Helicases often achieve functional specificity through utilization of unique structural features incorporated into an otherwise conserved core. The archaeal Rad3 (xeroderma pigmentosum group D protein (XPD)) helicase is a prototypical member of the Rad3 family, distinct from other related (superfamily II) SF2 enzymes because of a unique insertion containing an iron-sulfur (FeS) cluster. This insertion may represent an auxiliary domain responsible for modifying helicase activity or for conferring specificity for selected DNA repair intermediates. The importance of the FeS cluster for the fine-t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stecrisp from Trimeresurus stejnegeri snake venom belongs to a family of cysteine-rich secretory proteins (CRISP) that have various functions related to sperm-egg fusion, innate host defense, and the blockage of ion channels. Here we present the crystal structure of stecrisp refined to 1.6-angstrom resolution. It shows that stecrisp contains three regions, namely a PR-1 (pathogenesis-related proteins of group1) domain, a hinge, and a cysteine-rich domain (CRD). A conformation of solvent-exposed and -conserved residues (His60, Glu75, Glu96, and His115) in the PR-1 domain similar to that of thei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The sol-gel method of encapsulating proteins in a silica matrix was investigated as a potential experimental system for testing the effects of molecular confinement on the structure and stability of proteins. We demonstrate that silica entrapment (1) is fully compatible with structure analysis by circular dichroism, (2) allows conformational studies in contact with solvents that would otherwise promote aggregation in solution, and (3) generally enhances thermal protein stability. Lysozyme, alpha-lactalbumin, and metmyoglobin retained native-like solution structures following sol-gel encapsulat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The three separate proteins that make up anthrax toxin-protective antigen (PA), edema factor (EF) and lethal factor (LF) act in binary combinations to produce two distinct reactions in experimental animals: edema (PA+EF) and death (PA+LF). PA is believed to interact with a membrane receptor and, after proteolytic processing, to mediate endocytosis and subsequent translocation of EF or LF into the cytosol. Residues W346, M350, and L352 in loop 3 of domain 2 have been implicated to induce a conformational change when the pH is lowered from 7.4 to 6.5. Modification of the residues Trp (346), Met
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fibronectin is an extracellular matrix glycoprotein involved in cell adhesion and migration events in a range of important physiological processes. Aberrant adhesion of cells to the matrix may contribute to the breakdown of normal tissue function associated with various diseases. The adhesive properties of fibronectin may be mediated by its interaction with collagen, the most abundant extracellular matrix protein. The collagen-binding activity of fibronectin has been localized to a 42 kDa proteolytic fragment on the basis of this fragment's affinity for denatured collagen (gelatin)
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ideal lead compounds and candidate drugs with inhibitory effect on BCL2 were screened from ZINC database, which laid a foundation for drug development and compound improvement of drug treatment for diffuse large B-cell lymphoma (DLCBL). Identification of potential BCL2 inhibitors by computer-aided virtual screening. Libdock was applied to 17,931 compounds and the top 20 were selected for further analysis. Selected compounds were performed absorption, distribution, metabolism, and excretion (ADME) and toxicity prediction. The binding affinity between the selected ligands and BCL2 was confirmed
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the cloning, purification and characterization of the full domain of carbonic anhydrase (CA, EC 4.2.1.1) from Plasmodium falciparum, which incorporates 358 amino acid residues (from 181 to 538, in the sequence of this 600 amino acid long protein), called PfCAdom. The enzyme, which belongs to the η-CA class showed the following kinetic parameters: kcat of 3.8×10(5)s(-1) and kcat/Km of 7.2×10(7)M(-1)×s(-1), being 13.3 times more effective as a catalyst compared to the truncated form PfCA. PfCAdom is more effective than the human (h) isoform hCA I, being around 50% less effective compar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Visceral leishmaniasis or kala-azar is caused by the dimorphic parasite Leishmania donovani in the Indian subcontinent. Treatment options for kala-azar are currently inadequate due to various limitations. Currently, drug discovery for leishmaniases is oriented towards rational drug design; the aim is to identify specific inhibitors that target particular metabolic activities as a possible means of controlling the parasites without affecting the host. Leishmania salvages pteridin from its host and reduces it using pteridine reductase 1 (PTR1, EC 1.5.1.33), which makes this reductase an excellen
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Onchocerciasis is a debilitating parasitic disease caused by the filarial worm Onchocerca volvulus. Similar to other helminth parasites, O. volvulus is capable of evading the host's immune responses by a variety of defense mechanisms, including the detoxification activities of the glutathione S-transferases (GSTs). Additionally, in response to drug treatment, helminth GSTs are highly up-regulated, making them tempting targets both for chemotherapy and for vaccine development. We analyzed the three-dimensional x-ray structure of the major cytosolic GST from O. volvulus (Ov-GST2) in complex with
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To date, several pathogenic mutations have been identified in the primary structure of human α-Crystallin, frequently involving the substitution of arginine with a different amino acid. These mutations can lead to the incidence of cataracts and myopathy. Recently, an important cataract-associated mutation has been reported in the functional α-Crystallin domain (ACD) of human αB-Crystallin protein, where arginine 107 (R107) is replaced by a leucine. In this study, we investigated the structure, chaperone function, stability, oligomerization, and amyloidogenic properties of the p.R107L human αB-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel calmodulin-binding protein cmbB from Dictyostelium discoideum is encoded in a single gene. Northern analysis reveals two cmbB transcripts first detectable at 4 h during multicellular development. Western blotting detects an approximately 46.6 kDa protein. Sequence analysis and calmodulin-agarose binding studies identified a "classic" calcium-dependent calmodulin-binding domain (179IPKSLRSLFLGKGYNQPLEF198) but structural analyses suggest binding may not involve classic alpha-helical calmodulin-binding. The cmbB protein is comprised of tandem repeats of a newly identified IP22 motif ([I,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tau protein forms fibrous aggregates in the brain of patients with Alzheimer's disease. This type of aggregation in vitro is promoted efficiently by polyanions and anionic micelles. Here, we report another cosolvent system that induces the fibrous aggregation of human tau four-repeat domain (tau4RD). The protein aggregation was primarily achieved by a nonanionic agent 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-propanol (HFIP), while the ionic condition was modified by inorganic salts. The aggregation analysis by three spectroscopic methods revealed a two-phase kinetics of the aggregation of tau4RD in the presen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PiTX-K alpha, a 35-residue peptide recently isolated from the venom of Pandinus imperator, blocks the rapidly inactivating (A-type) K+ channel(s) in rat brain synaptosomes and the cloned Kv 1.2 potassium channel at very low toxin concentrations (6 nM and 32 pM, respectively) [Rogowski, R. S., Collins, J. H., O'Neil, T. J., Gustafson, T. A., Werkman, T. A., Rogawski, M. A., Tenenholz, T. C., Weber, D. J., & Blaustein, M. P. (1996) Mol. Pharmacol. 50, 1167-1177]. The three-dimensional structure of PiTX-K alpha was determined using NMR spectroscopy in order to understand its selectivity and affin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the OCRL1 gene result in the oculocerebrorenal syndrome of Lowe, with symptoms including congenital bilateral cataracts, glaucoma, renal failure, and neurological impairments. OCRL1 encodes an inositol polyphosphate 5-phosphatase which preferentially dephosphorylates phosphatidylinositide 4,5 bisphosphate (PI(4,5)P2). We have identified two novel mutations in two unrelated Lowe syndrome patients with congenital glaucoma. Novel deletion mutations are detected at c.739-742delAAAG in Lowe patient 1 and c.1595-1631del in Lowe patient 2. End stage glaucoma in patient 2 resulted in the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inhibitor cystine knots (ICKs) are a family of structural peptides with a large number of cysteine residues that form intramolecular disulfide bonds, resulting in a knot. These peptides are involved in a variety of biological functions including predation and defense, and are found in various species, such as spiders, scorpions, sea anemones, and plants. The Loxosceles intermedia venom gland transcriptome identified five groups of ICK peptides that represent more than 50 % of toxin-coding transcripts. Here, we describe the molecular cloning of U2-Sicaritoxin-Lit2 (U2-SCRTX-Lit2), bioinformatic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Estrogen receptor α (ERα) acts as a transcription factor by virtue of the ability of its DNA-binding (DB) domain, comprised of a tandem pair of zinc fingers, to recognize the estrogen response element within the promoters of target genes. Herein, using an array of biophysical methods, we probe the structural consequences of the replacement of zinc within the DB domain of ERα with various environmental metals and their effects on the thermodynamics of binding to DNA. Our data reveal that whereas the DB domain reconstituted with divalent ions of zinc, cadmium, mercury, and cobalt binds to DNA wi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increased interest in chemical cross-linking for probing protein structure and interaction has led to a large increase in literature describing new cross-linkers and search programs. However, this has not led to a corresponding increase in the analysis of large and complex proteins. A major obstacle is that the new cross-linkers are either not readily available and/or have a low reactivity. In combination with aging search programs that are slow and have low sensitivity, or new search programs that are described but not released, these efforts do little to advance the field of cross-linkin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have previously shown that when annexin V is present during the execution of a cell death program, apoptosis is delayed. This is reflected by the inhibition of DNA cleavage and of the release of apoptotic membrane particles, and by reduction of the proteolytic processing of caspase-3. Here, we have studied the mechanism(s) through which annexin V counteracts apoptosis in the human CEM T cell line. The degree of apoptosis inhibition was associated with an increase of intracellular Ca(2+) concentration ([Ca(2+)](i)). Reduction of the extracellular Ca(2+) concentration by EGTA abolished the an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The glycosyl-phosphatidylinositol (GPI)-anchored F3 molecule, a member of the Ig superfamily made up of Ig and FNIII-like domains, is involved in cell-cell adhesion, neuronal pathfinding and fasciculation. Little is known about the mechanism(s) that governs the F3-mediated cell-cell recognition. In particular, it is not known whether F3 transduces signals across the membrane. Here we show that in F3-transfected CHO cells (1A cells) an increase in tyrosine phosphorylation occurs during F3-mediated aggregation. Moreover, under aggregation conditions F3 immunoprecipitated from 32P-metabolically l
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования