IntroductionHepatocellular carcinoma (HCC) is characterized by a complex tumor microenvironment and limited therapeutic options. Synaptogyrin-2 (SYNGR2), a transmembrane protein, has been implicated in cancer but its comprehensive role in HCC prognosis, immune regulation, and treatment response remains unclear.MethodsMultiomics bioinformatics analysis was performed via RNA-seq data from the TCGA-LIHC cohort. Prognostic value was assessed via Cox regression and Kaplan‒Meier analysis. Immune cell infiltration was estimated via CIBERSORT, and drug sensitivity was predicted via the oncoPredict R p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug resistance continues to be a major challenge in cancer treatment. Understanding cellular and molecular dynamics after treatment is crucial for elucidating resistance mechanisms. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) of paired pre- and post-treatment patient samples enables high-resolution exploration of such dynamics, but rapidly accumulated relevant data bring challenges for easy data access, integration, and reuse. Therefore, we present the Cancer Treatment-related Single-Cell transcriptome DataBase (scCT-DB, http://scctdb.ncpsb.org.cn). scCT-DB has comprehensively collected 266 patien
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tumor immune microenvironment (TIME) shows significant heterogeneity in primary clear cell renal cell carcinoma (ccRCC). As TIME heterogeneity between primary and paired metastatic tumors of ccRCC is less understood, we characterized and compared the TIME of primary ccRCC with paired asynchronous metastases. We analyzed patients who developed ccRCC recurrence post radical nephrectomy and had both primary and metastatic treatment-naïve tissue available. Capture whole-transcriptome sequencing was performed on formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) specimens using the Illumina platform. Diff
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) is a major global health threat, necessitating the development of functional foods with chemopreventive potential. This study aimed to evaluate the modulation of the anticancer activity of Hericium erinaceus with different iron forms (FeCl3, FeSO4, and FeHBED) as it modulates its anticancer activity against HT-29 cells. The extracts were subjected to simulated in vitro digestion and analyzed for cytotoxicity (MTT), antioxidant capacity (DPPH), and morphological changes, alongside high-throughput RT-qPCR profiling of 92 cancer-related genes. The results demonstrated that
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Irinotecan, a standard therapeutic agent for metastatic colorectal cancer (mCRC), often faces significant limitations due to drug resistance, with treatment failure observed in approximately 30%-50% of patients, leading to poor clinical outcomes. This study aims to systematically elucidate the molecular mechanisms underlying irinotecan resistance in colorectal cancer (CRC) by constructing patient-derived organoid (PDO) models combined with single-cell transcriptomics technology.
METHODS: PDO models were successfully established from irinotecan-resistant and sensitive CRC patients.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Glioblastoma (GBM) almost inevitably recurs within 6-12 months after standard temozolomide-radiotherapy (TMZ-RT) treatment, frequently transitioning to aggressive mesenchymal (MES) states through non-genomic transcriptional reprogramming. Mutations in p53/TP53 are frequent in recurrent GBM, disabling its tumor suppressor transcriptional activity. In contrast, the related p53 family member, TP63, is rarely mutated in cancers and has been linked with MES maintenance, stemness, and therapy resistance. However, TP63 exhibits context-dependent tumor-suppressive or oncogenic roles, and i
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: MYCN non-amplified (MYCN-NA) neuroblastoma (NB) demonstrates considerable heterogeneity in both biological and clinical aspects, and its molecular and biological characteristics remain inadequately defined.
METHODS: A comprehensive multi-omics analysis was performed on transcriptome and proteome data from 20 MYCN-NA NB tissues, including 11 low- and intermediate-risk neuroblastoma (LIR-NB) cases and 9 high-risk neuroblastoma (HR-NB) cases. Additionally, the expression levels and survival prognostic significance of key candidate genes were systematically assessed using public datas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Triple-negative breast cancer (TNBC), a highly aggressive subtype of invasive breast cancer, lacks effective therapeutic targets and robust prognostic biomarkers. Lactylation, an emerging post-translational modification, is increasingly recognized for its potential role in tumorigenesis and progression. However, the functional significance of lactylation-related genes (LRGs) in TNBC clinicopathology and prognosis remains poorly defined. METHODS: We employed a combination of differential expression analysis and weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) to identify hub LRG
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although the addition of neoadjuvant immune checkpoint blockade to chemotherapy has improved patient outcome in early triple‑negative breast cancer (TNBC), some patients continue to have poor disease outcomes. METHODS: To characterise neoadjuvant chemotherapy (NAC) resistant cell populations that persist post-NAC, we created a high-resolution single-cell atlas of 129,433 cells from fourteen TNBC patient-derived xenograft (PDX) models with residual disease post-NAC. We identified transcriptionally distinct cancer subpopulations or cell states using unsupervised clustering and charac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to develop and validate a transcriptomic risk signature for uterine corpus endometrial carcinoma (UCEC) and to investigate whether the identified prognostic program reflects immune-tumor uncoupling within the tumor microenvironment. Using transcriptomic data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) UCEC cohort, we identified a 28-gene transcriptomic signature defining a high-risk state. The derived risk score robustly stratified patients into distinct survival groups and remained an independent predictor of overall survival after adjustment for clinical covariates. Functional analy
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to identify and characterize irlncRNAs associated with prognosis and immune modulation in breast cancer. We integrated single-cell RNA sequencing, hdWGCNA, and bulk RNA-seq differential expression analysis results to identify candidate irlncRNAs. The top candidate, SIMALR, was further investigated using immune, survival, mutation analysis, and GSEA. RT-qPCR preliminary validation was performed on patient tissues. SIMALR was linked to favorable survival and enriched in immune pathways, including T-cell receptor signaling, Natural Killer (NK) cell cytotoxicity, and antigen proce
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate adenocarcinoma (PRAD) has substantial recurrence after primary treatment, and reliable prediction is clinically needed. We integrated clinical, genomic, and transcriptomic data to identify recurrence-associated genes, characterize their tumor microenvironmental context, and develop a prognostic model. METHODS: Gene expression and clinical data were obtained from TCGA (training; n = 145) and the GEO dataset GSE54460 (validation; n = 106). Single-cell RNA-seq data were analyzed to resolve gene expression across cell types. Immune infiltration was estimated using ssGSEA and t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Prostate cancer exhibits marked biological heterogeneity, making prognostic stratification essential for therapeutic decision-making. Although many patients with high-risk disease respond to curative treatment, a subset develops biochemical recurrence, highlighting the need for biomarkers capable of early identification of poorer prognosis.
OBJECTIVE: To evaluate the expression of the genes KLK4, KLK14, KLK15, CDH1, SPOP, PTEN, MUC1, TSPAN1, and EZH2 as prognostic biomarkers in patients with high-risk prostate cancer, and to correlate their expression with clinical and pathologi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Paraneoplastic neurological syndromes (PNSs) are rare autoimmune diseases that occur in the context of cancer, but the mechanisms leading to immune tolerance breakdown remain unknown. Breast cancers (BCs) associated with Yo-PNS and Ri-PNS show distinct immune and genetic specificities, suggesting that tumour characteristics may contribute to autoimmunity. Herein, we aimed to investigate whether PNS-associated BCs display additional specificities, including stromal and vascular features that have not been systematically assessed.
METHODS: We compared 12 BCs associated with Yo-PNS (
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bladder cancer remains a significant challenge in oncology owing to its high recurrence rates and limited treatment options, particularly in cases of resistance to standard therapies.
AIMS: Our study aimed to pinpoint a lactylation-associated gene signature capable of predicting prognosis and providing important theoretical support for drug development and precision therapy in bladder cancer patients.
MATERIALS AND METHODS: Leveraging RNA sequencing data from the TCGA and GEO databases, we scrutinized the expression profiles of lactylation-associated genes and pinpointed a signat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The non-tumor tissue adjacent to metastases can appear morphologically unremarkable under a microscope; however, it is exposed to a milieu of secretory factors and proteins derived from tumor cells, stromal cells, and immune cells within the surrounding tumor microenvironment. Studies investigating the peritumoral tissue (PTT) or so-called Normal tissue Adjacent to Tumor tissue (NAT) have identified distinct differences between the genomic and transcriptomic profiles of healthy and tumor-adjacent non-tumor tissues. These alterations are hypothesized to have significant implications in local tu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) remains one of the most lethal malignancies because of its typically late diagnosis and limited treatment options, with surgical resection being the primary intervention. Emerging studies have consistently reported associations between PDAC and metabolic dysfunctions, including obesity, chronic inflammation, and diabetes. In this study, we investigated the molecular interplay between PDAC-associated genes and metabolic disorder pathways.
METHODS: We analysed publicly available bulk RNA-Seq datasets from human and murine adipose tissues, co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ferroptosis is an iron-dependent nonapoptotic form of cell death that links iron, lipid, and glutathione levels to a variety of disease-related activities. However, the characteristics of ferroptosis in cervical carcinoma (CC) are poorly understood. We acquired raw data on CC cohorts from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Key genes were identified using differential gene expression analysis and intersected for further immune infiltration, transcription regulation, gene set variation analysis (GSVA), gene set enrichment analysis (GSEA), and drug sens
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carcinoma showing thymus-like differentiation (CASTLE) is a rare malignancy arising in the thyroid or neck, with an uncertain cellular origin that complicates both diagnosis and treatment. To better understand its molecular underpinnings and identify potential therapeutic avenues, we conducted integrated whole-exome and transcriptome sequencing on six CASTLE and six thymic carcinoma samples. Whole-exome sequencing (WES) was performed on all 12 samples, while RNA sequencing was successful for 1 CASTLE and 6 thymic carcinoma samples. Our analysis included somatic mutation profiling, mutational s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pet dogs spontaneously develop a form of diffuse large B cell lymphoma (DLBCL) that recapitulates many of the features of double hit (MYC/BCL2) human DLBCL. We recently completed a clinical trial in dogs with DLBCL using a combination of canine anti-CD20 antibody and low dose doxorubicin followed by one of three small molecule immune-modulating agents (KPT-9274, TAK-981 or RV1001). Clinical outcomes and tumor specific biomarkers of response from these dogs have been previously reported. In this study, we used the NanoString Canine IO panel to assess dynamic changes in gene counts from peripher
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования