sequences between 3 and 9 kilobases upstream of the hypothalamic transcription start site to exons corresponding to II and III of the hypothalamic-ty
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circulating cell-free mitochondrial DNA (ccf-mtDNA) fragments are released into the bloodstream following cell death and are associated with comorbidities seen in people with HIV-1 (PWH). However, ccf-mtDNA dynamics in acute and chronic HIV infection remain unclear.
METHODS: We quantified short and long ccf-mtDNA fragments in serum from 2 cohorts of PWH and people without HIV (PWoH), collected at 1, 3, and 5 years in the first cohort (N = 890) and 1 and 5 years in the second (N = 427). Mixed-effect linear regression models were used to analyze longitudinal associations of ccf-mtDN
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SETTING: and objective: To evaluate the diagnostic utility of Cell-free DNA (Cf-DNA)-based multi-targeted real-time PCR (Mrt-PCR) for diagnosing tuberculous meningitis, the most severe form of extrapulmonary tuberculosis.
DESIGN: A total of 170 cerebrospinal fluid samples (CSF) of tuberculous meningitis [Definite TBM (n = 146), Probable TBM (n = 24)] and 100 non-TB controls were subjected to Cf-DNA Mrt-PCR test using IS6110, IS1081, and nrdZ gene targets. The performance was also evaluated against Truenat MTB Plus assay and GeneXpert MTB/RIF Ultra.
RESULTS: The sensitivity, specificity, posi
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To determine the association between fetal fraction (FF) levels in cell-free fetal DNA (cffDNA) testing and adverse pregnancy outcomes.
METHODS: This retrospective cohort study, conducted at a single center, involved 2063 pregnant women with normal 1st and 2nd trimester non-invasive prenatal test (NIPT) results between 2016 and 2021. Pregnancy outcomes were examined by determining the < 4% and < 5th percentile (3.6%) cut-off values for low fetal fraction (LFF). Pregnancy outcomes were also examined by dividing the FF into population-based quartiles. Adverse pregnancy outcomes were
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study was conducted to evaluate the prognostic value of receptor-interacting protein kinase 4 (RIPK4) in ovarian cancer (OC) and its role in tumorigenesis. RNA expression and the corresponding clinical data were obtained from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Genotype-Tissue Expression (GTEx) databases. The relationship between clinical-pathological characteristics and RIPK4 expression was analyzed using the Wilcoxon signed-rank test and logistic regression. The Cox regression and the Kaplan-Meier method were used to evaluate the relationship between clinicopathological features and over
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purpose: The measurement of mutations in pancreatic juice samples collected from the duodenum during endoscopic ultrasound (EUS) may improve the diagnostic evaluation of patients undergoing pancreatic surveillance. Our aim was to evaluate the accuracy of using pancreatic juice mutation concentrations to predict the presence and histologic grade of neoplasia in the pancreas.Experimental Design: Digital next-generation sequencing (NGS) of pancreatic juice DNA using a targeted 12-gene panel was performed on 67 patients undergoing pancreatic evaluation during EUS, including patients with pancreati
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования