Left-handed (Z-form) double-stranded nucleic acid conformers (Z-DNA and Z-RNA, collectively called Z-NA) are molecular patterns recognized by ADAR1 and ZBP1, which are sensor proteins involved in innate immunity. Monoclonal antibodies raised against Z-DNA, such as Z22 and Z-D11, are employed as probes for the study of Z-NAs, but their substrate specificity and functional equivalence remain unclear. Here, we used biochemical, biophysical, and structural approaches to compare the binding modes and target specificies of Z22 and Z-D11, using Z-prone CG-rich dsDNA, dsRNA, and DNA-RNA hybrids as sub
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hypoxia triggers stress, leading to significant alterations in gene expression patterns, which in turn affect fish's growth and development. Real-time quantitative PCR (RT-qPCR) is a pivotal technique for assessing changes in gene expression. However, its accuracy is highly contingent upon the stable expression of reference genes. Ribosomal RNA (18s), β-actin (actb), elongation factor 1-α (ef1a), α tubulin (tuba), and ribosomal protein L17 (rpl17) are the widely used reference genes, but their expression stability in the tissues of black rockfish under hypoxic conditions remains un
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular tools for tissue profiling, such as expression microarrays and real-time PCR, generally require collection of fresh frozen tissues as sources of high-quality RNA. The fragile nature of RNA prompted us to examine the effects of storage time and transport conditions with regard to RNA integrity and gene expression in nonfixed surgical human specimens. At surgery, fresh normal tonsil and colon tissue was cut into pieces and snap frozen. Additional fresh tissue pieces were (i) left at room temperature, (ii) kept on ice, (iii) in normal saline or (iv) in a commercial RNA-stabilizing buffe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmodium falciparum, the primary cause of human malaria, relies on tightly coordinated gene-expression programs to adapt to host-derived stress despite possessing a limited repertoire of canonical transcription factors. Antisense long noncoding RNAs have emerged as important regulators of parasite biology, including virulence gene regulation and sexual commitment; however, their prevalence, origin, and broader functional significance remain poorly understood. Here, we demonstrate that antisense transcription is a widespread, reproducible, and regulated feature of the P. falciparum transcript
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amikacin is a 2-deoxystreptamine aminoglycoside antibiotic possessing a unique l-HABA (l-(-)-γ-amino-α-hydroxybutyric acid) group and applied in the treatment of hospital-acquired infections. Amikacin influences bacterial translation by binding to the decoding region of the small ribosomal subunit that overlaps with the binding site of aminoacylated-tRNA (A-site). Here, we have characterized thermodynamics of interactions of amikacin with a 27-mer RNA oligonucleotide mimicking the aminoglycoside binding site in the bacterial ribosome. We applied isothermal titration and differential scanning c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alchemical free energy calculations are widely used to predict the binding affinity of small molecule ligands to protein targets; however, the application of these methods to RNA targets has not been deeply explored. We systematically investigated how modeling decisions affect the performance of absolute binding free energy calculations for a relatively simple RNA model system: theophylline-binding RNA aptamer with theophylline and five analogs. The goal of this investigation was 2-fold: (1) understanding the performance levels we can expect from absolute free energy calculations for a simple
СтатьяConsensus StatementПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-protein complexes (RNPs) are central regulators of post-transcriptional gene expression and are increasingly implicated in controlling when, where and to what extent specialised (secondary) metabolic pathways operate in plants. Relative to transcription factor-centred regulation, RNPs can modify pathway output rapidly by modulating mRNA processing, stability, localisation and translation, thereby enabling plants to adjust metabolite production on developmentally and environmentally relevant timescales. Many regulatory RNPs assemble into membraneless biomolecular condensates (e.g., stress g
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
YTH N6-methyladenosine RNA binding protein F1 (YTHDF1) enables N6-methyladenosine-containing RNA binding activity, involved in mRNA destabilization and positive regulation of translational initiation. Here we aimed to investigate the main molecular events associated with YTHDF1 during the course of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD). YTHDF1 expression was detected by western blotting and real-time PCR. Ythdf1 hepatocyte-specific knockout mice were generated in this study. RNA sequencing and proteomic analyses were performed to investigate potentially involved mole
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Activity-dependent gene regulation is fundamental to synaptic plasticity, and its disruption is increasingly recognized as a feature of major depressive disorder (MDD). Environmentally driven changes in gene expression can alter neural plasticity in corticolimbic brain regions, yet the post-transcriptional mechanisms linking environmental stress to maladaptive neuronal function remain incompletely understood. RNA epitranscriptomic regulation has recently emerged as an important layer of gene control, with N6-methyladenosine (m6A) representing the most abundant and dynamically reversible intern
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Preeclampsia (PE) causes maternal and perinatal morbidity through defective placental vascularization. Autophagy enhances placental mesenchymal stem/stromal cells (PMSC) proangiogenic properties while autophagy is reduced in PE. Long non-coding RNA GAS5, elevated in PE placenta, suppresses endothelial angiogenesis. N6-methyladenosine (m6A) modification through METTL3 regulates RNA stability and autophagy. However, regulatory mechanisms governing PMSC autophagy in PE remain unclear.
METHOD: Placenta specimens and PMSC from the normal and PE were compared. Molecular analyses include…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epilepsy comprises a heterogeneous group of brain disorders in which recurrent seizures arise from dynamic interactions among neuronal hyperexcitability, glial activation, neuroinflammation, vascular dysfunction, and maladaptive circuit remodeling. Despite advances in genetics, neuroimaging, and molecular profiling, clinically useful biomarkers remain limited, and disease-modifying therapies are still lacking. Noncoding RNAs (ncRNAs) have emerged as an important regulatory layer in epilepsy biology. MicroRNAs, long noncoding RNAs, circular RNAs, transfer RNA fragments, and other ncRNA species
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-based therapeutics are reshaping the treatment landscape for skeletal muscle disorders by enabling modulation of RNA processing or direct correction of disease-causing alleles. In Duchenne muscular dystrophy (DMD), four antisense oligonucleotides-eteplirsen, golodirsen, viltolarsen, and casimersen-have received FDA approval; these phosphorodiamidate morpholino oligomers (PMOs) induce exon skipping to restore the reading frame and enable expression of internally truncated dystrophin. Beyond splice switching, RNA therapeutics include RNase H-active gapmers and steric-blocking antisense oligo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Respiratory diseases impose a substantial global burden; however, early diagnosis, disease-activity monitoring, and the clinical translation of nucleic acid therapeutics are constrained by the lack of robust biomarkers and efficient delivery systems. This narrative review focuses on four classes of RNA-messenger RNA (mRNA), circular RNA (circRNA), small interfering RNA (siRNA), and microRNA (miRNA)-using exosomes as a representative subtype of extracellular vesicles (EVs) to discuss EV biogenesis, transport, uptake, and engineered cargo loading. We summarize the diagnostic and therapeutic appl
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Respiratory virus outbreaks-including severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), influenza A virus (IAV), and influenza B virus (IBV)-posed severe threats to global health and economies, presenting critical challenges for international public health systems that contain highly contagious pathogens. The development of rapid, sensitive, and accurate diagnostic methods is therefore essential. Here, we developed a novel amplification-free detection platform that leverages DNA-RNA hybridization mechanism, utilizing streptavidin-functionalized magnetic beads (SA-MBs) bound to biot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bladder cancer (BCa) ranks among the predominant malignancies affecting the urinary system. Cisplatin (CDDP) remains a cornersto … ated apoptosis. The amplification of circ_104797 in CDDP-resistant cells was attributed to enhanced RNA stability, stemming from an augmented m6A level at a distinct adenosine within circ_104797. Delving deeper, we discerned that circ_104797 functioned as a microRNA reservoir, specifically sequestering miR-103a and miR-660-3p, thereby potentiating cisplatin res …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: SM-like (LSM) genes a family of RNA-binding proteins, are involved in mRNA regulation and can function as oncogenes by altering mRNA stability. However, their roles in B-cell progression and tumorigenesis remain poorly understood.
METHODS: We analyzed gene expression profiles and overall survival data of 123 patients with mantle cell lymphoma (MCL). The LSM index was developed to assess its potential as a prognostic marker of MCL survival.
RESULTS: Five of the eight LSM genes were identified as potential prognostic markers for survival in MCL, with particular emphasis on the LSM.…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circular RNAs (circRNAs) function as crucial regulators in multiple cancers, including hepatocellular carcinoma (HCC). However, the roles of circRNAs in HCC remains largely unknown.
METHODS: circTOLLIP was identified in HCC by screening of two public circRNA microarray datasets and detected in HCC cells and tissues through quantitative real-time PCR (qRT-PCR) and in situ hybridization (ISH). Gain- and loss-of-function assays were performed to confirm the biological effects of circTOLLIP on HCC in vitro and in vivo. Mechanistically, bioinformatics analysis of online databases, MS2-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The use of housekeeping genes (HKG) as internal controls for real-time qPCR studies of gene expression is based on the assumption of their inherent stability. However, it is unclear whether this stability is maintained in disease states. In order to test this, the present study investigated the expression of specific HKG in the endometrium of healthy and polycystic ovarian syndrome (PCOS) women.
METHODS: Endometrial tissue samples were taken from women with PCOS (n= 9) and controls (n= 10). The stability of nine candidate reference genes in the endometrial tissues were evaluated;
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs), small non-coding RNA molecules, have been considered as pivotal regulators of gene expression, influencing many biological functions, including nerve cell development, synaptic plasticity, and inflammatory responses. Their biogenesis involves a multi-step process, beginning with transcription by RNA polymerase II, followed by processing through Drosha and Dicer enzymes, culminating in the formation of mature miRNAs that integrate into the RNA-induced silencing complex [1] to control target messenger RNA (mRNA) stability and translation. In the context of epilepsy, a neurolo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) is one of the leading causes of cancer-related mortality worldwide, largely due to therapeutic resistance and inefficient drug delivery. Here, we report the development of a targeted and biocompatible siRNA delivery platform designed to silence RNA methyltransferase NSUN2, a key regulator of m5C RNA methylation implicated in CRC progression and immune evasion. Poly (lactic acid) (PLA)-based nanoparticles were engineered and functionalized with an RGD peptide for tumor-specific targeting and a cationic KA26 peptide to promote siRNA complexation and cellular internalizati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования