VectorBase (http://www.vectorbase.org/) is a web-accessible data repository for information about invertebrate vectors of human pathogens. VectorBase annotates and maintains vector genomes providing an integrated resource for the research community. Currently, VectorBase contains genome information for two organisms: Anopheles gambiae, a vector for the Plasmodium protozoan agent causing malaria, and Aedes aegypti, a vector for the flaviviral agents causing Yellow fever and Dengue fever.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer is a leading cancer in American women. About 7% of breast cancer is due to inheritance of mutated genes BRCA1 and BRCA2. Numerous investigations have revealed a number of mutations in BRCA1 and BRCA2 genes. The inheritance of the mutated BRCA1 or BRCA2 genes accounts for 45% and 35%, respectively, of hereditary breast cancers. A central database named Breast Cancer Information Core (BIC) has been established in the National Human Genome Research Institute (NHGRI) to coordinate the information related with BRCA1 and BRCA2 research. Nearly half of the mutations (49%) in the BRCA1 g
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: POLG encodes mitochondrial DNA (mtDNA) polymerase γ. Pathogenic POLG variants cause mitochondrial diseases, including progressive external ophthalmoplegia. POLG-related disorders are relatively common in Europe, possibly because of the high prevalence of carriers in the general population, but remain rare in Japan for unclear reasons.
METHODS: We performed long-range PCR on mtDNA from skeletal muscle and/or peripheral blood from 3146 patients with suspected mitochondrial disease between 1993 and 2021. We selected 167 individuals with clinical features suggestive of POLG-related di
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic dysfunction-associated steatohepatitis (MASH), formerly called NASH, is a progressive form of fatty liver disease closely linked to metabolic dysregulation. It has become a leading cause of liver failure and liver transplantation worldwide. Despite its growing clinical significance, there is currently no centralized, publicly accessible, cross-cohort and cross-species transcriptomic database specifically dedicated to MASH. To address this gap, we developed MASH-GA (MASH-Genomic Atlas; https://mashga.com), the first and only database in the fatty liver research field that systematical
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sepsis remains a leading cause of global morbidity and mortality.
OBJECTIVE: To identify candidate biomarkers that may be mechanistically related to the pathogenesis of sepsis.
METHODS: The Gene Expression Omnibus database was leveraged to identify differentially expressed genes (DEGs) between the healthy control and septicemia groups. Genes causally related to sepsis were probed through the integration of GWAS and expression quantitative trait loci (eQTL) data in a two-sample Mendelian randomization (MR) analysis. A set of key sepsis-related genes was then selected based on the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer disease (AD) and Postoperative delirium (POD) may share a common mechanism, but their shared genes and potential novel therapeutic targets remains unknown. We selected datasets GSE48350, GSE4226, and GSE16759 containing AD and control samples from the GEO database for AD model development, and use the GSE63061 dataset for AD model validation. The GSE163943 dataset containing PODs and controls was used to identify common genes. Differentially expressed genes (DEGs) associated with POD and AD respectively, as well as common DEGs between 2 diseases were analyzed. Shared DEGs were assess
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Peroxiredoxin 6 (PRDX6), a potent antioxidant enzyme, has garnered considerable interest for its potential involvement in inflammatory diseases. However, the relationship between PRDX6 and SLE remains poorly understood. This study aims to elucidate the association between PRDX6 and SLE, providing insights into its potential role in disease mechanisms.
METHOD: Gene expression datasets (GSE50772, GSE61635) from the GEO database were merged and batch-corrected (sva, limma). DEGs were identified and SLE-associated gene modules were analyzed by weighted gene co-expression network analy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel disease (IBD) and ankylosing spondylitis (AS) are common autoimmune disorders that have a serious impact on the physical and mental health of patients. Some patients with AS also suffer from IBD, and some studies have shown that there is a link between the 2. However, the causal relationship between the 2 is not clear. This study aimed to infer a causal relationship between IBD and AS using Mendelian randomization (MR) analysis. We obtained genome-wide association study data related to IBD and AS from the Integrative Epidemiology Unit database and the Finnish database to inf
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Characterized as an idiopathic primary myocardial disorder, dilated cardiomyopathy (DCM) predominantly affects children and elderly adults. However, a lack of specific clinical symptoms and reliable biomarkers impedes timely diagnosis and rational clinical management of DCM.
METHODS: Whole-genome expression profiles (GSE120895, GSE9800) were retrieved from the Gene Expression Omnibus database via the GEOquery R package. A series of bioinformatic methods were employed, including DEG, GSVA, WGCNA, GO/KEGG enrichment, PPI, and immune infiltration analysis. Key biomarkers were valid
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-AIDS-defining cancers (NADCs) have emerged as an increasingly prominent cause of non-AIDS-related morbidity and mortality among people living with HIV (PLWH). However, the scarcity of NADC clinical samples, compounded by privacy and security constraints, continues to present formidable obstacles to advancing pathological and clinical investigations. In this study, we adopted a joint analysis strategy and deeply integrated and analyzed transcriptomic data from 12,486 PLWH and cancer patients to systematically identify potential key regulators for 23 NADCs. This effort culminated in NADCdb-a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify potential biomarkers in patients with polycystic ovary syndrome (PCOS) and atherosclerosis, and to explore the common pathologic mechanisms between these two diseases in response to the increased risk of cardiovascular diseases in patients with PCOS.
METHODS: PCOS and atherosclerosis data sets were downloaded from the GEO database, and their differentially expressed genes were identified. Weighted gene co-expression network analysis was used to obtain intersection genes, and then protein-protein interaction and functional enrichment analysis were performed. Machine lear
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent evidence suggests that individuals with polycystic ovary syndrome (PCOS) have an increased risk of developing mental health disorders and comorbidities linked to nervous system dysfunction. Interestingly, patients with schizophrenia (SCZ) often exhibit PCOS symptoms, indicating a possible connection between the two conditions. However, the underlying molecular links between these diseases remain poorly understood. We employed a comprehensive in-silico approach, utilizing publicly available datasets to investigate shared biomarkers candidates and key regulators involved in the developmen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute myeloid leukemia (AML) is one of the most aggressive hematological malignancies, characterized by mutations in progenitor cells that disrupt normal apoptosis and cellular differentiation, leading to the uncontrolled proliferation of immature myeloid blasts. Mutations in oncogenes and tumor suppressor genes play a crucial role in this process by promoting unchecked cell division and compromising regulatory control over the cell cycle. This study aimed to identify microRNAs (miRNAs) that regulate these oncogenes and tumor suppressor genes in AML.
METHOD: We analyzed RNA-seq da
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endometriosis (EMs), a common gynecological disorder, involves complex molecular mechanisms. Metabolic reprogramming (MR) has been recognized as a hallmark of EMs, contributing to lesion survival and immune microenvironment remodeling. This study aimed to identify MR-associated hub genes and pathways associated with EMs through integrated multi-omics analyses.
METHODS: EMs-related datasets were downloaded from the Gene Expression Omnibus database, including training sets (GSE51981 and GSE7305) and validation sets (GSE25628 and GSE141549). MR related genes were retrieved from the G
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Obstructive sleep apnea (OSA) is a prevalent sleep disorder characterized by disrupted breathing patterns and dysfunctions in multiple organ systems. Although studies support a close correlation between OSA and immune function, the broader implications and specific manifestations remain unclear. Therefore, it is pressingly needed to identify potential immune-related markers and elucidate underlying immunological mechanisms of OSA. OSA-related datasets (GSE38792) and immune-related genes were downloaded from the GEO and ImmPort databases and intersected to obtain differentially expressed immune
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Interstitial lung disease (ILD) and gastroesophageal reflux disease (GERD) have complex interactions and can exacerbate severity of each other. This study aimed to screen shared genes between ILD and GERD and explore their common mechanisms and clinical value.
METHODS: We obtained microarray datasets of ILD and GERD from public databases. Shared genes were screened by differential expression analysis and Venn analysis. Hub genes were screened from shared genes using the protein-protein interaction (PPI) network analysis. The ssGSEA algorithm was utilized to estimate immune infiltra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Understanding the impact of gene expression in pathological processes, such as carcinogenesis, is crucial for understanding the biology of cancer and advancing personalised medicine. Yet, current methods lack biologically-informed-omics approaches to stratify cancer patients effectively, limiting our ability to dissect the underlying molecular mechanisms.
RESULTS: To address this gap, we present a novel workflow for the stratification and further analysis of multi-omics samples with matched RNA-Seq data that relies on MSigDB curated gene sets, graph machine learning and ensemble clus
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell death has long been a focal point in life sciences research, and recently, scientists have discovered a novel form of cell death induced by copper, termed cuproptosis. This paper aimed to identify genes associated with cuproptosis in systemic lupus erythematosus (SLE) through machine learning, combined with single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), to screen and validate related genes. The analytical results were then experimentally verified. Two published microarray gene expression datasets (GSE65391 and GSE61635) from SLE and control peripheral blood samples were downloaded from the GEO d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute myocardial infarction (AMI) is a cardiovascular disease featuring the narrowing and hardening of coronary arteries triggered by a combination of factors, which ultimately leads to the death of heart muscle. We retrieved the GSE109048 and GSE123342 datasets from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. After integrating these datasets, we selected 154 module key genes with the help of weighted correlation network analysis (WGCNA). After that, we used protein-protein interaction networks (PPI) analysis to screen out 18 core genes in the protein interaction network from 154 genes. Finall
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования