Cis-regulatory elements (CREs) are noncoding DNA regions regulating cell-type-specific gene expression programs by interacting with distal gene promoters. Here, we aim to decode the function and spatial organization of CRE-promoter interactions in human cardiomyocytes. We analyzed the epigenome and chromatin interactions of human male atrial, ventricular, and failing cardiomyocytes. Atrial and ventricular cardiomyocytes harbored chamber-specific CRE-promoter interactions modulating gene expression as confirmed by functional epigenetic silencing. These CRE-promoter interactions explain the dist
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The biological mechanisms through which most nonprotein-coding genetic variants affect disease risk are unknown. To investigate gene-regulatory mechanisms, we mapped blood gene expression and splicing quantitative trait loci (QTLs) through bulk RNA sequencing in 4,732 participants and integrated protein, metabolite and lipid data from the same individuals. We identified cis-QTLs for the expression of 17,233 genes and 29,514 splicing events (in 6,853 genes). Colocalization analyses revealed 3,430 proteomic and metabolomic traits with a shared association signal with either gene expression or sp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrating analyses of genetically defined cell types with population-level approaches remains poorly explored. We investigated this question by focusing on hippocampal spatial maps and the contribution of two genetically defined pyramidal cell types in the deep and superficial CA1 sublayers. Using single- and dual-color miniscope imaging in mice running along a linear track, we found that population activity from these cells exhibited three-dimensional ring manifolds that encoded the animal position and running direction. Despite shared topology, sublayer-specific manifolds displayed distinc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary open angle glaucoma (POAG) is defined as a "genetically complex trait", where modifying factors act on a genetic predisposing background. For the majority of glaucomatous conditions, DNA variants are not sufficient to explain pathogenesis. Some genes are clearly underlying the more "Mendelian" forms, while a growing number of related polymorphisms in other genes have been identified in recent years. Environmental, dietary, or biological factors are known to influence the development of the condition, but interactions between these factors and the genetic background are poorly understoo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the context of macroevolutionary transitions, environmental changes prompted vertebrates already bearing genetic variations to undergo gradual adaptations resulting in profound anatomical, physiological, and behavioral adaptations. The emergence of new genes led to the genetic variation essential in metazoan evolution, just as was gene loss, both sources of genetic variation resulting in adaptive phenotypic diversity. In this context, F12-coding protein with defense and hemostatic roles emerged some 425 Mya, and it might have contributed in aquatic vertebrates to the transition from water-t
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myoclonic-atonic epilepsy (MAE) is thought to have a genetic etiology. Mutations in CHD2, SLC2A1 and SLC6A1 genes have been reported in few patients showing often intellectual disability prior to MAE onset. We aimed to explore putative causal genetic factors in MAE. We performed array-CGH and whole-exome sequencing in 27 patients. We considered non-synonymous variants, splice acceptor, donor site mutations, and coding insertions/deletions. A gene was causal when its mutations have been already linked to epilepsy or other brain diseases or when it has a putative function in neuronal excitabilit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To report novel electroretinographic findings in a genetically confirmed case of achromatopsia.
METHODS: A patient with a history of childhood nystagmus, photoaversion, and absent color vision was examined. Electroretinography and fundus examination were performed under anesthesia at the time of corrective surgery for nystagmus. Genomic DNA isolated from peripheral blood was directly sequenced for variations in the CNGA3 and CNGB3 genes.
RESULTS: Ophthalmoscopic examination revealed no distinct abnormalities. Electroretinography obtained under anesthesia at age three years revealed
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: We report a case of a woman with diabetes mellitus caused by a genetic defect in ABCC8-coding sulfonylurea receptor 1 (SUR1), a subunit of the ATP-sensitive potassium (KATP) channel protein. She was diagnosed with diabetes at 7 days after birth. After intravenous insulin drip for 1 month, her hyperglycaemia remitted. At the age of 13 years, her diabetes relapsed, and after that she had been treated by intensive insulin therapy for 25 years with relatively poor glycaemic control. She was switched to oral sulfonylurea therapy and attained euglycaemia. In addition, her insulin secreto
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, considerable advances have been made in our understanding of genetics of mammalian gonad development; however, the underlying genetic aetiology in the majority of patients with 46,XY disorders of sex development (DSD) still remains unknown. Based on mouse models, it has been hypothesized that haploinsufficiency of the Friend of GATA 2 (FOG2) gene could lead to 46,XY gonadal dysgenesis on specific inbred genetic backgrounds. Using whole exome sequencing, we identified independent missense mutations in FOG2 in two patients with 46,XY gonadal dysgenesis. One patient carried a non
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To identify the genetic defect associated with autosomal dominant congenital cataract (ADCC) in a Chinese family, in which 11 individuals across four generations are affected with coralliform cataract.
METHODS: Exome sequencing was performed in two of the ADCC-affected family members to scan for potential genetic defects. Sanger sequencing was used to verify these defects in the whole family.
RESULTS: By combining whole exome sequencing and Sanger sequencing, the genetic defect was revealed to be a insertion of a cytosine after coding nucleotide 1,361 (1361insC) in the gap junction
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alport syndrome (AS) is a progressive renal disease characterized by hematuria and progressive renal failure. X-linked dominant AS (XLAS) is the major inheritance form, accounting for almost 80% of the cases, caused by mutations in COL4A5 gene. An accurate genetic diagnosis of AS is very important for genetic counseling and even prenatal diagnosis. In this study we detected mutation of COL4A5 by amplifying the entire coding sequence mRNA of peripheral blood lymphocytes using nested PCR in a Chinese XLAS family, and then performed the first prenatal diagnosis of AS in China. Mutation analysis o
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A fragment of 600 bp of the gene which codes for the surface antigen of hepatitis B virus (HBV) was amplified and sequenced from patients who were born in five states of the Brazilian Amazon (Amazonas, Pará, Acre, Rondônia and Tocantins). A total of 44 sequences were used for the estimation of molecular genetic parameters and phylogenetic analyses. Compared with patients who were asymptomatic, those who had acute hepatitis and chronic liver disease had higher levels of genetic variability and higher rates of nucleotide substitutions. The analysis of transition and transversion substitutions sh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The review presents a concept for the pathogenesis of spontaneous, organ-specific autoimmune diseases that take into account an altered immune regulation, modulating hormonal influences and a genetically determined primary susceptibility of the target organ for the autoimmune attack. The concept is exemplified by means of the Obese strain (OS) chicken model which develops a spontaneous hereditary autoimmune thyroiditis. In respect to the the altered function of the immune system both, MHC associated (Ir) and non-MHC associated genes are involved. The MHC, i.e. a certain haplotype, only plays a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic disorders impacting vision affect millions of individuals worldwide, including age-related macular degeneration (common) and inherited retinal disorders (rare). There is an incomplete understanding of the impact of genetic variation on gene expression in the human retina and its role in genetic disorders. Through the generation of whole genome sequencing and bulk RNA-sequencing of neurosensory retina and retinal pigment epithelium from 201 post-mortem eyes, we uncover common and rare genomic variants shaping retinal expression profiles. This includes 1,483,595 significant cis-expressio
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer remains a major global public health concern, with persistent infection by high-risk human papillomavirus (hrHPV) types recognized as the primary etiological factor. This review explores the multifactorial nature of the disease, focusing on the complex interplay between host genetic susceptibility and epigenetic alterations that drive cervical carcinogenesis. Evidence from genome-wide association studies (GWAS) is discussed, highlighting the contribution of specific genetic loci, predominantly within the HLA region, to susceptibility to HPV infection and disease progression. In
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital hemolytic anemia (CHA) is defined as the premature destruction of red blood cells (RBC) due to congenital or acquired defects. The hereditary form of hemolytic anemia can be divided into hemoglobinopathies, membranopathies, and enzymopathies. Hereditary spherocytosis (HS) is the most common inherited RBC membranopathy leading to congenital hemolytic anemia. To date; five genes have been associated with HS coding for cytoskeleton and transmembrane proteins, those genes are SPTB, SLC4A1, EPB42, ANK1, and SPTA1. Due to genetic heterogeneity, clinical exome sequencing (CES) was performe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
X-linked adrenal hypoplasia congenita (AHC) is caused predominantly by mutations in the NR0B1 (DAX1) gene. Among these, X-linked AHC due to a large deletion of NR0B1 is extremely rare. In Korea, the first case was reported in 2005, and there have been no further documented cases since then. Herein, we report a unique case of X-linked AHC caused by an entire gene deletion that includes the NR0B1 gene and seven other genes. A seven-day-old boy presented to a pediatric endocrine clinic with prolonged postnatal jaundice, skin hyperpigmentation, hyponatremia, and hyperkalemia, suggestive of an adre
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Worldwide distributed coccidiosis is caused by infection of both Eimeria species and Cystoisospora in the host intestine and causes huge economic losses to the livestock industry, especially the poultry industry. The control of such diseases relies mainly on chemoprophylaxis with anticoccidials, which has led to a very common drug resistance in this field. However, the genetic mechanisms underlying resistance to many anticoccidial drugs remain unknown. In this study, strains of E. tenella resistant to 250 mg/kg monensin were generated and characterized. Forward genetic approaches based on pool
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies (GWAS) have identified genetic variants at 34 loci contributing to age-related macular degeneration (AMD)1-3. We generated transcriptional profiles of postmortem retinas from 453 controls and cases at distinct stages of AMD and integrated retinal transcriptomes, covering 13,662 protein-coding and 1,462 noncoding genes, with genotypes at more than 9 million common SNPs for expression quantitative trait loci (eQTL) analysis of a tissue not included in Genotype-Tissue Expression (GTEx) and other large datasets4,5. Cis-eQTL analysis identified 10,474 genes under gen
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitiligo is a skin disease that affects 1% of the population worldwide. Both environmental and genetic factors contribute to the risk of vitiligo. GZMB encodes the enzyme Granzyme B, which plays an important role in cytotoxic T cell-induced apoptosis, and it has been considered one of the candidate genes for vitiligo because of its connections with human immune system. Overall, 3,120 study subjects with Chinese Han ancestry were recruited, and 15 pre-selected SNPs of GZMB were genotyped. Genetic association analyses were performed to evaluate the genetic risk of these SNPs to vitiligo. Further
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.